Automic VaultAutomic Vault

brew

pymol を Homebrew, apt, dnf, MacPorts, Nix, pacman, winget, zypper でインストール

pymol のインストール経路、実行ファイル、メタデータ、AI エージェント向けセキュリティノートを確認します。

インストール

追加のインストールコマンド

macOS

Homebrew確認済み · 100%
brew install pymol

local Homebrew formula metadata

MacPorts確認済み · 94%
sudo port install pymol

MacPorts ports tree · science/pymol/Portfile · ソース: api.github.com

Linux

Debian apt確認済み · 92%
sudo apt install pymol

Debian stable package indexes · pymol · ソース: deb.debian.org

Fedora dnf確認済み · 92%
sudo dnf install pymol

Fedora Rawhide package metadata · pymol · ソース: dl.fedoraproject.org

Nix確認済み · 92%
nix profile install nixpkgs#pymol

nixpkgs package indexes · pkgs/by-name/py/pymol/package.nix · ソース: api.github.com

Arch Linux pacman確認済み · 92%
sudo pacman -S pymol

Arch Linux sync databases · pymol · ソース: geo.mirror.pkgbuild.com

openSUSE zypper確認済み · 92%
sudo zypper install python311-pymol

openSUSE Tumbleweed package metadata · python311-pymol · ソース: download.opensuse.org

Windows

Windows Package Manager確認済み · 92%
winget install --id Schrodinger.PyMOL -e

Windows Package Manager source index · Schrodinger.PyMOL · ソース: cdn.winget.microsoft.com

概要

パッケージ概要

Molecular visualization system

セキュリティ状態

リスクレベル: グリーン

narrow executable package without higher-risk signals.

リスク分類器

リスク グリーン · 信頼度 低 · appliance

理由

  • narrow executable package without higher-risk signals

信号

  • metadata:no-higher-risk-signals

インストール挙動

  • formula メタデータに Homebrew post-install フックは記録されていません。
  • Homebrew bottle メタデータは 6 個のプラットフォームターゲットで利用できます。
  • 7 件の実行時依存関係とともにインストールされます。
  • ビルドメタデータには 4 件のビルド依存関係があります。

推奨レビュー

エージェントに無人実行させる前に、このツールが平文の認証情報を読むか、リモート状態を書き込むか、成果物を公開するか、プラグインを起動するかを確認してください。

local files

Configuration and credential file locations

These source-backed paths show where this package keeps local settings or durable credentials. Automic Vault can use them as review targets for secret scanning, migration, and command approval.

Configuration files

Config paths the tool may read or write during local use.

Unix
~/.pymolrc~/.pymolrc.py

実行可能ファイル

インストールされる実行可能ファイル

コマンド種類公開範囲メモ
pymolcliグローバル実行可能ファイル

鮮度

バージョンと鮮度

これらの信号は、ページ生成時期、パッケージマネージャの活動、上流リリース比較を分けて示します。バージョン遅れは、証拠 URL と比較可能なバージョンがある場合だけ警告されます。

ページ生成日2026-07-10
マネージャ版3.1.0
マネージャ更新日
ローカルデータOK
上流最新
検出された最新v3.1.0

https://github.com/schrodinger/pymol-open-source

  • 情報No package-manager update timestamp was available.信頼度 低

インストールメタデータ

パッケージメタデータ

パッケージキーbrew:pymol
バージョン3.1.0
パッケージマネージャHomebrew
パッケージマネージャページhttps://formulae.brew.sh/formula/pymol
ホームページhttps://pymol.org/
リポジトリhttps://github.com/schrodinger/pymol-open-source
上流ドキュメントhttps://github.com/schrodinger/pymol-open-source#readme
ライセンスLicenseRef-Homebrew-cannot-represent
ソースアーカイブhttps://github.com/schrodinger/pymol-open-source/archive/refs/tags/v3.1.0.tar.gz
依存関係freetype, glew, libpng, netcdf, numpy, pyqt, python@3.14
ビルド依存関係cmake, glm, msgpack-cxx, python-setuptools
macOS 提供ライブラリlibxml2
Bottle利用可能 (対象 arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
Homebrew post-install未定義
サービス宣言なし
注意点To generate movies, run `brew install ffmpeg`.

レジストリ情報

ソースデータベース詳細

Source DatabaseHomebrew formula API
Taphomebrew/core
Full Namepymol
Version Scheme0
Revision3
Head VersionHEAD
Bottle Stable Root URLhttps://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecatedno
Disabledno
Keg Onlyno
URL Keys
  • head
  • stable

ソースデータベース一致

他のパッケージマネージャ記録

一致は外部パッケージマネージャインデックスから取得され、ローカルの Automic Vault パッケージリンクとは分けて表示されます。

Debian apt95%

pymol 3.1.0+dfsg-1

Molecular Graphics System

https://www.pymol.org

sudo apt install pymol
  • Section: science
  • Architecture: all
  • 1 依存関係
  • 1 任意依存関係
  • normalized package name match
  • 一致条件: Pymol
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: pymol from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz
Debian apt95%

pymol-data 3.1.0+dfsg-1

data files for PyMOL

https://www.pymol.org

sudo apt install pymol-data
  • Section: science
  • Architecture: all
  • Source Package: pymol
  • normalized package name match
  • 一致条件: Pymol
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: pymol-data from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz
Debian apt95%

python3-pymol 3.1.0+dfsg-1

Molecular Graphics System (Python 3 modules)

https://www.pymol.org

sudo apt install python3-pymol
  • Section: python
  • Architecture: amd64
  • Source Package: pymol
  • 19 依存関係
  • normalized package name match
  • 一致条件: Pymol
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: python3-pymol from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz
Nix95%

pymol

nix profile install nixpkgs#pymol
  • normalized package name match
  • 一致条件: Pymol
nixpkgs package indexes · api.github.com · nixpkgs package indexes: pkgs/by-name/py/pymol/package.nix from https://api.github.com/repos/NixOS/nixpkgs/git/trees/master?recursive=1
Ubuntu apt95%

pymol 2.5.0+dfsg-1build6

Molecular Graphics System

https://www.pymol.org

sudo apt install pymol
  • Section: universe/science
  • Architecture: all
  • 1 依存関係
  • 1 任意依存関係
  • normalized package name match
  • 一致条件: Pymol
Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: pymol from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz
Ubuntu apt95%

pymol-data 2.5.0+dfsg-1build6

data files for PyMOL

https://www.pymol.org

sudo apt install pymol-data
  • Section: universe/science
  • Architecture: all
  • Source Package: pymol
  • normalized package name match
  • 一致条件: Pymol
Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: pymol-data from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz
Ubuntu apt95%

python3-pymol 2.5.0+dfsg-1build6

Molecular Graphics System (Python 3 modules)

https://www.pymol.org

sudo apt install python3-pymol
  • Section: universe/python
  • Architecture: amd64
  • Source Package: pymol
  • 17 依存関係
  • normalized package name match
  • 一致条件: Pymol
Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: python3-pymol from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz
dnf95%

pymol 3.1.0-15.fc45

PyMOL Molecular Graphics System

http://www.pymol.org

sudo dnf install pymol
  • License: MIT-0 AND BSD-2-Clause AND BSD-3-Clause AND Bitstream-Vera AND OFL-1.1
  • Category: Unspecified
  • Architecture: x86_64
  • Source Package: pymol
  • 16 依存関係
  • 9 提供
  • normalized package name match
  • 一致条件: Pymol
Fedora Rawhide package metadata · dl.fedoraproject.org · Fedora Rawhide package metadata: pymol from https://dl.fedoraproject.org/pub/fedora/linux/development/rawhide/Everything/x86_64/os/repodata/e5ca8ce900cd68f5419e1c39ae517343100b306336cbaeb70a3c153121d95094-primary.xml.zst
dnf95%

pymol+tests 3.1.0-15.fc45

Metapackage for PyMOL: tests

http://www.pymol.org

sudo dnf install pymol+tests
  • License: MIT-0 AND BSD-2-Clause AND BSD-3-Clause AND Bitstream-Vera AND OFL-1.1
  • Category: Unspecified
  • Architecture: x86_64
  • Source Package: pymol
  • 3 依存関係
  • 1 提供
  • normalized package name match
  • 一致条件: Pymol
Fedora Rawhide package metadata · dl.fedoraproject.org · Fedora Rawhide package metadata: pymol+tests from https://dl.fedoraproject.org/pub/fedora/linux/development/rawhide/Everything/x86_64/os/repodata/e5ca8ce900cd68f5419e1c39ae517343100b306336cbaeb70a3c153121d95094-primary.xml.zst
pacman95%

pymol 3.1.0-5

Molecular visualization system on an Open Source foundation

https://pymol.org

sudo pacman -S pymol
  • License: custom
  • Architecture: x86_64
  • 10 依存関係
  • normalized package name match
  • 一致条件: Pymol
Arch Linux sync databases · geo.mirror.pkgbuild.com · Arch Linux sync databases: pymol from https://geo.mirror.pkgbuild.com/extra/os/x86_64/extra.db.tar.gz
zypper95%

python311-pymol 3.1.0-4.3

A Molecular Viewer

https://pymol.org/

sudo zypper install python311-pymol
  • License: Python-2.0
  • Category: Unspecified
  • Architecture: x86_64
  • Source Package: python-pymol
  • 16 依存関係
  • 4 提供
  • normalized package name match
  • 一致条件: Pymol
openSUSE Tumbleweed package metadata · download.opensuse.org · openSUSE Tumbleweed package metadata: python311-pymol from https://download.opensuse.org/tumbleweed/repo/oss/repodata/be8d3611d25469107f32075a1697e69ec57a2b850b42348a658cc671ad5ec2b50760d02c3e59524d50da9a11d5be799bdaffba2e166e8ca8858512e3c0bd665d-primary.xml.zst
zypper95%

python313-pymol 3.1.0-4.3

A Molecular Viewer

https://pymol.org/

sudo zypper install python313-pymol
  • License: Python-2.0
  • Category: Unspecified
  • Architecture: x86_64
  • Source Package: python-pymol
  • 16 依存関係
  • 5 提供
  • normalized package name match
  • 一致条件: Pymol
openSUSE Tumbleweed package metadata · download.opensuse.org · openSUSE Tumbleweed package metadata: python313-pymol from https://download.opensuse.org/tumbleweed/repo/oss/repodata/be8d3611d25469107f32075a1697e69ec57a2b850b42348a658cc671ad5ec2b50760d02c3e59524d50da9a11d5be799bdaffba2e166e8ca8858512e3c0bd665d-primary.xml.zst
zypper95%

python314-pymol 3.1.0-4.3

A Molecular Viewer

https://pymol.org/

sudo zypper install python314-pymol
  • License: Python-2.0
  • Category: Unspecified
  • Architecture: x86_64
  • Source Package: python-pymol
  • 16 依存関係
  • 4 提供
  • normalized package name match
  • 一致条件: Pymol
openSUSE Tumbleweed package metadata · download.opensuse.org · openSUSE Tumbleweed package metadata: python314-pymol from https://download.opensuse.org/tumbleweed/repo/oss/repodata/be8d3611d25469107f32075a1697e69ec57a2b850b42348a658cc671ad5ec2b50760d02c3e59524d50da9a11d5be799bdaffba2e166e8ca8858512e3c0bd665d-primary.xml.zst
MacPorts95%

pymol

sudo port install pymol
  • normalized package name match
  • 一致条件: Pymol
MacPorts ports tree · api.github.com · MacPorts ports tree: science/pymol/Portfile from https://api.github.com/repos/macports/macports-ports/git/trees/master?recursive=1
winget95%

Schrodinger.PyMOL

winget install --id Schrodinger.PyMOL -e
  • normalized package name match
  • 一致条件: Pymol
Windows Package Manager source index · cdn.winget.microsoft.com · Windows Package Manager source index: Schrodinger.PyMOL from https://cdn.winget.microsoft.com/cache/source.msix

ソース経路

リポジトリデータから生成

このページは scripts/generate-pkg-sqlite.py が生成した非公開のパッケージ SQLite アーティファクトから av-web によって提供されます。

使用ソース

  • Geiger risk classifier
  • Nucleus package database
  • av.db category and tag curation
  • cross-ecosystem install command graph
  • curated configuration and credential file locations
  • external package-manager database matches
  • package relationship graph
  • package version freshness
  • package-page enrichment