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brew

lastz を Homebrew, apt でインストール

lastz のインストール経路、実行ファイル、メタデータ、AI エージェント向けセキュリティノートを確認します。

インストールコマンドセキュリティノート

インストール

追加のインストールコマンド

macOS

Homebrew確認済み · 100%
brew install lastz

local Homebrew formula metadata

Linux

Debian apt確認済み · 92%
sudo apt install lastz

Debian stable package indexes · lastz · ソース: deb.debian.org

概要

パッケージ概要

Pairwise aligner for DNA sequences

コマンドとエイリアス

  • lastz
  • lastz_D

履歴

プロジェクトの歴史と使われ方

LASTZ is a pairwise DNA sequence aligner and the successor-style, command-line-compatible replacement for BLASTZ. It is used for comparing genomic sequences and can emit formats used by genome-alignment pipelines, including LAV, AXT, MAF, SAM, CIGAR, PAF, and human-readable output.

プロジェクトの歴史

The official documentation presents LASTZ as a drop-in replacement for BLASTZ that preserves BLASTZ command-line syntax while adding options and correcting behavioral problems. Its documentation includes an explicit section on differences from BLASTZ, such as fixes to alignment-boundary behavior, premature termination, chaining overflow, ambiguity handling, and additional output formats.

The GitHub repository was created on 2016-08-11 and is described by the project as the official working branch, with users encouraged to use tagged releases. Tagged 1.04.x releases continued the project's bioinformatics-maintenance role after the BLASTZ era.

採用の歴史

LASTZ is packaged in Homebrew, Debian, and Ubuntu and appears in high-performance-computing genomics documentation because pairwise whole-genome and read-to-reference alignment remain recurring batch-computing tasks. Its BLASTZ compatibility helped existing workflows migrate without rewriting every command line.

The adoption pattern is typical of scientific command-line tools: a stable executable, long HTML manual, tagged source releases, and distribution packages matter more than a polished end-user application interface.

使われ方

Users run `lastz` with target and query sequences plus scoring, seeding, masking, chaining, and output-format options. The manual's examples cover comparing chromosomes, aligning shotgun reads to a chromosome, self-alignment, and working with seed, HSP, gapped-alignment, and chaining stages.

パッケージ好きにとっての重要性

LASTZ is package-nerd significant because it is a specialized scientific CLI whose real value is reproducibility: exact versions, tagged releases, and package-manager availability let genomics pipelines rerun large alignments with known behavior.

It also illustrates a common packaging problem in bioinformatics: preserving old command-line compatibility while fixing algorithmic bugs and adding formats needed by newer workflows.

タイムライン

  • 2016-08-11: Official GitHub repository created.
  • 2017-04-12: Tag 1.04.00 appears in the public GitHub tag set.
  • 2022-01-11: Tag 1.04.52 appears in the public GitHub tag set.
  • 2026-05-20: GitHub repository metadata records activity on the official repository.

Related projects

  • LASTZ is directly related to BLASTZ, the Miller Lab alignment tools, and downstream genome-alignment formats and pipelines that consume LAV, AXT, MAF, SAM, CIGAR, or PAF output.

セキュリティ状態

リスクレベル: グリーン

narrow executable package without higher-risk signals.

リスク分類器

リスク グリーン · 信頼度 低 · appliance

理由

  • narrow executable package without higher-risk signals

信号

  • metadata:no-higher-risk-signals

インストール挙動

  • formula メタデータに Homebrew post-install フックは記録されていません。
  • Homebrew bottle メタデータは 8 個のプラットフォームターゲットで利用できます。

推奨レビュー

エージェントに無人実行させる前に、このツールが平文の認証情報を読むか、リモート状態を書き込むか、成果物を公開するか、プラグインを起動するかを確認してください。

実行可能ファイル

インストールされる実行可能ファイル

コマンド種類公開範囲メモ
lastzcliグローバル実行可能ファイル
lastz_Dcliグローバル実行可能ファイル

鮮度

バージョンと鮮度

これらの信号は、ページ生成時期、パッケージマネージャの活動、上流リリース比較を分けて示します。バージョン遅れは、証拠 URL と比較可能なバージョンがある場合だけ警告されます。

ページ生成日2026-07-08
マネージャ版1.04.52
マネージャ更新日
ローカルデータOK
上流最新
検出された最新1.04.52

https://github.com/lastz/lastz

  • 情報No package-manager update timestamp was available.信頼度 低

インストールメタデータ

パッケージメタデータ

パッケージキーbrew:lastz
バージョン1.04.52
パッケージマネージャHomebrew
パッケージマネージャページhttps://formulae.brew.sh/formula/lastz
ホームページhttps://lastz.github.io/lastz/
リポジトリhttps://github.com/lastz/lastz
上流ドキュメントhttps://lastz.github.io/lastz
ライセンスMIT
ソースアーカイブhttps://github.com/lastz/lastz/archive/refs/tags/1.04.52.tar.gz
Bottle利用可能 (対象 arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, arm64_ventura, sonoma, ventura, x86_64_linux)
Homebrew post-install未定義
サービス宣言なし

レジストリ情報

ソースデータベース詳細

Source DatabaseHomebrew formula API
Taphomebrew/core
Full Namelastz
Version Scheme0
Revision0
Head VersionHEAD
Bottle Stable Root URLhttps://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecatedno
Disabledno
Keg Onlyno
URL Keys
  • head
  • stable

ソースデータベース一致

他のパッケージマネージャ記録

一致は外部パッケージマネージャインデックスから取得され、ローカルの Automic Vault パッケージリンクとは分けて表示されます。

Debian apt95%

lastz 1.04.22-2

pairwise aligning DNA sequences

https://github.com/lastz/lastz

sudo apt install lastz
  • Section: science
  • Architecture: amd64
  • 1 依存関係
  • normalized package name match
  • 一致条件: Lastz
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: lastz from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz
Debian apt95%

lastz-examples 1.04.22-2

pairwise aligning DNA sequences (examples and test scripts)

https://github.com/lastz/lastz

sudo apt install lastz-examples
  • Section: science
  • Architecture: all
  • Source Package: lastz
  • 1 依存関係
  • normalized package name match
  • 一致条件: Lastz
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: lastz-examples from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz
Ubuntu apt95%

lastz 1.04.22-2

pairwise aligning DNA sequences

https://github.com/lastz/lastz

sudo apt install lastz
  • Section: universe/science
  • Architecture: amd64
  • 1 依存関係
  • normalized package name match
  • 一致条件: Lastz
Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: lastz from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz
Ubuntu apt95%

lastz-examples 1.04.22-2

pairwise aligning DNA sequences (examples and test scripts)

https://github.com/lastz/lastz

sudo apt install lastz-examples
  • Section: universe/science
  • Architecture: all
  • Source Package: lastz
  • 1 依存関係
  • normalized package name match
  • 一致条件: Lastz
Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: lastz-examples from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz

パッケージグラフ

リンクは、ローカルのパッケージ関係グラフ、補足データ、依存関係、エコシステム一致、パッケージハブ所属から来ています。

同じワークフロー

  • minimap2Shares av.db curated category or tags: bioinformatics, cli, dna, genomics, science.
  • mummerShares av.db curated category or tags: bioinformatics, cli, dna, genomics, science.
  • bbtoolsShares av.db curated category or tags: bioinformatics, cli, dna, genomics, science.
  • blastShares av.db curated category or tags: bioinformatics, cli, genomics, science, sequence-alignment.
  • breseqShares av.db curated category or tags: bioinformatics, cli, dna, genomics, science.
  • bwaShares av.db curated category or tags: bioinformatics, cli, dna, science, sequence-alignment.

エージェント安全ガイド

ソース経路

リポジトリデータから生成

このページは scripts/generate-pkg-sqlite.py が生成した非公開のパッケージ SQLite アーティファクトから av-web によって提供されます。

使用ソース

  • Geiger risk classifier
  • Nucleus package database
  • av.db category and tag curation
  • cross-ecosystem install command graph
  • curated package history
  • external package-manager database matches
  • package relationship graph
  • package version freshness
  • package-page enrichment