installation

Commandes d'installation supplémentaires

macOS

Homebrewvérifié · 100%

brew install btllib

local Homebrew formula metadata

Linux

Debian aptvérifié · 92%

sudo apt install btllib-tools

Debian stable package indexes · btllib-tools · Source: deb.debian.org

aperçu

Résumé du paquet

Bioinformatics Technology Lab common code library

Liens du projet

Commandes et alias

indexlr
mi_bf_generate
randseq

historique

Historique du projet et usages

btllib is the Bioinformatics Technology Lab common code library, implemented in C++ with Python wrappers for genomic sequence processing. It packages reusable sequence I/O, hashing, Bloom-filter, and related components used by BTL/Birol Lab bioinformatics tools.

Historique du projet

The public git history starts in July 2019 with licensing, CI, and sequence-code commits. By 2020 the project had v1.0.0 tags, and it continued active releases through at least v1.7.8 in 2026.

The README presents btllib as a C++ library with Python wrappers, Linux and macOS support, Meson/Ninja builds, generated wrappers, Doxygen documentation, and generated executables installed under the package prefix.

Historique d'adoption

The README recommends Conda/Bioconda for users, while Homebrew, Debian, and Ubuntu packaging in the input show that btllib also entered general system package collections. Its JOSS publication in 2022 gave the project a citable software record for research use.

btllib is less a user-facing CLI than a packaged scientific dependency: package managers make its headers, static library, Python wrappers, and helper executables available to bioinformatics pipelines.

Modes d'utilisation

Developers link C++ code against libbtllib, include btllib headers, or import the generated Python wrappers. Runtime workflows can rely on external tools such as SAMtools and compression utilities, and btllib-generated executables are installed under the package prefix's bin directory.

Pourquoi les passionnés de paquets s'y intéressent

btllib matters in package history because it is research infrastructure: a shared lab library that crossed from source builds into Bioconda, Homebrew, Debian, and Ubuntu, while carrying a formal software citation through JOSS.

Chronologie

2019: Public repository history starts with license, CI, and sequence-code setup.
2020: v1.0.0 appears in git history.
2022: JOSS publishes the btllib software paper.
2026: v1.7.8 appears in git history.

Related projects

The README credits ntHash, MIBloomFilter, aaHash, cpptoml, and sdsl-lite components or dependencies.
The README documents SAMtools and compression tools as runtime dependencies for particular file formats and workflows.
Bioconda is the recommended user installation channel in the README.

Sources

JOSS page records the 2022 paper 'btllib: A C++ library with Python interface for efficient genomic sequence processing': https://joss.theoj.org/papers/10.21105/joss.04720
Local git history from https://github.com/bcgsc/btllib shows first commits in 2019, v1.0.0 in 2020, and v1.7.8 in 2026.
Official README describes btllib as a Bioinformatics Technology Lab common code library in C++ with Python wrappers: https://raw.githubusercontent.com/bcgsc/btllib/master/README.md
Official README documents Conda/Bioconda installation, C++ linking, Python wrappers, executables, developer commands, credits, and citation instructions: https://raw.githubusercontent.com/bcgsc/btllib/master/README.md
Package-manager adoption from source_facts.package-manager.

posture de sécurité

Niveau de risque : vert

library-like package without higher-risk signals.

Classificateur de risque

risque vert · confiance faible · appliance

Pourquoi

library-like package without higher-risk signals

Signaux

metadata:library-like

Comportement d'installation

Aucun hook post-install Homebrew n’est enregistré dans les métadonnées de formule.
Les métadonnées de bottle Homebrew sont disponibles pour 6 plateformes.
S’installe avec 1 dépendances d’exécution.
Les métadonnées de compilation listent 4 dépendances de compilation.

Revue recommandée

Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.

exécutables

Exécutables installés

Commande	Type	Exposition
`indexlr`	cli	exécutable global
`mi_bf_generate`	cli	exécutable global
`randseq`	cli	exécutable global

fraîcheur

Version et fraîcheur

Ces signaux séparent l'âge de génération de la page, l'activité du gestionnaire de paquets et la comparaison avec les versions amont. Un retard de version n'est signalé que lorsqu'une URL de preuve et des versions comparables sont présentes.

page générée2026-07-08

version du gestionnaire1.7.8

gestionnaire mis à jour2026-07-04

données localesOK

amontnot checked

dernière version détectéenon détecté

https://github.com/BirolLab/btllib

infoNo cached GitHub release or tag data was available.https://github.com/BirolLab/btllibconfiance none

métadonnées d'installation

Métadonnées du paquet

Clé du paquet	brew:btllib
Version	1.7.8
Gestionnaire de paquets	Homebrew
Page du gestionnaire de paquets	https://formulae.brew.sh/formula/btllib
Page d'accueil	https://github.com/BirolLab/btllib
Dépôt	https://github.com/BirolLab/btllib
Docs amont	https://birollab.github.io/btllib
Licence	GPL-3.0-or-later
Archive source	https://github.com/BirolLab/btllib/releases/download/v1.7.8/btllib-1.7.8.tar.gz
Dernière mise à jour	2026-07-04T16:53:42+09:00
Pulse	updated
Dépendances	libomp
Dépendances de compilation	cmake, meson, ninja, python@3.14
Bouteille	disponible (sur arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
post-install Homebrew	non défini
Service	aucun déclaré

faits du registre

Détails de la base source

Source Database	Homebrew formula API
Tap	homebrew/core
Full Name	btllib
Version Scheme	0
Revision	0
Bottle Stable Root URL	https://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecated	no
Disabled	no
Keg Only	no
URL Keys	stable

correspondances dans les bases sources

Autres enregistrements de gestionnaires de paquets

Les correspondances proviennent d’index externes de gestionnaires de paquets et restent séparées des liens de paquets Automic Vault locaux.

Debian apt95%

btllib-tools 1.7.5+dfsg-2

Bioinformatics Technology Lab common code library tools

https://github.com/bcgsc/btllib

sudo apt install btllib-tools

Section: science
Architecture: amd64
Source Package: btllib
7 Dépendances
normalized package name match
Correspondance par : Btllib

Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: btllib-tools from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz

Debian apt95%

libbtllib-dev 1.7.5+dfsg-2

Bioinformatics Technology Lab common code library

https://github.com/bcgsc/btllib

sudo apt install libbtllib-dev

Section: libdevel
Architecture: amd64
Source Package: btllib
3 Dépendances
1 dépendances optionnelles
normalized package name match
Correspondance par : Btllib

Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: libbtllib-dev from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz

Ubuntu apt95%

btllib-tools 1.4.10+dfsg-1ubuntu2

Bioinformatics Technology Lab common code library tools

https://github.com/bcgsc/btllib

sudo apt install btllib-tools

Section: universe/science
Architecture: amd64
Source Package: btllib
5 Dépendances
normalized package name match
Correspondance par : Btllib

Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: btllib-tools from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz

Ubuntu apt95%

libbtllib-dev 1.4.10+dfsg-1ubuntu2

Bioinformatics Technology Lab common code library

https://github.com/bcgsc/btllib

sudo apt install libbtllib-dev

Section: universe/libdevel
Architecture: amd64
Source Package: btllib
3 Dépendances
1 dépendances optionnelles
normalized package name match
Correspondance par : Btllib

Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: libbtllib-dev from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz

graphe de paquets

Les liens viennent du graphe local de relations entre paquets, des suppléments, des dépendances, des correspondances d'écosystèmes et de l'appartenance aux hubs.

piste source

Généré depuis les données du dépôt

Cette page est servie par av-web depuis l'artéfact SQLite privé des paquets généré par scripts/generate-pkg-sqlite.py.

Combined YAML source

View the package source record on GitHub.

combined/btllib.yml

Sources utilisées

Geiger risk classifier
Nucleus package database
av.db category and tag curation
cross-ecosystem install command graph
curated package history
external package-manager database matches
package relationship graph
package version freshness
package-page enrichment

Installer btllib avec Homebrew, apt

Commandes d'installation supplémentaires

macOS

Linux

Résumé du paquet

Liens du projet

Commandes et alias

Historique du projet et usages

Historique du projet

Historique d'adoption

Modes d'utilisation

Pourquoi les passionnés de paquets s'y intéressent

Chronologie

Related projects

Sources

Niveau de risque : vert

Classificateur de risque

Pourquoi

Signaux

Comportement d'installation

Revue recommandée

Exécutables installés

Version et fraîcheur

Métadonnées du paquet

Détails de la base source

Autres enregistrements de gestionnaires de paquets

Liens internes de paquets

Hubs thématiques

Outils liés

Même workflow

Guides de sécurité des agents

Généré depuis les données du dépôt

Combined YAML source

Sources utilisées