インストール

追加のインストールコマンド

macOS

Homebrew確認済み · 100%

brew install morpheus

local Homebrew formula metadata

概要

パッケージ概要

Modeling environment for multi-cellular systems biology

プロジェクトリンク

コマンドとエイリアス

morpheus
morpheus-gui

履歴

プロジェクトの歴史と使われ方

Morpheus is a TU Dresden-centered modeling and simulation environment for multiscale and multicellular systems biology. The project page describes it as a tool for coupling ordinary differential equations, partial differential equations, and cellular Potts models in 2D or 3D, with a declarative GUI workflow and a MorpheusML model-description language. The GitLab project credits Jörn Starruß, Justin Bürger, and other TU Dresden contributors.

プロジェクトの歴史

A major milestone for the software was the 2014 Bioinformatics article by Jörn Starruß, Walter de Back, Lutz Brusch, and Andreas Deutsch, which presented Morpheus as a user-friendly environment for integrating cell-based models with ODE and reaction-diffusion systems. The paper emphasized model construction in biological and mathematical terms rather than programming code, plus support for simulation, visualization, archiving, and batch processing.

使われ方

In practice, Morpheus is used by computational biology researchers and educators to build shareable multicellular models, run simulations, visualize output, and perform parameter scans. Its package-manager role is unusual for Homebrew: it ships both command-line and GUI entry points, making a research desktop application available through a developer-oriented package manager.

ソース

セキュリティ状態

保護ツール対応はまだ見つかっていません

morpheus に一致するローカルシークレット処理マニフェストは見つかりませんでした。将来の対応で安定したパッケージ URL を使えるよう、Nucleus パッケージメタデータはここに公開されています。

インストール挙動

Homebrew はこの formula に post-install フックを宣言しています。
Homebrew bottle メタデータは 6 個のプラットフォームターゲットで利用できます。
6 件の実行時依存関係とともにインストールされます。
ビルドメタデータには 3 件のビルド依存関係があります。

推奨レビュー

エージェントに無人実行させる前に、このツールが平文の認証情報を読むか、リモート状態を書き込むか、成果物を公開するか、プラグインを起動するかを確認してください。

実行可能ファイル

インストールされる実行可能ファイル

コマンド	種類	公開範囲	メモ
`morpheus`	cli	グローバル実行可能ファイル
`morpheus-gui`	cli	グローバル実行可能ファイル

鮮度

バージョンと鮮度

これらの信号は、ページ生成時期、パッケージマネージャの活動、上流リリース比較を分けて示します。バージョン遅れは、証拠 URL と比較可能なバージョンがある場合だけ警告されます。

ページ生成日2026-07-25

マネージャ版2.4.1

マネージャ更新日2026-05-19

ローカルデータOK

上流not checked

検出された最新未検出

https://morpheus.gitlab.io/

情報Release/tag comparison is only available for GitHub repositories.https://morpheus.gitlab.io/信頼度 none

インストールメタデータ

パッケージメタデータ

パッケージキー	brew:morpheus
バージョン	2.4.1
パッケージマネージャ	Homebrew
パッケージマネージャページ	https://formulae.brew.sh/formula/morpheus
ホームページ	https://morpheus.gitlab.io/
リポジトリ	https://gitlab.com/morpheus.lab/morpheus
上流ドキュメント	https://github.com/rnwood/morpheus#readme
ライセンス	BSD-3-Clause
ソースアーカイブ	https://gitlab.com/morpheus.lab/morpheus/-/archive/v2.4.1/morpheus-v2.4.1.tar.gz
最終更新	2026-05-19T21:33:02Z
Pulse	updated
依存関係	boost, ffmpeg, graphviz, libomp, libtiff, qt@5
ビルド依存関係	cmake, doxygen, ninja
macOS 提供ライブラリ	bzip2, libxml2
Bottle	利用可能 (対象 arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
Homebrew post-install	定義済み
サービス	宣言なし

レジストリ情報

ソースデータベース詳細

Source Database	Homebrew formula API
Tap	homebrew/core
Full Name	morpheus
Version Scheme	0
Revision	0
Bottle Stable Root URL	https://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecated	yes
Disabled	no
Keg Only	no
URL Keys	stable

パッケージグラフ

リンクは、ローカルのパッケージ関係グラフ、補足データ、依存関係、エコシステム一致、パッケージハブ所属から来ています。

ソース経路

リポジトリデータから生成

このページは scripts/generate-pkg-sqlite.py が生成した非公開のパッケージ SQLite アーティファクトから av-web によって提供されます。

Combined YAML source

View the package source record on GitHub.

combined/morpheus.yml

使用ソース

Geiger risk classifier
Nucleus package database
av.db category and tag curation
cross-ecosystem install command graph
curated package history
package relationship graph
package version freshness
package-page enrichment

morpheus を Homebrew でインストール