Automic Vault
Renseignements sur le paquet brew
Consultez les chemins d'installation, exécutables, métadonnées et notes de sécurité de samtools pour les workflows d'agents IA.
installation
sudo av install brew:samtoolsbrew install samtools
local Homebrew formula metadata
sudo port install samtools
MacPorts ports tree · science/samtools/Portfile · source: api.github.com
sudo apt install samtools
Debian stable package indexes · samtools · source: deb.debian.org
sudo dnf install samtools
Fedora Rawhide package metadata · samtools · source: dl.fedoraproject.org
nix profile install nixpkgs#samtools
nixpkgs package indexes · pkgs/by-name/sa/samtools/package.nix · source: api.github.com
sudo zypper install samtools
openSUSE Tumbleweed package metadata · samtools · source: download.opensuse.org
aperçu
Automic Vault publie les chemins d'installation, les faits d'exécutables et les métadonnées de sécurité propres à samtools depuis les données locales de paquets.
Tools for manipulating next-generation sequencing data
posture de sécurité
narrow executable package without higher-risk signals.
green risque · low confiance · appliance
Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.
exécutables
| Commande | Type | Exposition | Note |
|---|---|---|---|
ace2sam | cli | global executable | |
blast2sam.pl | cli | global executable | |
bowtie2sam.pl | cli | global executable | |
export2sam.pl | cli | global executable | |
fasta-sanitize.pl | cli | global executable | |
interpolate_sam.pl | cli | global executable | |
maq2sam-long | cli | global executable | |
maq2sam-short | cli | global executable | |
md5fa | cli | global executable | |
md5sum-lite | cli | global executable | |
novo2sam.pl | cli | global executable | |
plot-ampliconstats | cli | global executable | |
plot-bamstats | cli | global executable | |
psl2sam.pl | cli | global executable | |
sam2vcf.pl | cli | global executable | |
samtools | cli | global executable | |
samtools.pl | cli | global executable | |
seq_cache_populate.pl | cli | global executable | |
soap2sam.pl | cli | global executable | |
wgsim | cli | global executable | |
wgsim_eval.pl | cli | global executable | |
zoom2sam.pl | cli | global executable |
fraîcheur
Ces signaux séparent l'âge de génération de la page, l'activité du gestionnaire de paquets et la comparaison avec les versions amont. Un retard de version n'est signalé que lorsqu'une URL de preuve et des versions comparables sont présentes.
https://github.com/samtools/samtools
métadonnées d'installation
| Clé du paquet | brew:samtools |
|---|---|
| Version | 1.23.1 |
| Gestionnaire de paquets | Homebrew |
| Page du gestionnaire de paquets | https://formulae.brew.sh/formula/samtools |
| Page d'accueil | https://www.htslib.org/ |
| Dépôt | https://github.com/samtools/samtools |
| Docs amont | https://www.htslib.org/ |
| Licence | MIT |
| Archive source | https://github.com/samtools/samtools/releases/download/1.23.1/samtools-1.23.1.tar.bz2 |
| Mis à jour | 2026-03-18T18:10:04Z |
| Pulse | updated |
| Dépendances | htslib |
| Bibliothèques fournies par macOS | ncurses |
| Bouteille | disponible (arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux) |
| post-install Homebrew | non défini |
| Service | aucun déclaré |
piste source
Cette page est écrite par scripts/generate-pkg-pages.py. Les déploiements refusent de publier si www/pkg/ est obsolète par rapport aux données locales de paquets.