インストール

追加のインストールコマンド

macOS

Homebrew確認済み · 100%

brew install tabixpp

local Homebrew formula metadata

Linux

Debian apt確認済み · 92%

sudo apt install tabix

Debian stable package indexes · tabix · ソース: deb.debian.org

openSUSE zypper確認済み · 92%

sudo zypper install tabix

openSUSE Tumbleweed package metadata · tabix · ソース: download.opensuse.org

概要

パッケージ概要

C++ wrapper to tabix indexer

プロジェクトリンク

コマンドとエイリアス

tabix++

履歴

プロジェクトの歴史と使われ方

tabixpp is a small C++ wrapper around tabix for opening and jumping through tabix-indexed genomics files.

プロジェクトの歴史

The README identifies tabixpp as a wrapper around the tabix project and names Erik Garrison as author. GitHub repository metadata records the public repository creation in May 2011.

採用の歴史

The project is modest but durable: GitHub releases include an initial tagged release in 2015, a Debian-packaging point release in 2019, and later maintenance releases through 2023. The Homebrew input records packaging in Homebrew and maps related distro packages to tabix on Debian, Ubuntu, and openSUSE.

使われ方

The README emphasizes building with the htslib submodule and testing with make. Its value is in C++ code that wants a smaller abstraction over tabix-indexed files rather than invoking tabix directly.

パッケージ好きにとっての重要性

Package maintainers care because tabixpp is a thin compatibility layer in bioinformatics dependency graphs: it pulls in htslib-style native dependencies such as libcurl, zlib, and liblzma, and it is often packaged to satisfy genomics tools that expect the wrapper.

タイムライン

2011: The public GitHub repository was created.
2015: GitHub releases show v1.0.0 as the initial tagged release.
2019: GitHub releases show v1.1.0 as a point release for Debian packaging.
2023: GitHub releases show v1.1.2 published as minor updates.

Related projects

The README links tabix, htslib, libcurl, zlib, and liblzma as related projects or dependencies.

ソース

https://api.github.com/repos/vcflib/tabixpp
https://api.github.com/repos/vcflib/tabixpp/releases
https://github.com/vcflib/tabixpp#readme
input.source_facts.package-manager

セキュリティ状態

リスクレベル: グリーン

narrow executable package without higher-risk signals.

リスク分類器

リスクグリーン · 信頼度低 · appliance

理由

narrow executable package without higher-risk signals

信号

metadata:no-higher-risk-signals

インストール挙動

formula メタデータに Homebrew post-install フックは記録されていません。
Homebrew bottle メタデータは 6 個のプラットフォームターゲットで利用できます。
2 件の実行時依存関係とともにインストールされます。

推奨レビュー

エージェントに無人実行させる前に、このツールが平文の認証情報を読むか、リモート状態を書き込むか、成果物を公開するか、プラグインを起動するかを確認してください。

実行可能ファイル

インストールされる実行可能ファイル

コマンド	種類	公開範囲	メモ
`tabix++`	cli	グローバル実行可能ファイル

鮮度

バージョンと鮮度

これらの信号は、ページ生成時期、パッケージマネージャの活動、上流リリース比較を分けて示します。バージョン遅れは、証拠 URL と比較可能なバージョンがある場合だけ警告されます。

ページ生成日2026-07-10

マネージャ版1.1.2

マネージャ更新日2026-06-25

ローカルデータOK

上流最新

検出された最新v1.1.2

https://github.com/vcflib/tabixpp

OK鮮度警告は生成されていません。

インストールメタデータ

パッケージメタデータ

パッケージキー	brew:tabixpp
バージョン	1.1.2
パッケージマネージャ	Homebrew
パッケージマネージャページ	https://formulae.brew.sh/formula/tabixpp
ホームページ	https://github.com/vcflib/tabixpp
リポジトリ	https://github.com/vcflib/tabixpp
上流ドキュメント	https://github.com/vcflib/tabixpp#readme
ライセンス	MIT
ソースアーカイブ	https://github.com/vcflib/tabixpp/archive/refs/tags/v1.1.2.tar.gz
最終更新	2026-06-25T13:38:09+02:00
Pulse	updated
依存関係	htslib, xz
Bottle	利用可能 (対象 arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
Homebrew post-install	未定義
サービス	宣言なし

レジストリ情報

ソースデータベース詳細

Source Database	Homebrew formula API
Tap	homebrew/core
Full Name	tabixpp
Version Scheme	0
Revision	1
Bottle Stable Root URL	https://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecated	no
Disabled	no
Keg Only	no
URL Keys	stable

ソースデータベース一致

他のパッケージマネージャ記録

一致は外部パッケージマネージャインデックスから取得され、ローカルの Automic Vault パッケージリンクとは分けて表示されます。

Debian apt92%

tabix 1.21+ds-1

generic indexer for TAB-delimited genome position files

https://github.com/samtools/htslib

sudo apt install tabix

Section: science
Architecture: amd64
Source Package: htslib
6 依存関係
installed executable or alias match
一致条件: Tabix

Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: tabix from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz

Ubuntu apt92%

tabix 1.19+ds-1.1build3

generic indexer for TAB-delimited genome position files

https://github.com/samtools/htslib

sudo apt install tabix

Section: universe/science
Architecture: amd64
Source Package: htslib
6 依存関係
installed executable or alias match
一致条件: Tabix

Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: tabix from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz

zypper92%

tabix 1.21-1.3

Generic indexer for TAB-delimited genome position files from the HTSlib project

https://github.com/samtools/htslib/

sudo zypper install tabix

License: MIT
Category: Productivity/Scientific/Other
Architecture: x86_64
Source Package: libhts
10 依存関係
1 提供
installed executable or alias match
一致条件: Tabix

openSUSE Tumbleweed package metadata · download.opensuse.org · openSUSE Tumbleweed package metadata: tabix from https://download.opensuse.org/tumbleweed/repo/oss/repodata/be8d3611d25469107f32075a1697e69ec57a2b850b42348a658cc671ad5ec2b50760d02c3e59524d50da9a11d5be799bdaffba2e166e8ca8858512e3c0bd665d-primary.xml.zst

パッケージグラフ

リンクは、ローカルのパッケージ関係グラフ、補足データ、依存関係、エコシステム一致、パッケージハブ所属から来ています。

ソース経路

リポジトリデータから生成

このページは scripts/generate-pkg-sqlite.py が生成した非公開のパッケージ SQLite アーティファクトから av-web によって提供されます。

Combined YAML source

View the package source record on GitHub.

combined/tabixpp.yml

使用ソース

Geiger risk classifier
Nucleus package database
av.db category and tag curation
cross-ecosystem install command graph
curated package history
external package-manager database matches
package relationship graph
package version freshness
package-page enrichment

tabixpp を Homebrew, apt, zypper でインストール