インストール

追加のインストールコマンド

macOS

Homebrew確認済み · 100%

brew install mrbayes

local Homebrew formula metadata

Linux

Debian apt確認済み · 92%

sudo apt install mrbayes

Debian stable package indexes · mrbayes · ソース: deb.debian.org

Nix確認済み · 92%

nix profile install nixpkgs#mrbayes

nixpkgs package indexes · pkgs/by-name/mr/mrbayes/package.nix · ソース: api.github.com

Windows

Windows Package Manager確認済み · 92%

winget install --id NBIS.MrBayes -e

Windows Package Manager source index · NBIS.MrBayes · ソース: cdn.winget.microsoft.com

概要

パッケージ概要

Bayesian inference of phylogenies and evolutionary models

プロジェクトリンク

コマンドとエイリアス

mb

履歴

プロジェクトの歴史と使われ方

MrBayes is a phylogenetics program for Bayesian inference and model choice across evolutionary models. John P. Huelsenbeck and Fredrik Ronquist introduced MRBAYES in Bioinformatics in 2001 as software for Bayesian inference of phylogeny using a variant of Markov chain Monte Carlo. The project later became associated with MrBayes 3, cited for Bayesian phylogenetic inference under mixed models, and MrBayes 3.2, cited for efficient inference and model selection across a large model space.

プロジェクトの歴史

The program's technical role is to make Bayesian phylogenetic analysis accessible through a command-line tool named mb. The official site lists support for nucleotide, amino-acid, restriction-site, and morphological data; mixed data types in one analysis; partitioned models with linked or unlinked parameters; many nucleotide and amino-acid rate matrices; clock trees; topology constraints; convergence diagnostics; stepping-stone model-likelihood estimation; MPI parallel jobs; BEAGLE acceleration; and checkpointing.

使われ方

MrBayes is a research package more than a general developer tool. Its manual says new users are served by a manual with tutorials, model discussions, FAQ material, and differences between versions 2 and 3, while published analyses are expected to cite the relevant MrBayes papers and optional parallel or BEAGLE-method papers. The GitHub repository notes that after release 3.2.6 in November 2015 the project entered maintenance mode under the National Bioinformatics Infrastructure Sweden, with the original development team still involved and future work oriented mainly toward bug fixes. Package managers expose it as a command-line scientific application for reproducible phylogenetic workflows.

ソース

セキュリティ状態

リスクレベル: グリーン

narrow executable package without higher-risk signals.

リスク分類器

リスクグリーン · 信頼度低 · appliance

理由

narrow executable package without higher-risk signals

信号

metadata:no-higher-risk-signals

インストール挙動

formula メタデータに Homebrew post-install フックは記録されていません。
Homebrew bottle メタデータは 6 個のプラットフォームターゲットで利用できます。
2 件の実行時依存関係とともにインストールされます。
ビルドメタデータには 1 件のビルド依存関係があります。

推奨レビュー

エージェントに無人実行させる前に、このツールが平文の認証情報を読むか、リモート状態を書き込むか、成果物を公開するか、プラグインを起動するかを確認してください。

実行可能ファイル

インストールされる実行可能ファイル

コマンド	種類	公開範囲	メモ
`mb`	cli	グローバル実行可能ファイル

鮮度

バージョンと鮮度

これらの信号は、ページ生成時期、パッケージマネージャの活動、上流リリース比較を分けて示します。バージョン遅れは、証拠 URL と比較可能なバージョンがある場合だけ警告されます。

ページ生成日2026-07-08

マネージャ版3.2.7a

マネージャ更新日

ローカルデータOK

上流not checked

検出された最新未検出

https://github.com/NBISweden/MrBayes

情報No package-manager update timestamp was available.信頼度低
情報No cached GitHub release or tag data was available.https://github.com/NBISweden/MrBayes信頼度 none

インストールメタデータ

パッケージメタデータ

パッケージキー	brew:mrbayes
バージョン	3.2.7a
パッケージマネージャ	Homebrew
パッケージマネージャページ	https://formulae.brew.sh/formula/mrbayes
ホームページ	https://nbisweden.github.io/MrBayes/
リポジトリ	https://github.com/NBISweden/MrBayes
上流ドキュメント	https://nbisweden.github.io/MrBayes/manual.html
ライセンス	GPL-3.0-or-later
ソースアーカイブ	https://github.com/NBISweden/MrBayes/archive/refs/tags/v3.2.7a.tar.gz
依存関係	beagle, open-mpi
ビルド依存関係	pkgconf
Bottle	利用可能 (対象 arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
Homebrew post-install	未定義
サービス	宣言なし

レジストリ情報

ソースデータベース詳細

Source Database	Homebrew formula API
Tap	homebrew/core
Full Name	mrbayes
Version Scheme	0
Revision	0
Head Version	HEAD
Bottle Stable Root URL	https://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecated	no
Disabled	no
Keg Only	no
URL Keys	head stable

ソースデータベース一致

他のパッケージマネージャ記録

一致は外部パッケージマネージャインデックスから取得され、ローカルの Automic Vault パッケージリンクとは分けて表示されます。

Debian apt95%

mrbayes 3.2.7a-7+b1

Bayesian Inference of Phylogeny

http://mrbayes.csit.fsu.edu/

sudo apt install mrbayes

Section: science
Architecture: amd64
Source Package: mrbayes
3 依存関係
1 任意依存関係
normalized package name match
一致条件: Mrbayes

Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: mrbayes from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz

Debian apt95%

mrbayes-doc 3.2.7a-7

Bayesian Inference of Phylogeny - manual

http://mrbayes.csit.fsu.edu/

sudo apt install mrbayes-doc

Section: doc
Architecture: all
Source Package: mrbayes
normalized package name match
一致条件: Mrbayes

Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: mrbayes-doc from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz

Debian apt95%

mrbayes-mpi 3.2.7a-7+b1

Bayesian Inference of Phylogeny - mpi version

http://mrbayes.csit.fsu.edu/

sudo apt install mrbayes-mpi

Section: science
Architecture: amd64
Source Package: mrbayes
5 依存関係
2 任意依存関係
normalized package name match
一致条件: Mrbayes

Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: mrbayes-mpi from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz

Nix95%

mrbayes

nix profile install nixpkgs#mrbayes

normalized package name match
一致条件: Mrbayes

nixpkgs package indexes · api.github.com · nixpkgs package indexes: pkgs/by-name/mr/mrbayes/package.nix from https://api.github.com/repos/NixOS/nixpkgs/git/trees/master?recursive=1

Ubuntu apt95%

mrbayes 3.2.7a-7build2

Bayesian Inference of Phylogeny

http://mrbayes.csit.fsu.edu/

sudo apt install mrbayes

Section: universe/math
Architecture: amd64
3 依存関係
1 任意依存関係
normalized package name match
一致条件: Mrbayes

Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: mrbayes from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz

Ubuntu apt95%

mrbayes-doc 3.2.7a-7build2

Bayesian Inference of Phylogeny - manual

http://mrbayes.csit.fsu.edu/

sudo apt install mrbayes-doc

Section: universe/doc
Architecture: all
Source Package: mrbayes
normalized package name match
一致条件: Mrbayes

Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: mrbayes-doc from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz

Ubuntu apt95%

mrbayes-mpi 3.2.7a-7build2

Bayesian Inference of Phylogeny - mpi version

http://mrbayes.csit.fsu.edu/

sudo apt install mrbayes-mpi

Section: universe/science
Architecture: amd64
Source Package: mrbayes
5 依存関係
2 任意依存関係
normalized package name match
一致条件: Mrbayes

Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: mrbayes-mpi from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz

winget95%

NBIS.MrBayes

winget install --id NBIS.MrBayes -e

normalized package name match
一致条件: Mrbayes

Windows Package Manager source index · cdn.winget.microsoft.com · Windows Package Manager source index: NBIS.MrBayes from https://cdn.winget.microsoft.com/cache/source.msix

パッケージグラフ

リンクは、ローカルのパッケージ関係グラフ、補足データ、依存関係、エコシステム一致、パッケージハブ所属から来ています。

ソース経路

リポジトリデータから生成

このページは scripts/generate-pkg-sqlite.py が生成した非公開のパッケージ SQLite アーティファクトから av-web によって提供されます。

Combined YAML source

View the package source record on GitHub.

combined/mrbayes.yml

使用ソース

Geiger risk classifier
Nucleus package database
av.db category and tag curation
cross-ecosystem install command graph
curated package history
external package-manager database matches
package relationship graph
package version freshness
package-page enrichment

mrbayes を Homebrew, apt, Nix, winget でインストール

追加のインストールコマンド

macOS

Linux

Windows

パッケージ概要

プロジェクトリンク

コマンドとエイリアス

プロジェクトの歴史と使われ方

プロジェクトの歴史

使われ方

ソース

リスクレベル: グリーン

リスク分類器

理由

信号

インストール挙動

推奨レビュー

インストールされる実行可能ファイル

バージョンと鮮度

パッケージメタデータ

ソースデータベース詳細

他のパッケージマネージャ記録

内部パッケージリンク

トピック別ハブ

関連ツール

同じワークフロー

エージェント安全ガイド

リポジトリデータから生成

Combined YAML source

使用ソース