macOS
Homebrew
確認済み · 100%
brew install bioperl
local Homebrew formula metadata
brew パッケージインテリジェンス
bioperl をインストール
bioperl のインストール経路、実行ファイル、メタデータ、AI エージェント向けセキュリティノートを確認します。
インストール
Automic Vault でインストール
Automic Vault
sudo av install brew:bioperlLinux
Debian apt
確認済み · 92%
sudo apt install bioperl
Debian stable package indexes · bioperl · ソース: deb.debian.org
パッケージマネージャソース
プラットフォームノート
- パッケージ固有のプラットフォームノートはありません。
概要
パッケージ概要
Automic Vault は、bioperl のパッケージ固有のインストール経路、実行可能ファイル情報、セキュリティメタデータをローカルパッケージデータから公開します。
ホームページ
コマンドとエイリアス
- bp_aacomp
- bp_bioflat_index
- bp_biogetseq
- bp_dbsplit
- bp_extract_feature_seq
- bp_fastam9_to_table
- bp_fetch
- bp_filter_search
- bp_find-blast-matches
- bp_gccalc
- bp_genbank2gff3
- bp_index
- bp_local_taxonomydb_query
- bp_make_mrna_protein
- bp_mask_by_search
- bp_mrtrans
- bp_mutate
- bp_nexus2nh
- bp_nrdb
- bp_oligo_count
- bp_process_gadfly
- bp_process_sgd
- bp_revtrans-motif
- bp_search2alnblocks
- bp_search2gff
- bp_search2table
- bp_search2tribe
- bp_seq_length
- bp_seqconvert
- bp_seqcut
- bp_seqpart
- bp_seqret
ソース概要
Perl tools for bioinformatics, genomics and life science
セキュリティ状態
リスクレベル: green
narrow executable package without higher-risk signals.
リスク分類器
green リスク · low 信頼度 · appliance
理由
- narrow executable package without higher-risk signals
信号
- metadata:no-higher-risk-signals
インストール挙動
- No Homebrew post-install hook is recorded in formula metadata.
- Homebrew bottle metadata is available for 6 platform targets.
- ビルドメタデータには 1 件のビルド依存関係があります。
推奨レビュー
エージェントに無人実行させる前に、このツールが平文の認証情報を読むか、リモート状態を書き込むか、成果物を公開するか、プラグインを起動するかを確認してください。
実行可能ファイル
インストールされる実行可能ファイル
| コマンド | 種類 | 公開範囲 | メモ |
|---|---|---|---|
bp_aacomp | cli | global executable | |
bp_bioflat_index | cli | global executable | |
bp_biogetseq | cli | global executable | |
bp_dbsplit | cli | global executable | |
bp_extract_feature_seq | cli | global executable | |
bp_fastam9_to_table | cli | global executable | |
bp_fetch | cli | global executable | |
bp_filter_search | cli | global executable | |
bp_find-blast-matches | cli | global executable | |
bp_gccalc | cli | global executable | |
bp_genbank2gff3 | cli | global executable | |
bp_index | cli | global executable | |
bp_local_taxonomydb_query | cli | global executable | |
bp_make_mrna_protein | cli | global executable | |
bp_mask_by_search | cli | global executable | |
bp_mrtrans | cli | global executable | |
bp_mutate | cli | global executable | |
bp_nexus2nh | cli | global executable | |
bp_nrdb | cli | global executable | |
bp_oligo_count | cli | global executable | |
bp_process_gadfly | cli | global executable | |
bp_process_sgd | cli | global executable | |
bp_revtrans-motif | cli | global executable | |
bp_search2alnblocks | cli | global executable | |
bp_search2gff | cli | global executable | |
bp_search2table | cli | global executable | |
bp_search2tribe | cli | global executable | |
bp_seq_length | cli | global executable | |
bp_seqconvert | cli | global executable | |
bp_seqcut | cli | global executable | |
bp_seqpart | cli | global executable | |
bp_seqret | cli | global executable | |
bp_seqretsplit | cli | global executable | |
bp_split_seq | cli | global executable | |
bp_sreformat | cli | global executable | |
bp_taxid4species | cli | global executable | |
bp_taxonomy2tree | cli | global executable | |
bp_translate_seq | cli | global executable | |
bp_tree2pag | cli | global executable | |
bp_unflatten_seq | cli | global executable |
鮮度
バージョンと鮮度
これらの信号は、ページ生成時期、パッケージマネージャの活動、上流リリース比較を分けて示します。バージョン遅れは、証拠 URL と比較可能なバージョンがある場合だけ警告されます。
ページ生成日2026-05-26
マネージャ版1.7.8
マネージャ更新日2026-04-20
ローカルデータok
上流not checked
検出された最新未検出
- info Release/tag comparison is only available for GitHub repositories. https://bioperl.org none 信頼度
インストールメタデータ
パッケージメタデータ
| パッケージキー | brew:bioperl |
|---|---|
| バージョン | 1.7.8 |
| パッケージマネージャ | Homebrew |
| パッケージマネージャページ | https://formulae.brew.sh/formula/bioperl |
| ホームページ | https://bioperl.org |
| 上流ドキュメント | https://bioperl.org |
| ライセンス | Artistic-1.0-Perl OR GPL-1.0-or-later |
| ソースアーカイブ | https://cpan.metacpan.org/authors/id/C/CJ/CJFIELDS/BioPerl-1.7.8.tar.gz |
| 更新 | 2026-04-20T03:46:02Z |
| Pulse | updated |
| ビルド依存関係 | pkgconf |
| macOS 提供ライブラリ | expat, libxml2, perl |
| Bottle | 利用可能 (arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux) |
| Homebrew post-install | 未定義 |
| サービス | 宣言なし |
ソース経路
リポジトリデータから生成
このページは scripts/generate-pkg-pages.py によって書かれます。www/pkg/ がローカルパッケージデータに対して古い場合、デプロイは公開を拒否します。
使用ソース
- Geiger risk classifier
- Nucleus package database
- cross-ecosystem install command graph
- package relationship graph
- package version freshness
- package-page enrichment