Automic Vault
brew パッケージインテリジェンス
samtools のインストール経路、実行ファイル、メタデータ、AI エージェント向けセキュリティノートを確認します。
インストール
sudo av install brew:samtoolsbrew install samtools
local Homebrew formula metadata
sudo port install samtools
MacPorts ports tree · science/samtools/Portfile · ソース: api.github.com
sudo apt install samtools
Debian stable package indexes · samtools · ソース: deb.debian.org
sudo dnf install samtools
Fedora Rawhide package metadata · samtools · ソース: dl.fedoraproject.org
nix profile install nixpkgs#samtools
nixpkgs package indexes · pkgs/by-name/sa/samtools/package.nix · ソース: api.github.com
sudo zypper install samtools
openSUSE Tumbleweed package metadata · samtools · ソース: download.opensuse.org
概要
Automic Vault は、samtools のパッケージ固有のインストール経路、実行可能ファイル情報、セキュリティメタデータをローカルパッケージデータから公開します。
Tools for manipulating next-generation sequencing data
セキュリティ状態
narrow executable package without higher-risk signals.
green リスク · low 信頼度 · appliance
エージェントに無人実行させる前に、このツールが平文の認証情報を読むか、リモート状態を書き込むか、成果物を公開するか、プラグインを起動するかを確認してください。
実行可能ファイル
| コマンド | 種類 | 公開範囲 | メモ |
|---|---|---|---|
ace2sam | cli | global executable | |
blast2sam.pl | cli | global executable | |
bowtie2sam.pl | cli | global executable | |
export2sam.pl | cli | global executable | |
fasta-sanitize.pl | cli | global executable | |
interpolate_sam.pl | cli | global executable | |
maq2sam-long | cli | global executable | |
maq2sam-short | cli | global executable | |
md5fa | cli | global executable | |
md5sum-lite | cli | global executable | |
novo2sam.pl | cli | global executable | |
plot-ampliconstats | cli | global executable | |
plot-bamstats | cli | global executable | |
psl2sam.pl | cli | global executable | |
sam2vcf.pl | cli | global executable | |
samtools | cli | global executable | |
samtools.pl | cli | global executable | |
seq_cache_populate.pl | cli | global executable | |
soap2sam.pl | cli | global executable | |
wgsim | cli | global executable | |
wgsim_eval.pl | cli | global executable | |
zoom2sam.pl | cli | global executable |
鮮度
これらの信号は、ページ生成時期、パッケージマネージャの活動、上流リリース比較を分けて示します。バージョン遅れは、証拠 URL と比較可能なバージョンがある場合だけ警告されます。
https://github.com/samtools/samtools
インストールメタデータ
| パッケージキー | brew:samtools |
|---|---|
| バージョン | 1.23.1 |
| パッケージマネージャ | Homebrew |
| パッケージマネージャページ | https://formulae.brew.sh/formula/samtools |
| ホームページ | https://www.htslib.org/ |
| リポジトリ | https://github.com/samtools/samtools |
| 上流ドキュメント | https://www.htslib.org/ |
| ライセンス | MIT |
| ソースアーカイブ | https://github.com/samtools/samtools/releases/download/1.23.1/samtools-1.23.1.tar.bz2 |
| 更新 | 2026-03-18T18:10:04Z |
| Pulse | updated |
| 依存関係 | htslib |
| macOS 提供ライブラリ | ncurses |
| Bottle | 利用可能 (arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux) |
| Homebrew post-install | 未定義 |
| サービス | 宣言なし |
ソース経路
このページは scripts/generate-pkg-pages.py によって書かれます。www/pkg/ がローカルパッケージデータに対して古い場合、デプロイは公開を拒否します。