Automic Vault

Renseignements sur le paquet brew

Installer bowtie2

Consultez les chemins d'installation, exécutables, métadonnées et notes de sécurité de bowtie2 pour les workflows d'agents IA.

installation

Installer avec Automic Vault

Automic Vault
sudo av install brew:bowtie2

macOS

Homebrew vérifié · 100%
brew install bowtie2

local Homebrew formula metadata

MacPorts vérifié · 94%
sudo port install bowtie2

MacPorts ports tree · science/bowtie2/Portfile · source: api.github.com

Linux

Debian apt vérifié · 92%
sudo apt install bowtie2

Debian stable package indexes · bowtie2 · source: deb.debian.org

Fedora dnf vérifié · 92%
sudo dnf install bowtie2

Fedora Rawhide package metadata · bowtie2 · source: dl.fedoraproject.org

Nix vérifié · 92%
nix profile install nixpkgs#bowtie2

nixpkgs package indexes · pkgs/by-name/bo/bowtie2/package.nix · source: api.github.com

openSUSE zypper vérifié · 92%
sudo zypper install bowtie2

openSUSE Tumbleweed package metadata · bowtie2 · source: download.opensuse.org

Notes de plateforme

  • Aucune note de plateforme propre au paquet n'était présente.

aperçu

Résumé du paquet

Automic Vault publie les chemins d'installation, les faits d'exécutables et les métadonnées de sécurité propres à bowtie2 depuis les données locales de paquets.

Commandes et alias

  • bowtie2
  • bowtie2-align-l
  • bowtie2-align-s
  • bowtie2-build
  • bowtie2-build-l
  • bowtie2-build-s
  • bowtie2-inspect
  • bowtie2-inspect-l
  • bowtie2-inspect-s

Résumé source

Fast and sensitive gapped read aligner

posture de sécurité

Niveau de risque : green

narrow executable package without higher-risk signals.

Classificateur de risque

green risque · low confiance · appliance

Pourquoi

  • narrow executable package without higher-risk signals

Signaux

  • metadata:no-higher-risk-signals

Comportement d'installation

  • Aucun hook post-install Homebrew n’est enregistré dans les métadonnées de formule.
  • Les métadonnées de bottle Homebrew sont disponibles pour 6 plateformes.
  • Les métadonnées de compilation listent 1 dépendances de compilation.

Revue recommandée

Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.

exécutables

Exécutables installés

CommandeTypeExpositionNote
bowtie2cliglobal executable
bowtie2-align-lcliglobal executable
bowtie2-align-scliglobal executable
bowtie2-buildcliglobal executable
bowtie2-build-lcliglobal executable
bowtie2-build-scliglobal executable
bowtie2-inspectcliglobal executable
bowtie2-inspect-lcliglobal executable
bowtie2-inspect-scliglobal executable

fraîcheur

Version et fraîcheur

Ces signaux séparent l'âge de génération de la page, l'activité du gestionnaire de paquets et la comparaison avec les versions amont. Un retard de version n'est signalé que lorsqu'une URL de preuve et des versions comparables sont présentes.

page générée2026-05-26
version du gestionnaire2.5.5
gestionnaire mis à jour2026-02-17
données localesok
amontcurrent
dernière version détectéev2.5.5

https://github.com/BenLangmead/bowtie2

  • okAucun avertissement de fraîcheur n'a été généré.

métadonnées d'installation

Métadonnées du paquet

Clé du paquetbrew:bowtie2
Version2.5.5
Gestionnaire de paquetsHomebrew
Page du gestionnaire de paquetshttps://formulae.brew.sh/formula/bowtie2
Page d'accueilhttps://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/index.shtml
Dépôthttps://github.com/BenLangmead/bowtie2
Docs amonthttps://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/index.shtml
LicenceGPL-3.0-or-later
Archive sourcehttps://github.com/BenLangmead/bowtie2/archive/refs/tags/v2.5.5.tar.gz
Mis à jour2026-02-17T20:26:53Z
Pulseupdated
Dépendances de compilationsimde
Bibliothèques fournies par macOSperl, python
Bouteilledisponible (arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
post-install Homebrewnon défini
Serviceaucun déclaré

piste source

Généré depuis les données du dépôt

Cette page est écrite par scripts/generate-pkg-pages.py. Les déploiements refusent de publier si www/pkg/ est obsolète par rapport aux données locales de paquets.

Sources utilisées

  • Geiger risk classifier
  • Nucleus package database
  • cross-ecosystem install command graph
  • package relationship graph
  • package version freshness
  • package-page enrichment