installation

Commandes d'installation supplémentaires

macOS

Homebrewvérifié · 100%

brew install biodiff

local Homebrew formula metadata

Linux

Nixvérifié · 92%

nix profile install nixpkgs#biodiff

nixpkgs package indexes · pkgs/by-name/bi/biodiff/package.nix · Source: api.github.com

Arch Linux pacmanvérifié · 92%

sudo pacman -S biodiff

Arch Linux sync databases · biodiff · Source: geo.mirror.pkgbuild.com

openSUSE zyppervérifié · 92%

sudo zypper install biodiff

openSUSE Tumbleweed package metadata · biodiff · Source: download.opensuse.org

Windows

Scoopvérifié · 92%

scoop install main/biodiff

Scoop official bucket manifest trees · bucket/biodiff.json · Source: api.github.com

Windows Package Managervérifié · 92%

winget install --id 8051Enthusiast.biodiff -e

Windows Package Manager source index · 8051Enthusiast.biodiff · Source: cdn.winget.microsoft.com

aperçu

Résumé du paquet

Hex diff viewer using alignment algorithms from biology

Liens du projet

Commandes et alias

biodiff
git-biodiff

historique

Historique du projet et usages

biodiff is an interactive binary diff viewer that borrows biological sequence-alignment algorithms to line up similar regions of two binary files.

Historique du projet

The 8051Enthusiast/biodiff repository was created in May 2021. The README describes the tool as a binary diff viewer that displays two files side by side, pads missing bytes, and uses alignment algorithms from WFA2 or rust-bio, libraries normally associated with DNA sequence alignment.

Historique d'adoption

biodiff reached a 1.0.0 release in February 2022 and a 1.2.x series in April 2024. The input package metadata lists Homebrew, Nix, Arch/pacman, Scoop, Winget, and openSUSE/zypper, showing adoption across Unix, Windows package-manager, and Rust-adjacent channels.

Modes d'utilisation

Users run `biodiff file_a file_b` for a terminal hex view, then switch between unaligned and aligned views, align regions near the cursor, do global or semiglobal alignment for smaller inputs, and optionally print diffs directly with `biodiff --print`.

The README notes that global alignment has quadratic time and space costs and is not a good fit for large files, which is a useful package-level expectation for people comparing firmware chunks or binary formats.

Pourquoi les passionnés de paquets s'y intéressent

biodiff is interesting because it smuggles a bioinformatics idea into reverse-engineering tooling. The package name is literal: binary diffing improved by sequence alignment.

Chronologie

2021: Repository created and first v0.1.2 release published.
2022: v1.0.0 released.
2023: v1.1.0 released.
2024: v1.2.1 released.

Related projects

biodiff is related to WFA2-lib, rust-bio, cursive, hex viewers, binary diff tools, and `git difftool` workflows through its `git-biodiff` executable.

Sources

https://github.com/8051Enthusiast/biodiff
https://github.com/8051Enthusiast/biodiff/releases
https://raw.githubusercontent.com/8051Enthusiast/biodiff/main/README.md
source_facts.package-manager

posture de sécurité

Niveau de risque : vert

narrow executable package without higher-risk signals.

Classificateur de risque

risque vert · confiance faible · appliance

Pourquoi

narrow executable package without higher-risk signals

Signaux

metadata:no-higher-risk-signals

Comportement d'installation

Aucun hook post-install Homebrew n’est enregistré dans les métadonnées de formule.
Les métadonnées de bottle Homebrew sont disponibles pour 10 plateformes.
Les métadonnées de compilation listent 2 dépendances de compilation.

Revue recommandée

Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.

local files

Configuration and credential file locations

These source-backed paths show where this package keeps local settings or durable credentials. Automic Vault can use them as review targets for secret scanning, migration, and command approval.

Configuration files

Config paths the tool may read or write during local use.

Linux: $BIODIFF_CONFIG_DIR/config.json$XDG_CONFIG_HOME/biodiff/config.json~/.config/biodiff/config.json
macOS: $BIODIFF_CONFIG_DIR/config.json~/Library/Application Support/biodiff/config.json
Windows: %BIODIFF_CONFIG_DIR%\config.json%APPDATA%\biodiff\config.json

exécutables

Exécutables installés

Commande	Type	Exposition	Note
`biodiff`	cli	exécutable global
`git-biodiff`	cli	exécutable global

fraîcheur

Version et fraîcheur

Ces signaux séparent l'âge de génération de la page, l'activité du gestionnaire de paquets et la comparaison avec les versions amont. Un retard de version n'est signalé que lorsqu'une URL de preuve et des versions comparables sont présentes.

page générée2026-07-10

version du gestionnaire1.2.1

gestionnaire mis à jour

données localesOK

amontnot checked

dernière version détectéenon détecté

https://github.com/8051Enthusiast/biodiff

infoNo package-manager update timestamp was available.confiance faible
infoNo cached GitHub release or tag data was available.https://github.com/8051Enthusiast/biodiffconfiance none

métadonnées d'installation

Métadonnées du paquet

Clé du paquet	brew:biodiff
Version	1.2.1
Gestionnaire de paquets	Homebrew
Page du gestionnaire de paquets	https://formulae.brew.sh/formula/biodiff
Page d'accueil	https://github.com/8051Enthusiast/biodiff
Dépôt	https://github.com/8051Enthusiast/biodiff
Docs amont	https://github.com/8051Enthusiast/biodiff#readme
Licence	MIT
Archive source	https://github.com/8051Enthusiast/biodiff.git
Dépendances de compilation	cmake, rust
Bibliothèques fournies par macOS	llvm
Bouteille	disponible (sur arm64_linux, arm64_monterey, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, arm64_ventura, monterey, sonoma, ventura, x86_64_linux)
post-install Homebrew	non défini
Service	aucun déclaré

faits du registre

Détails de la base source

Source Database	Homebrew formula API
Tap	homebrew/core
Full Name	biodiff
Version Scheme	0
Revision	0
Head Version	HEAD
Bottle Stable Root URL	https://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecated	no
Disabled	no
Keg Only	no
URL Keys	head stable

correspondances dans les bases sources

Autres enregistrements de gestionnaires de paquets

Les correspondances proviennent d’index externes de gestionnaires de paquets et restent séparées des liens de paquets Automic Vault locaux.

Nix95%

biodiff

nix profile install nixpkgs#biodiff

normalized package name match
Correspondance par : Biodiff

nixpkgs package indexes · api.github.com · nixpkgs package indexes: pkgs/by-name/bi/biodiff/package.nix from https://api.github.com/repos/NixOS/nixpkgs/git/trees/master?recursive=1

pacman95%

biodiff 1.2.1-2

Hex diff viewer using alignment algorithms from biology

https://github.com/8051Enthusiast/biodiff

sudo pacman -S biodiff

License: MIT
Architecture: x86_64
2 Dépendances
normalized package name match
Correspondance par : Biodiff

Arch Linux sync databases · geo.mirror.pkgbuild.com · Arch Linux sync databases: biodiff from https://geo.mirror.pkgbuild.com/extra/os/x86_64/extra.db.tar.gz

zypper95%

biodiff 1.2.1-1.3

A tool for binary diffing

https://github.com/8051Enthusiast/

sudo zypper install biodiff

License: MIT
Category: Development/Tools/Other
Architecture: x86_64
Source Package: biodiff
4 Dépendances
1 fournit
normalized package name match
Correspondance par : Biodiff

openSUSE Tumbleweed package metadata · download.opensuse.org · openSUSE Tumbleweed package metadata: biodiff from https://download.opensuse.org/tumbleweed/repo/oss/repodata/be8d3611d25469107f32075a1697e69ec57a2b850b42348a658cc671ad5ec2b50760d02c3e59524d50da9a11d5be799bdaffba2e166e8ca8858512e3c0bd665d-primary.xml.zst

Scoop95%

main/biodiff

scoop install main/biodiff

normalized package name match
Correspondance par : Biodiff

Scoop official bucket manifest trees · api.github.com · Scoop official bucket manifest trees: bucket/biodiff.json from https://api.github.com/repos/ScoopInstaller/Main/git/trees/master?recursive=1

winget95%

8051Enthusiast.biodiff

winget install --id 8051Enthusiast.biodiff -e

normalized package name match
Correspondance par : Biodiff

Windows Package Manager source index · cdn.winget.microsoft.com · Windows Package Manager source index: 8051Enthusiast.biodiff from https://cdn.winget.microsoft.com/cache/source.msix

graphe de paquets

Les liens viennent du graphe local de relations entre paquets, des suppléments, des dépendances, des correspondances d'écosystèmes et de l'appartenance aux hubs.

piste source

Généré depuis les données du dépôt

Cette page est servie par av-web depuis l'artéfact SQLite privé des paquets généré par scripts/generate-pkg-sqlite.py.

Combined YAML source

View the package source record on GitHub.

combined/biodiff.yml

Sources utilisées

Geiger risk classifier
Nucleus package database
av.db category and tag curation
cross-ecosystem install command graph
curated configuration and credential file locations
curated package history
external package-manager database matches
package relationship graph
package version freshness
package-page enrichment

Installer biodiff avec Homebrew, Nix, pacman, zypper, scoop, winget