macOS
Homebrew確認済み · 100%
brew install proteinortholocal Homebrew formula metadata
brew
proteinortho を Homebrew, apt でインストール
proteinortho のインストール経路、実行ファイル、メタデータ、AI エージェント向けセキュリティノートを確認します。
インストール
追加のインストールコマンド
Linux
Debian apt確認済み · 92%
sudo apt install proteinorthoDebian stable package indexes · proteinortho · ソース: deb.debian.org
概要
パッケージ概要
Detecting orthologous genes within different species
プロジェクトリンク
コマンドとエイリアス
- proteinortho
- proteinortho2html.pl
- proteinortho2tree.pl
- proteinortho2xml.pl
- proteinortho6.pl
- proteinortho_cleanupblastgraph
- proteinortho_clustering
- proteinortho_compareProteinorthoGraphs.pl
- proteinortho_do_mcl.pl
- proteinortho_extract_from_graph.pl
- proteinortho_ffadj_mcs.py
- proteinortho_formatUsearch.pl
- proteinortho_grab_proteins.pl
- proteinortho_graphMinusRemovegraph
- proteinortho_history.pl
- proteinortho_singletons.pl
- proteinortho_summary.pl
セキュリティ状態
リスクレベル: orange
infrastructure mutation or orchestration signal.
リスク分類器
リスク orange · 信頼度 中 · infrastructure
理由
- infrastructure mutation or orchestration signal
信号
- text:cluster
インストール挙動
- formula メタデータに Homebrew post-install フックは記録されていません。
- Homebrew bottle メタデータは 8 個のプラットフォームターゲットで利用できます。
- 3 件の実行時依存関係とともにインストールされます。
推奨レビュー
エージェントに無人実行させる前に、このツールが平文の認証情報を読むか、リモート状態を書き込むか、成果物を公開するか、プラグインを起動するかを確認してください。
実行可能ファイル
インストールされる実行可能ファイル
| コマンド | 種類 | 公開範囲 | メモ |
|---|---|---|---|
proteinortho | cli | グローバル実行可能ファイル | |
proteinortho2html.pl | cli | グローバル実行可能ファイル | |
proteinortho2tree.pl | cli | グローバル実行可能ファイル | |
proteinortho2xml.pl | cli | グローバル実行可能ファイル | |
proteinortho6.pl | cli | グローバル実行可能ファイル | |
proteinortho_cleanupblastgraph | cli | グローバル実行可能ファイル | |
proteinortho_clustering | cli | グローバル実行可能ファイル | |
proteinortho_compareProteinorthoGraphs.pl | cli | グローバル実行可能ファイル | |
proteinortho_do_mcl.pl | cli | グローバル実行可能ファイル | |
proteinortho_extract_from_graph.pl | cli | グローバル実行可能ファイル | |
proteinortho_ffadj_mcs.py | cli | グローバル実行可能ファイル | |
proteinortho_formatUsearch.pl | cli | グローバル実行可能ファイル | |
proteinortho_grab_proteins.pl | cli | グローバル実行可能ファイル | |
proteinortho_graphMinusRemovegraph | cli | グローバル実行可能ファイル | |
proteinortho_history.pl | cli | グローバル実行可能ファイル | |
proteinortho_singletons.pl | cli | グローバル実行可能ファイル | |
proteinortho_summary.pl | cli | グローバル実行可能ファイル |
鮮度
バージョンと鮮度
これらの信号は、ページ生成時期、パッケージマネージャの活動、上流リリース比較を分けて示します。バージョン遅れは、証拠 URL と比較可能なバージョンがある場合だけ警告されます。
ページ生成日2026-07-08
マネージャ版6.3.6
マネージャ更新日2026-06-25
ローカルデータOK
上流not checked
検出された最新未検出
https://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho
- 情報Release/tag comparison is only available for GitHub repositories.https://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho信頼度 none
インストールメタデータ
パッケージメタデータ
| パッケージキー | brew:proteinortho |
|---|---|
| バージョン | 6.3.6 |
| パッケージマネージャ | Homebrew |
| パッケージマネージャページ | https://formulae.brew.sh/formula/proteinortho |
| ホームページ | https://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho |
| リポジトリ | https://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho |
| 上流ドキュメント | https://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho#readme |
| ライセンス | GPL-3.0-or-later |
| ソースアーカイブ | https://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho/-/archive/v6.3.6/proteinortho-v6.3.6.tar.gz |
| 最終更新 | 2026-06-25T13:38:03+02:00 |
| Pulse | updated |
| 依存関係 | diamond, libomp, openblas |
| Bottle | 利用可能 (対象 arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, arm64_ventura, sonoma, ventura, x86_64_linux) |
| Homebrew post-install | 未定義 |
| サービス | 宣言なし |
レジストリ情報
ソースデータベース詳細
| Source Database | Homebrew formula API |
|---|---|
| Tap | homebrew/core |
| Full Name | proteinortho |
| Version Scheme | 0 |
| Revision | 0 |
| Bottle Stable Root URL | https://ghcr.io/v2/homebrew/core |
| Deprecated | no |
| Disabled | no |
| Keg Only | no |
| URL Keys |
|
ソースデータベース一致
他のパッケージマネージャ記録
一致は外部パッケージマネージャインデックスから取得され、ローカルの Automic Vault パッケージリンクとは分けて表示されます。
Debian apt95%
proteinortho 6.3.1+dfsg-1
Detection of (Co-)orthologs in large-scale protein analysis
https://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho
sudo apt install proteinortho- Section: science
- Architecture: amd64
- 10 依存関係
- normalized package name match
- 一致条件: Proteinortho
Ubuntu apt95%
proteinortho 6.3.1+dfsg-1
Detection of (Co-)orthologs in large-scale protein analysis
https://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho
sudo apt install proteinortho- Section: universe/science
- Architecture: amd64
- 10 依存関係
- normalized package name match
- 一致条件: Proteinortho
ソース経路
リポジトリデータから生成
このページは scripts/generate-pkg-sqlite.py が生成した非公開のパッケージ SQLite アーティファクトから av-web によって提供されます。
Combined YAML source
View the package source record on GitHub.
使用ソース
- Geiger risk classifier
- Nucleus package database
- av.db category and tag curation
- cross-ecosystem install command graph
- external package-manager database matches
- package relationship graph
- package version freshness
- package-page enrichment