インストール

追加のインストールコマンド

macOS

Homebrew確認済み · 100%

brew install biodiff

local Homebrew formula metadata

Linux

Nix確認済み · 92%

nix profile install nixpkgs#biodiff

nixpkgs package indexes · pkgs/by-name/bi/biodiff/package.nix · ソース: api.github.com

Arch Linux pacman確認済み · 92%

sudo pacman -S biodiff

Arch Linux sync databases · biodiff · ソース: geo.mirror.pkgbuild.com

openSUSE zypper確認済み · 92%

sudo zypper install biodiff

openSUSE Tumbleweed package metadata · biodiff · ソース: download.opensuse.org

Windows

Scoop確認済み · 92%

scoop install main/biodiff

Scoop official bucket manifest trees · bucket/biodiff.json · ソース: api.github.com

Windows Package Manager確認済み · 92%

winget install --id 8051Enthusiast.biodiff -e

Windows Package Manager source index · 8051Enthusiast.biodiff · ソース: cdn.winget.microsoft.com

概要

パッケージ概要

Hex diff viewer using alignment algorithms from biology

プロジェクトリンク

コマンドとエイリアス

biodiff
git-biodiff

履歴

プロジェクトの歴史と使われ方

biodiff is an interactive binary diff viewer that borrows biological sequence-alignment algorithms to line up similar regions of two binary files.

プロジェクトの歴史

The 8051Enthusiast/biodiff repository was created in May 2021. The README describes the tool as a binary diff viewer that displays two files side by side, pads missing bytes, and uses alignment algorithms from WFA2 or rust-bio, libraries normally associated with DNA sequence alignment.

採用の歴史

biodiff reached a 1.0.0 release in February 2022 and a 1.2.x series in April 2024. The input package metadata lists Homebrew, Nix, Arch/pacman, Scoop, Winget, and openSUSE/zypper, showing adoption across Unix, Windows package-manager, and Rust-adjacent channels.

使われ方

Users run `biodiff file_a file_b` for a terminal hex view, then switch between unaligned and aligned views, align regions near the cursor, do global or semiglobal alignment for smaller inputs, and optionally print diffs directly with `biodiff --print`.

The README notes that global alignment has quadratic time and space costs and is not a good fit for large files, which is a useful package-level expectation for people comparing firmware chunks or binary formats.

パッケージ好きにとっての重要性

biodiff is interesting because it smuggles a bioinformatics idea into reverse-engineering tooling. The package name is literal: binary diffing improved by sequence alignment.

タイムライン

2021: Repository created and first v0.1.2 release published.
2022: v1.0.0 released.
2023: v1.1.0 released.
2024: v1.2.1 released.

Related projects

biodiff is related to WFA2-lib, rust-bio, cursive, hex viewers, binary diff tools, and `git difftool` workflows through its `git-biodiff` executable.

ソース

https://github.com/8051Enthusiast/biodiff
https://github.com/8051Enthusiast/biodiff/releases
https://raw.githubusercontent.com/8051Enthusiast/biodiff/main/README.md
source_facts.package-manager

セキュリティ状態

リスクレベル: グリーン

narrow executable package without higher-risk signals.

リスク分類器

リスクグリーン · 信頼度低 · appliance

理由

narrow executable package without higher-risk signals

信号

metadata:no-higher-risk-signals

インストール挙動

formula メタデータに Homebrew post-install フックは記録されていません。
Homebrew bottle メタデータは 10 個のプラットフォームターゲットで利用できます。
ビルドメタデータには 2 件のビルド依存関係があります。

推奨レビュー

エージェントに無人実行させる前に、このツールが平文の認証情報を読むか、リモート状態を書き込むか、成果物を公開するか、プラグインを起動するかを確認してください。

local files

Configuration and credential file locations

These source-backed paths show where this package keeps local settings or durable credentials. Automic Vault can use them as review targets for secret scanning, migration, and command approval.

Configuration files

Config paths the tool may read or write during local use.

Linux: $BIODIFF_CONFIG_DIR/config.json$XDG_CONFIG_HOME/biodiff/config.json~/.config/biodiff/config.json
macOS: $BIODIFF_CONFIG_DIR/config.json~/Library/Application Support/biodiff/config.json
Windows: %BIODIFF_CONFIG_DIR%\config.json%APPDATA%\biodiff\config.json

実行可能ファイル

インストールされる実行可能ファイル

コマンド	種類	公開範囲	メモ
`biodiff`	cli	グローバル実行可能ファイル
`git-biodiff`	cli	グローバル実行可能ファイル

鮮度

バージョンと鮮度

これらの信号は、ページ生成時期、パッケージマネージャの活動、上流リリース比較を分けて示します。バージョン遅れは、証拠 URL と比較可能なバージョンがある場合だけ警告されます。

ページ生成日2026-07-10

マネージャ版1.2.1

マネージャ更新日

ローカルデータOK

上流not checked

情報No package-manager update timestamp was available.信頼度低
情報No cached GitHub release or tag data was available.https://github.com/8051Enthusiast/biodiff信頼度 none

インストールメタデータ

パッケージメタデータ

パッケージキー	brew:biodiff
バージョン	1.2.1
パッケージマネージャ	Homebrew
パッケージマネージャページ	https://formulae.brew.sh/formula/biodiff
ホームページ	https://github.com/8051Enthusiast/biodiff
リポジトリ	https://github.com/8051Enthusiast/biodiff
上流ドキュメント	https://github.com/8051Enthusiast/biodiff#readme
ライセンス	MIT
ソースアーカイブ	https://github.com/8051Enthusiast/biodiff.git
ビルド依存関係	cmake, rust
macOS 提供ライブラリ	llvm
Bottle	利用可能 (対象 arm64_linux, arm64_monterey, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, arm64_ventura, monterey, sonoma, ventura, x86_64_linux)
Homebrew post-install	未定義
サービス	宣言なし

レジストリ情報

ソースデータベース詳細

Source Database	Homebrew formula API
Tap	homebrew/core
Full Name	biodiff
Version Scheme	0
Revision	0
Head Version	HEAD
Bottle Stable Root URL	https://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecated	no
Disabled	no
Keg Only	no
URL Keys	head stable

ソースデータベース一致

他のパッケージマネージャ記録

一致は外部パッケージマネージャインデックスから取得され、ローカルの Automic Vault パッケージリンクとは分けて表示されます。

Nix95%

biodiff

nix profile install nixpkgs#biodiff

normalized package name match
一致条件: Biodiff

nixpkgs package indexes · api.github.com · nixpkgs package indexes: pkgs/by-name/bi/biodiff/package.nix from https://api.github.com/repos/NixOS/nixpkgs/git/trees/master?recursive=1

pacman95%

biodiff 1.2.1-2

Hex diff viewer using alignment algorithms from biology

https://github.com/8051Enthusiast/biodiff

sudo pacman -S biodiff

License: MIT
Architecture: x86_64
2 依存関係
normalized package name match
一致条件: Biodiff

Arch Linux sync databases · geo.mirror.pkgbuild.com · Arch Linux sync databases: biodiff from https://geo.mirror.pkgbuild.com/extra/os/x86_64/extra.db.tar.gz

zypper95%

biodiff 1.2.1-1.3

A tool for binary diffing

https://github.com/8051Enthusiast/

sudo zypper install biodiff

License: MIT
Category: Development/Tools/Other
Architecture: x86_64
Source Package: biodiff
4 依存関係
1 提供
normalized package name match
一致条件: Biodiff

openSUSE Tumbleweed package metadata · download.opensuse.org · openSUSE Tumbleweed package metadata: biodiff from https://download.opensuse.org/tumbleweed/repo/oss/repodata/be8d3611d25469107f32075a1697e69ec57a2b850b42348a658cc671ad5ec2b50760d02c3e59524d50da9a11d5be799bdaffba2e166e8ca8858512e3c0bd665d-primary.xml.zst

Scoop95%

main/biodiff

scoop install main/biodiff

normalized package name match
一致条件: Biodiff

Scoop official bucket manifest trees · api.github.com · Scoop official bucket manifest trees: bucket/biodiff.json from https://api.github.com/repos/ScoopInstaller/Main/git/trees/master?recursive=1

winget95%

8051Enthusiast.biodiff

winget install --id 8051Enthusiast.biodiff -e

normalized package name match
一致条件: Biodiff

Windows Package Manager source index · cdn.winget.microsoft.com · Windows Package Manager source index: 8051Enthusiast.biodiff from https://cdn.winget.microsoft.com/cache/source.msix

パッケージグラフ

リンクは、ローカルのパッケージ関係グラフ、補足データ、依存関係、エコシステム一致、パッケージハブ所属から来ています。

ソース経路

リポジトリデータから生成

このページは scripts/generate-pkg-sqlite.py が生成した非公開のパッケージ SQLite アーティファクトから av-web によって提供されます。

Combined YAML source

View the package source record on GitHub.

combined/biodiff.yml

使用ソース

Geiger risk classifier
Nucleus package database
av.db category and tag curation
cross-ecosystem install command graph
curated configuration and credential file locations
curated package history
external package-manager database matches
package relationship graph
package version freshness
package-page enrichment

biodiff を Homebrew, Nix, pacman, zypper, scoop, winget でインストール