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brew

Installer proteinortho avec Homebrew, apt

Consultez les chemins d'installation, exécutables, métadonnées et notes de sécurité de proteinortho pour les workflows d'agents IA.

installation

Commandes d'installation supplémentaires

macOS

Homebrewvérifié · 100%
brew install proteinortho

local Homebrew formula metadata

Linux

Debian aptvérifié · 92%
sudo apt install proteinortho

Debian stable package indexes · proteinortho · Source: deb.debian.org

aperçu

Résumé du paquet

Detecting orthologous genes within different species

Commandes et alias

  • proteinortho
  • proteinortho2html.pl
  • proteinortho2tree.pl
  • proteinortho2xml.pl
  • proteinortho6.pl
  • proteinortho_cleanupblastgraph
  • proteinortho_clustering
  • proteinortho_compareProteinorthoGraphs.pl
  • proteinortho_do_mcl.pl
  • proteinortho_extract_from_graph.pl
  • proteinortho_ffadj_mcs.py
  • proteinortho_formatUsearch.pl
  • proteinortho_grab_proteins.pl
  • proteinortho_graphMinusRemovegraph
  • proteinortho_history.pl
  • proteinortho_singletons.pl
  • proteinortho_summary.pl

posture de sécurité

Niveau de risque : orange

infrastructure mutation or orchestration signal.

Classificateur de risque

risque orange · confiance moyen · infrastructure

Pourquoi

  • infrastructure mutation or orchestration signal

Signaux

  • text:cluster

Comportement d'installation

  • Aucun hook post-install Homebrew n’est enregistré dans les métadonnées de formule.
  • Les métadonnées de bottle Homebrew sont disponibles pour 8 plateformes.
  • S’installe avec 3 dépendances d’exécution.

Revue recommandée

Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.

exécutables

Exécutables installés

CommandeTypeExpositionNote
proteinorthocliexécutable global
proteinortho2html.plcliexécutable global
proteinortho2tree.plcliexécutable global
proteinortho2xml.plcliexécutable global
proteinortho6.plcliexécutable global
proteinortho_cleanupblastgraphcliexécutable global
proteinortho_clusteringcliexécutable global
proteinortho_compareProteinorthoGraphs.plcliexécutable global
proteinortho_do_mcl.plcliexécutable global
proteinortho_extract_from_graph.plcliexécutable global
proteinortho_ffadj_mcs.pycliexécutable global
proteinortho_formatUsearch.plcliexécutable global
proteinortho_grab_proteins.plcliexécutable global
proteinortho_graphMinusRemovegraphcliexécutable global
proteinortho_history.plcliexécutable global
proteinortho_singletons.plcliexécutable global
proteinortho_summary.plcliexécutable global

fraîcheur

Version et fraîcheur

Ces signaux séparent l'âge de génération de la page, l'activité du gestionnaire de paquets et la comparaison avec les versions amont. Un retard de version n'est signalé que lorsqu'une URL de preuve et des versions comparables sont présentes.

page générée2026-07-08
version du gestionnaire6.3.6
gestionnaire mis à jour2026-06-25
données localesOK
amontnot checked
dernière version détectéenon détecté

https://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho

métadonnées d'installation

Métadonnées du paquet

Clé du paquetbrew:proteinortho
Version6.3.6
Gestionnaire de paquetsHomebrew
Page du gestionnaire de paquetshttps://formulae.brew.sh/formula/proteinortho
Page d'accueilhttps://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho
Dépôthttps://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho
Docs amonthttps://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho#readme
LicenceGPL-3.0-or-later
Archive sourcehttps://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho/-/archive/v6.3.6/proteinortho-v6.3.6.tar.gz
Dernière mise à jour2026-06-25T13:38:03+02:00
Pulseupdated
Dépendancesdiamond, libomp, openblas
Bouteilledisponible (sur arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, arm64_ventura, sonoma, ventura, x86_64_linux)
post-install Homebrewnon défini
Serviceaucun déclaré

faits du registre

Détails de la base source

Source DatabaseHomebrew formula API
Taphomebrew/core
Full Nameproteinortho
Version Scheme0
Revision0
Bottle Stable Root URLhttps://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecatedno
Disabledno
Keg Onlyno
URL Keys
  • stable

correspondances dans les bases sources

Autres enregistrements de gestionnaires de paquets

Les correspondances proviennent d’index externes de gestionnaires de paquets et restent séparées des liens de paquets Automic Vault locaux.

Debian apt95%

proteinortho 6.3.1+dfsg-1

Detection of (Co-)orthologs in large-scale protein analysis

https://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho

sudo apt install proteinortho
  • Section: science
  • Architecture: amd64
  • 10 Dépendances
  • normalized package name match
  • Correspondance par : Proteinortho
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: proteinortho from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz
Ubuntu apt95%

proteinortho 6.3.1+dfsg-1

Detection of (Co-)orthologs in large-scale protein analysis

https://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho

sudo apt install proteinortho
  • Section: universe/science
  • Architecture: amd64
  • 10 Dépendances
  • normalized package name match
  • Correspondance par : Proteinortho
Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: proteinortho from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz

piste source

Généré depuis les données du dépôt

Cette page est servie par av-web depuis l'artéfact SQLite privé des paquets généré par scripts/generate-pkg-sqlite.py.

Sources utilisées

  • Geiger risk classifier
  • Nucleus package database
  • av.db category and tag curation
  • cross-ecosystem install command graph
  • external package-manager database matches
  • package relationship graph
  • package version freshness
  • package-page enrichment