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Homebrew確認済み · 100%
brew install dxpylocal Homebrew formula metadata
brew
dxpy を Homebrew でインストール
dxpy のインストール経路、実行ファイル、メタデータ、AI エージェント向けセキュリティノートを確認します。
インストール
追加のインストールコマンド
概要
パッケージ概要
DNAnexus toolkit utilities and platform API bindings for Python
プロジェクトリンク
コマンドとエイリアス
- dx-app-wizard
- dx-build-app
- dx-build-applet
- dx-clone-asset
- dx-docker
- dx-download-all-inputs
- dx-fetch-bundled-depends
- dx-generate-dxapp
- dx-jobutil-add-output
- dx-jobutil-dxlink
- dx-jobutil-get-identity-token
- dx-jobutil-new-job
- dx-jobutil-parse-link
- dx-jobutil-report-error
- dx-log-stream
- dx-mount-all-inputs
- dx-notebook-reconnect
- dx-print-bash-vars
- dx-upload-all-outputs
履歴
プロジェクトの歴史と使われ方
dxpy is the Python binding layer and command-line toolkit for the DNAnexus platform. The official Read the Docs page describes dxpy as Python bindings for interacting with the DNAnexus Platform API, both inside the DNAnexus execution environment and from external scripts.
プロジェクトの歴史
The official dx-toolkit git history begins with imported history in 2011 and early repository reorganization in March 2012. Official tags show v0.0.1 on 2012-08-09 and a long continuous release stream through v0.410.0 in June 2026.
採用の歴史
Unlike general-purpose Unix tools, dxpy adoption follows the DNAnexus platform itself: researchers and bioinformatics engineers use it to script platform objects, projects, files, apps, workflows, jobs, and API calls. The batch input exposes this as a Homebrew package with many dx-* executables rather than just a Python library.
使われ方
The official docs organize dxpy around Pythonic bindings, low-level API wrappers, object handlers, projects, records, files, genomic tables, applets, apps, workflows, jobs, search, app building, utilities, and exceptions. In practice the packaged toolkit is used for DNAnexus login/configuration, data movement, applet/app development, job utilities, logging, Docker/Nextflow helper workflows, and scripted platform automation.
パッケージ好きにとっての重要性
dxpy is significant as a packaged scientific-platform SDK: it turns a hosted genomics and biomedical analysis platform into reproducible shell and Python workflows. For package managers, it is a reminder that many science packages are not just libraries but operational CLIs with credentials, cloud objects, and platform-specific execution assumptions.
タイムライン
- 2011: Official git history begins with imported repository history.
- 2012: v0.0.1 tagged and DNAnexus Python docs carry 2012-2013 copyright.
- 2020: v0.300.0 tagged.
- 2023: v0.350.0 tagged.
- 2025: v0.400.0 tagged.
- 2026: v0.410.0 appears in the official changelog and tag list.
Related projects
- dxpy is part of DNAnexus dx-toolkit alongside the dx command family, DNAnexus API documentation, platform documentation, app builders, job utilities, Docker helpers, and Nextflow-related tooling referenced in recent changelog entries.
ソース
セキュリティ状態
保護ツール対応はまだ見つかっていません
dxpy に一致するローカルシークレット処理マニフェストは見つかりませんでした。将来の対応で安定したパッケージ URL を使えるよう、Nucleus パッケージメタデータはここに公開されています。
インストール挙動
- formula メタデータに Homebrew post-install フックは記録されていません。
- Homebrew bottle メタデータは 6 個のプラットフォームターゲットで利用できます。
- 16 件の実行時依存関係とともにインストールされます。
推奨レビュー
エージェントに無人実行させる前に、このツールが平文の認証情報を読むか、リモート状態を書き込むか、成果物を公開するか、プラグインを起動するかを確認してください。
local files
Configuration and credential file locations
These source-backed paths show where this package keeps local settings or durable credentials. Automic Vault can use them as review targets for secret scanning, migration, and command approval.
Configuration files
Config paths the tool may read or write during local use.
- Unix
~/.dnanexus_config/environment.json
Credential files
Credential-bearing paths to review before unattended agent runs.
- Unix
~/.dnanexus_config/environment.json
実行可能ファイル
インストールされる実行可能ファイル
| コマンド | 種類 | 公開範囲 | メモ |
|---|---|---|---|
dx-app-wizard | cli | グローバル実行可能ファイル | |
dx-build-app | cli | グローバル実行可能ファイル | |
dx-build-applet | cli | グローバル実行可能ファイル | |
dx-clone-asset | cli | グローバル実行可能ファイル | |
dx-docker | cli | グローバル実行可能ファイル | |
dx-download-all-inputs | cli | グローバル実行可能ファイル | |
dx-fetch-bundled-depends | cli | グローバル実行可能ファイル | |
dx-generate-dxapp | cli | グローバル実行可能ファイル | |
dx-jobutil-add-output | cli | グローバル実行可能ファイル | |
dx-jobutil-dxlink | cli | グローバル実行可能ファイル | |
dx-jobutil-get-identity-token | cli | グローバル実行可能ファイル | |
dx-jobutil-new-job | cli | グローバル実行可能ファイル | |
dx-jobutil-parse-link | cli | グローバル実行可能ファイル | |
dx-jobutil-report-error | cli | グローバル実行可能ファイル | |
dx-log-stream | cli | グローバル実行可能ファイル | |
dx-mount-all-inputs | cli | グローバル実行可能ファイル | |
dx-notebook-reconnect | cli | グローバル実行可能ファイル | |
dx-print-bash-vars | cli | グローバル実行可能ファイル | |
dx-upload-all-outputs | cli | グローバル実行可能ファイル |
鮮度
バージョンと鮮度
これらの信号は、ページ生成時期、パッケージマネージャの活動、上流リリース比較を分けて示します。バージョン遅れは、証拠 URL と比較可能なバージョンがある場合だけ警告されます。
ページ生成日2026-07-08
マネージャ版0.409.0
マネージャ更新日2026-06-24
ローカルデータOK
上流not checked
検出された最新未検出
https://github.com/dnanexus/dx-toolkit
- 情報No cached GitHub release or tag data was available.https://github.com/dnanexus/dx-toolkit信頼度 none
インストールメタデータ
パッケージメタデータ
| パッケージキー | brew:dxpy |
|---|---|
| バージョン | 0.409.0 |
| パッケージマネージャ | Homebrew |
| パッケージマネージャページ | https://formulae.brew.sh/formula/dxpy |
| ホームページ | https://github.com/dnanexus/dx-toolkit |
| リポジトリ | https://github.com/dnanexus/dx-toolkit |
| 上流ドキュメント | http://autodoc.dnanexus.com/ |
| ライセンス | Apache-2.0 |
| ソースアーカイブ | https://files.pythonhosted.org/packages/d8/cb/c53cbfef4871d8bb5981935c09ef4f669937bfefd467fb5587689e10f38c/dxpy-0.409.0.tar.gz |
| 最終更新 | 2026-06-24T12:47:49Z |
| Pulse | updated |
| 依存関係 | aws-c-auth, aws-c-cal, aws-c-common, aws-c-compression, aws-c-event-stream, aws-c-http, aws-c-io, aws-c-mqtt, aws-c-s3, aws-c-sdkutils, aws-checksums, certifi, cryptography, openssl@3, python@3.14, s2n |
| Bottle | 利用可能 (対象 arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux) |
| Homebrew post-install | 未定義 |
| サービス | 宣言なし |
レジストリ情報
ソースデータベース詳細
| Source Database | Homebrew formula API |
|---|---|
| Tap | homebrew/core |
| Full Name | dxpy |
| Version Scheme | 0 |
| Revision | 0 |
| Conflicts With |
|
| Bottle Stable Root URL | https://ghcr.io/v2/homebrew/core |
| Deprecated | no |
| Disabled | no |
| Keg Only | no |
| URL Keys |
|
ソース経路
リポジトリデータから生成
このページは scripts/generate-pkg-sqlite.py が生成した非公開のパッケージ SQLite アーティファクトから av-web によって提供されます。
Combined YAML source
View the package source record on GitHub.
使用ソース
- Geiger risk classifier
- Nucleus package database
- av.db category and tag curation
- cross-ecosystem install command graph
- curated configuration and credential file locations
- curated package history
- package relationship graph
- package version freshness
- package-page enrichment