macOS
Homebrew
vérifié · 100%
brew install bioperl
local Homebrew formula metadata
Renseignements sur le paquet brew
Installer bioperl
Consultez les chemins d'installation, exécutables, métadonnées et notes de sécurité de bioperl pour les workflows d'agents IA.
installation
Installer avec Automic Vault
Automic Vault
sudo av install brew:bioperlLinux
Debian apt
vérifié · 92%
sudo apt install bioperl
Debian stable package indexes · bioperl · source: deb.debian.org
Source du gestionnaire de paquets
Notes de plateforme
- Aucune note de plateforme propre au paquet n'était présente.
aperçu
Résumé du paquet
Automic Vault publie les chemins d'installation, les faits d'exécutables et les métadonnées de sécurité propres à bioperl depuis les données locales de paquets.
Page d'accueil
Commandes et alias
- bp_aacomp
- bp_bioflat_index
- bp_biogetseq
- bp_dbsplit
- bp_extract_feature_seq
- bp_fastam9_to_table
- bp_fetch
- bp_filter_search
- bp_find-blast-matches
- bp_gccalc
- bp_genbank2gff3
- bp_index
- bp_local_taxonomydb_query
- bp_make_mrna_protein
- bp_mask_by_search
- bp_mrtrans
- bp_mutate
- bp_nexus2nh
- bp_nrdb
- bp_oligo_count
- bp_process_gadfly
- bp_process_sgd
- bp_revtrans-motif
- bp_search2alnblocks
- bp_search2gff
- bp_search2table
- bp_search2tribe
- bp_seq_length
- bp_seqconvert
- bp_seqcut
- bp_seqpart
- bp_seqret
Résumé source
Perl tools for bioinformatics, genomics and life science
posture de sécurité
Niveau de risque : green
narrow executable package without higher-risk signals.
Classificateur de risque
green risque · low confiance · appliance
Pourquoi
- narrow executable package without higher-risk signals
Signaux
- metadata:no-higher-risk-signals
Comportement d'installation
- Aucun hook post-install Homebrew n’est enregistré dans les métadonnées de formule.
- Les métadonnées de bottle Homebrew sont disponibles pour 6 plateformes.
- Les métadonnées de compilation listent 1 dépendances de compilation.
Revue recommandée
Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.
exécutables
Exécutables installés
| Commande | Type | Exposition | Note |
|---|---|---|---|
bp_aacomp | cli | global executable | |
bp_bioflat_index | cli | global executable | |
bp_biogetseq | cli | global executable | |
bp_dbsplit | cli | global executable | |
bp_extract_feature_seq | cli | global executable | |
bp_fastam9_to_table | cli | global executable | |
bp_fetch | cli | global executable | |
bp_filter_search | cli | global executable | |
bp_find-blast-matches | cli | global executable | |
bp_gccalc | cli | global executable | |
bp_genbank2gff3 | cli | global executable | |
bp_index | cli | global executable | |
bp_local_taxonomydb_query | cli | global executable | |
bp_make_mrna_protein | cli | global executable | |
bp_mask_by_search | cli | global executable | |
bp_mrtrans | cli | global executable | |
bp_mutate | cli | global executable | |
bp_nexus2nh | cli | global executable | |
bp_nrdb | cli | global executable | |
bp_oligo_count | cli | global executable | |
bp_process_gadfly | cli | global executable | |
bp_process_sgd | cli | global executable | |
bp_revtrans-motif | cli | global executable | |
bp_search2alnblocks | cli | global executable | |
bp_search2gff | cli | global executable | |
bp_search2table | cli | global executable | |
bp_search2tribe | cli | global executable | |
bp_seq_length | cli | global executable | |
bp_seqconvert | cli | global executable | |
bp_seqcut | cli | global executable | |
bp_seqpart | cli | global executable | |
bp_seqret | cli | global executable | |
bp_seqretsplit | cli | global executable | |
bp_split_seq | cli | global executable | |
bp_sreformat | cli | global executable | |
bp_taxid4species | cli | global executable | |
bp_taxonomy2tree | cli | global executable | |
bp_translate_seq | cli | global executable | |
bp_tree2pag | cli | global executable | |
bp_unflatten_seq | cli | global executable |
fraîcheur
Version et fraîcheur
Ces signaux séparent l'âge de génération de la page, l'activité du gestionnaire de paquets et la comparaison avec les versions amont. Un retard de version n'est signalé que lorsqu'une URL de preuve et des versions comparables sont présentes.
page générée2026-05-26
version du gestionnaire1.7.8
gestionnaire mis à jour2026-04-20
données localesok
amontnot checked
dernière version détectéenon détecté
- info Release/tag comparison is only available for GitHub repositories. https://bioperl.org none confiance
métadonnées d'installation
Métadonnées du paquet
| Clé du paquet | brew:bioperl |
|---|---|
| Version | 1.7.8 |
| Gestionnaire de paquets | Homebrew |
| Page du gestionnaire de paquets | https://formulae.brew.sh/formula/bioperl |
| Page d'accueil | https://bioperl.org |
| Docs amont | https://bioperl.org |
| Licence | Artistic-1.0-Perl OR GPL-1.0-or-later |
| Archive source | https://cpan.metacpan.org/authors/id/C/CJ/CJFIELDS/BioPerl-1.7.8.tar.gz |
| Mis à jour | 2026-04-20T03:46:02Z |
| Pulse | updated |
| Dépendances de compilation | pkgconf |
| Bibliothèques fournies par macOS | expat, libxml2, perl |
| Bouteille | disponible (arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux) |
| post-install Homebrew | non défini |
| Service | aucun déclaré |
piste source
Généré depuis les données du dépôt
Cette page est écrite par scripts/generate-pkg-pages.py. Les déploiements refusent de publier si www/pkg/ est obsolète par rapport aux données locales de paquets.
Sources utilisées
- Geiger risk classifier
- Nucleus package database
- cross-ecosystem install command graph
- package relationship graph
- package version freshness
- package-page enrichment