Automic Vault

Renseignements sur le paquet brew

Installer bcftools

Consultez les chemins d'installation, exécutables, métadonnées et notes de sécurité de bcftools pour les workflows d'agents IA.

installation

Installer avec Automic Vault

Automic Vault
sudo av install brew:bcftools

macOS

Homebrew vérifié · 100%
brew install bcftools

local Homebrew formula metadata

MacPorts vérifié · 94%
sudo port install bcftools

MacPorts ports tree · science/bcftools/Portfile · source: api.github.com

Linux

Debian apt vérifié · 92%
sudo apt install bcftools

Debian stable package indexes · bcftools · source: deb.debian.org

Fedora dnf vérifié · 92%
sudo dnf install bcftools

Fedora Rawhide package metadata · bcftools · source: dl.fedoraproject.org

Nix vérifié · 92%
nix profile install nixpkgs#bcftools

nixpkgs package indexes · pkgs/by-name/bc/bcftools/package.nix · source: api.github.com

openSUSE zypper vérifié · 92%
sudo zypper install bcftools

openSUSE Tumbleweed package metadata · bcftools · source: download.opensuse.org

Notes de plateforme

  • Aucune note de plateforme propre au paquet n'était présente.

aperçu

Résumé du paquet

Automic Vault publie les chemins d'installation, les faits d'exécutables et les métadonnées de sécurité propres à bcftools depuis les données locales de paquets.

Commandes et alias

  • bcftools
  • color-chrs.pl
  • gff2gff
  • gff2gff.py
  • guess-ploidy.py
  • plot-roh.py
  • plot-vcfstats
  • roh-viz
  • run-roh.pl
  • vcfutils.pl
  • vrfs-variances

Résumé source

Tools for BCF/VCF files and variant calling from samtools

posture de sécurité

Niveau de risque : green

narrow executable package without higher-risk signals.

Classificateur de risque

green risque · low confiance · appliance

Pourquoi

  • narrow executable package without higher-risk signals

Signaux

  • metadata:no-higher-risk-signals

Comportement d'installation

  • Aucun hook post-install Homebrew n’est enregistré dans les métadonnées de formule.
  • Les métadonnées de bottle Homebrew sont disponibles pour 6 plateformes.
  • S’installe avec 2 dépendances d’exécution.

Revue recommandée

Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.

exécutables

Exécutables installés

CommandeTypeExpositionNote
bcftoolscliglobal executable
color-chrs.plcliglobal executable
gff2gffcliglobal executable
gff2gff.pycliglobal executable
guess-ploidy.pycliglobal executable
plot-roh.pycliglobal executable
plot-vcfstatscliglobal executable
roh-vizcliglobal executable
run-roh.plcliglobal executable
vcfutils.plcliglobal executable
vrfs-variancescliglobal executable

fraîcheur

Version et fraîcheur

Ces signaux séparent l'âge de génération de la page, l'activité du gestionnaire de paquets et la comparaison avec les versions amont. Un retard de version n'est signalé que lorsqu'une URL de preuve et des versions comparables sont présentes.

page générée2026-05-26
version du gestionnaire1.23.1
gestionnaire mis à jour2026-03-18
données localesok
amontnot checked
dernière version détectéenon détecté

https://github.com/samtools/bcftools

métadonnées d'installation

Métadonnées du paquet

Clé du paquetbrew:bcftools
Version1.23.1
Gestionnaire de paquetsHomebrew
Page du gestionnaire de paquetshttps://formulae.brew.sh/formula/bcftools
Page d'accueilhttps://www.htslib.org/
Dépôthttps://github.com/samtools/bcftools
Docs amonthttps://www.htslib.org/
LicenceGPL-3.0-or-later
Archive sourcehttps://github.com/samtools/bcftools/releases/download/1.23.1/bcftools-1.23.1.tar.bz2
Mis à jour2026-03-18T19:18:16Z
Pulseupdated
Dépendancesgsl, htslib
Bouteilledisponible (arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
post-install Homebrewnon défini
Serviceaucun déclaré

piste source

Généré depuis les données du dépôt

Cette page est écrite par scripts/generate-pkg-pages.py. Les déploiements refusent de publier si www/pkg/ est obsolète par rapport aux données locales de paquets.

Sources utilisées

  • Geiger risk classifier
  • Nucleus package database
  • cross-ecosystem install command graph
  • package relationship graph
  • package version freshness
  • package-page enrichment