インストール

追加のインストールコマンド

macOS

Homebrew確認済み · 100%

brew install btllib

local Homebrew formula metadata

Linux

Debian apt確認済み · 92%

sudo apt install btllib-tools

Debian stable package indexes · btllib-tools · ソース: deb.debian.org

概要

パッケージ概要

Bioinformatics Technology Lab common code library

プロジェクトリンク

コマンドとエイリアス

indexlr
mi_bf_generate
randseq

履歴

プロジェクトの歴史と使われ方

btllib is the Bioinformatics Technology Lab common code library, implemented in C++ with Python wrappers for genomic sequence processing. It packages reusable sequence I/O, hashing, Bloom-filter, and related components used by BTL/Birol Lab bioinformatics tools.

プロジェクトの歴史

The public git history starts in July 2019 with licensing, CI, and sequence-code commits. By 2020 the project had v1.0.0 tags, and it continued active releases through at least v1.7.8 in 2026.

The README presents btllib as a C++ library with Python wrappers, Linux and macOS support, Meson/Ninja builds, generated wrappers, Doxygen documentation, and generated executables installed under the package prefix.

採用の歴史

The README recommends Conda/Bioconda for users, while Homebrew, Debian, and Ubuntu packaging in the input show that btllib also entered general system package collections. Its JOSS publication in 2022 gave the project a citable software record for research use.

btllib is less a user-facing CLI than a packaged scientific dependency: package managers make its headers, static library, Python wrappers, and helper executables available to bioinformatics pipelines.

使われ方

Developers link C++ code against libbtllib, include btllib headers, or import the generated Python wrappers. Runtime workflows can rely on external tools such as SAMtools and compression utilities, and btllib-generated executables are installed under the package prefix's bin directory.

パッケージ好きにとっての重要性

btllib matters in package history because it is research infrastructure: a shared lab library that crossed from source builds into Bioconda, Homebrew, Debian, and Ubuntu, while carrying a formal software citation through JOSS.

タイムライン

2019: Public repository history starts with license, CI, and sequence-code setup.
2020: v1.0.0 appears in git history.
2022: JOSS publishes the btllib software paper.
2026: v1.7.8 appears in git history.

Related projects

The README credits ntHash, MIBloomFilter, aaHash, cpptoml, and sdsl-lite components or dependencies.
The README documents SAMtools and compression tools as runtime dependencies for particular file formats and workflows.
Bioconda is the recommended user installation channel in the README.

ソース

JOSS page records the 2022 paper 'btllib: A C++ library with Python interface for efficient genomic sequence processing': https://joss.theoj.org/papers/10.21105/joss.04720
Local git history from https://github.com/bcgsc/btllib shows first commits in 2019, v1.0.0 in 2020, and v1.7.8 in 2026.
Official README describes btllib as a Bioinformatics Technology Lab common code library in C++ with Python wrappers: https://raw.githubusercontent.com/bcgsc/btllib/master/README.md
Official README documents Conda/Bioconda installation, C++ linking, Python wrappers, executables, developer commands, credits, and citation instructions: https://raw.githubusercontent.com/bcgsc/btllib/master/README.md
Package-manager adoption from source_facts.package-manager.

セキュリティ状態

リスクレベル: グリーン

library-like package without higher-risk signals.

リスク分類器

リスクグリーン · 信頼度低 · appliance

理由

library-like package without higher-risk signals

信号

metadata:library-like

インストール挙動

formula メタデータに Homebrew post-install フックは記録されていません。
Homebrew bottle メタデータは 6 個のプラットフォームターゲットで利用できます。
1 件の実行時依存関係とともにインストールされます。
ビルドメタデータには 4 件のビルド依存関係があります。

推奨レビュー

エージェントに無人実行させる前に、このツールが平文の認証情報を読むか、リモート状態を書き込むか、成果物を公開するか、プラグインを起動するかを確認してください。

実行可能ファイル

インストールされる実行可能ファイル

コマンド	種類	公開範囲
`indexlr`	cli	グローバル実行可能ファイル
`mi_bf_generate`	cli	グローバル実行可能ファイル
`randseq`	cli	グローバル実行可能ファイル

鮮度

バージョンと鮮度

これらの信号は、ページ生成時期、パッケージマネージャの活動、上流リリース比較を分けて示します。バージョン遅れは、証拠 URL と比較可能なバージョンがある場合だけ警告されます。

ページ生成日2026-07-08

マネージャ版1.7.8

マネージャ更新日2026-07-04

ローカルデータOK

上流not checked

検出された最新未検出

https://github.com/BirolLab/btllib

情報No cached GitHub release or tag data was available.https://github.com/BirolLab/btllib信頼度 none

インストールメタデータ

パッケージメタデータ

パッケージキー	brew:btllib
バージョン	1.7.8
パッケージマネージャ	Homebrew
パッケージマネージャページ	https://formulae.brew.sh/formula/btllib
ホームページ	https://github.com/BirolLab/btllib
リポジトリ	https://github.com/BirolLab/btllib
上流ドキュメント	https://birollab.github.io/btllib
ライセンス	GPL-3.0-or-later
ソースアーカイブ	https://github.com/BirolLab/btllib/releases/download/v1.7.8/btllib-1.7.8.tar.gz
最終更新	2026-07-04T16:53:42+09:00
Pulse	updated
依存関係	libomp
ビルド依存関係	cmake, meson, ninja, python@3.14
Bottle	利用可能 (対象 arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
Homebrew post-install	未定義
サービス	宣言なし

レジストリ情報

ソースデータベース詳細

Source Database	Homebrew formula API
Tap	homebrew/core
Full Name	btllib
Version Scheme	0
Revision	0
Bottle Stable Root URL	https://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecated	no
Disabled	no
Keg Only	no
URL Keys	stable

ソースデータベース一致

他のパッケージマネージャ記録

一致は外部パッケージマネージャインデックスから取得され、ローカルの Automic Vault パッケージリンクとは分けて表示されます。

Debian apt95%

btllib-tools 1.7.5+dfsg-2

Bioinformatics Technology Lab common code library tools

https://github.com/bcgsc/btllib

sudo apt install btllib-tools

Section: science
Architecture: amd64
Source Package: btllib
7 依存関係
normalized package name match
一致条件: Btllib

Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: btllib-tools from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz

Debian apt95%

libbtllib-dev 1.7.5+dfsg-2

Bioinformatics Technology Lab common code library

https://github.com/bcgsc/btllib

sudo apt install libbtllib-dev

Section: libdevel
Architecture: amd64
Source Package: btllib
3 依存関係
1 任意依存関係
normalized package name match
一致条件: Btllib

Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: libbtllib-dev from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz

Ubuntu apt95%

btllib-tools 1.4.10+dfsg-1ubuntu2

Bioinformatics Technology Lab common code library tools

https://github.com/bcgsc/btllib

sudo apt install btllib-tools

Section: universe/science
Architecture: amd64
Source Package: btllib
5 依存関係
normalized package name match
一致条件: Btllib

Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: btllib-tools from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz

Ubuntu apt95%

libbtllib-dev 1.4.10+dfsg-1ubuntu2

Bioinformatics Technology Lab common code library

https://github.com/bcgsc/btllib

sudo apt install libbtllib-dev

Section: universe/libdevel
Architecture: amd64
Source Package: btllib
3 依存関係
1 任意依存関係
normalized package name match
一致条件: Btllib

Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: libbtllib-dev from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz

パッケージグラフ

リンクは、ローカルのパッケージ関係グラフ、補足データ、依存関係、エコシステム一致、パッケージハブ所属から来ています。

ソース経路

リポジトリデータから生成

このページは scripts/generate-pkg-sqlite.py が生成した非公開のパッケージ SQLite アーティファクトから av-web によって提供されます。

Combined YAML source

View the package source record on GitHub.

combined/btllib.yml

使用ソース

Geiger risk classifier
Nucleus package database
av.db category and tag curation
cross-ecosystem install command graph
curated package history
external package-manager database matches
package relationship graph
package version freshness
package-page enrichment

btllib を Homebrew, apt でインストール

追加のインストールコマンド

macOS

Linux

パッケージ概要

プロジェクトリンク

コマンドとエイリアス

プロジェクトの歴史と使われ方

プロジェクトの歴史

採用の歴史

使われ方

パッケージ好きにとっての重要性

タイムライン

Related projects

ソース

リスクレベル: グリーン

リスク分類器

理由

信号

インストール挙動

推奨レビュー

インストールされる実行可能ファイル

バージョンと鮮度

パッケージメタデータ

ソースデータベース詳細

他のパッケージマネージャ記録

内部パッケージリンク

トピック別ハブ

関連ツール

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エージェント安全ガイド

リポジトリデータから生成

Combined YAML source

使用ソース