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brew

Installer tabixpp avec Homebrew, apt, zypper

Consultez les chemins d'installation, exécutables, métadonnées et notes de sécurité de tabixpp pour les workflows d'agents IA.

installation

Commandes d'installation supplémentaires

macOS

Homebrewvérifié · 100%
brew install tabixpp

local Homebrew formula metadata

Linux

Debian aptvérifié · 92%
sudo apt install tabix

Debian stable package indexes · tabix · Source: deb.debian.org

openSUSE zyppervérifié · 92%
sudo zypper install tabix

openSUSE Tumbleweed package metadata · tabix · Source: download.opensuse.org

aperçu

Résumé du paquet

C++ wrapper to tabix indexer

Commandes et alias

  • tabix++

historique

Historique du projet et usages

tabixpp is a small C++ wrapper around tabix for opening and jumping through tabix-indexed genomics files.

Historique du projet

The README identifies tabixpp as a wrapper around the tabix project and names Erik Garrison as author. GitHub repository metadata records the public repository creation in May 2011.

Historique d'adoption

The project is modest but durable: GitHub releases include an initial tagged release in 2015, a Debian-packaging point release in 2019, and later maintenance releases through 2023. The Homebrew input records packaging in Homebrew and maps related distro packages to tabix on Debian, Ubuntu, and openSUSE.

Modes d'utilisation

The README emphasizes building with the htslib submodule and testing with make. Its value is in C++ code that wants a smaller abstraction over tabix-indexed files rather than invoking tabix directly.

Pourquoi les passionnés de paquets s'y intéressent

Package maintainers care because tabixpp is a thin compatibility layer in bioinformatics dependency graphs: it pulls in htslib-style native dependencies such as libcurl, zlib, and liblzma, and it is often packaged to satisfy genomics tools that expect the wrapper.

Chronologie

  • 2011: The public GitHub repository was created.
  • 2015: GitHub releases show v1.0.0 as the initial tagged release.
  • 2019: GitHub releases show v1.1.0 as a point release for Debian packaging.
  • 2023: GitHub releases show v1.1.2 published as minor updates.

Related projects

  • The README links tabix, htslib, libcurl, zlib, and liblzma as related projects or dependencies.

posture de sécurité

Niveau de risque : vert

narrow executable package without higher-risk signals.

Classificateur de risque

risque vert · confiance faible · appliance

Pourquoi

  • narrow executable package without higher-risk signals

Signaux

  • metadata:no-higher-risk-signals

Comportement d'installation

  • Aucun hook post-install Homebrew n’est enregistré dans les métadonnées de formule.
  • Les métadonnées de bottle Homebrew sont disponibles pour 6 plateformes.
  • S’installe avec 2 dépendances d’exécution.

Revue recommandée

Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.

exécutables

Exécutables installés

CommandeTypeExpositionNote
tabix++cliexécutable global

fraîcheur

Version et fraîcheur

Ces signaux séparent l'âge de génération de la page, l'activité du gestionnaire de paquets et la comparaison avec les versions amont. Un retard de version n'est signalé que lorsqu'une URL de preuve et des versions comparables sont présentes.

page générée2026-07-10
version du gestionnaire1.1.2
gestionnaire mis à jour2026-06-25
données localesOK
amontà jour
dernière version détectéev1.1.2

https://github.com/vcflib/tabixpp

  • OKAucun avertissement de fraîcheur n'a été généré.

métadonnées d'installation

Métadonnées du paquet

Clé du paquetbrew:tabixpp
Version1.1.2
Gestionnaire de paquetsHomebrew
Page du gestionnaire de paquetshttps://formulae.brew.sh/formula/tabixpp
Page d'accueilhttps://github.com/vcflib/tabixpp
Dépôthttps://github.com/vcflib/tabixpp
Docs amonthttps://github.com/vcflib/tabixpp#readme
LicenceMIT
Archive sourcehttps://github.com/vcflib/tabixpp/archive/refs/tags/v1.1.2.tar.gz
Dernière mise à jour2026-06-25T13:38:09+02:00
Pulseupdated
Dépendanceshtslib, xz
Bouteilledisponible (sur arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
post-install Homebrewnon défini
Serviceaucun déclaré

faits du registre

Détails de la base source

Source DatabaseHomebrew formula API
Taphomebrew/core
Full Nametabixpp
Version Scheme0
Revision1
Bottle Stable Root URLhttps://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecatedno
Disabledno
Keg Onlyno
URL Keys
  • stable

correspondances dans les bases sources

Autres enregistrements de gestionnaires de paquets

Les correspondances proviennent d’index externes de gestionnaires de paquets et restent séparées des liens de paquets Automic Vault locaux.

Debian apt92%

tabix 1.21+ds-1

generic indexer for TAB-delimited genome position files

https://github.com/samtools/htslib

sudo apt install tabix
  • Section: science
  • Architecture: amd64
  • Source Package: htslib
  • 6 Dépendances
  • installed executable or alias match
  • Correspondance par : Tabix
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: tabix from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz
Ubuntu apt92%

tabix 1.19+ds-1.1build3

generic indexer for TAB-delimited genome position files

https://github.com/samtools/htslib

sudo apt install tabix
  • Section: universe/science
  • Architecture: amd64
  • Source Package: htslib
  • 6 Dépendances
  • installed executable or alias match
  • Correspondance par : Tabix
Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: tabix from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz
zypper92%

tabix 1.21-1.3

Generic indexer for TAB-delimited genome position files from the HTSlib project

https://github.com/samtools/htslib/

sudo zypper install tabix
  • License: MIT
  • Category: Productivity/Scientific/Other
  • Architecture: x86_64
  • Source Package: libhts
  • 10 Dépendances
  • 1 fournit
  • installed executable or alias match
  • Correspondance par : Tabix
openSUSE Tumbleweed package metadata · download.opensuse.org · openSUSE Tumbleweed package metadata: tabix from https://download.opensuse.org/tumbleweed/repo/oss/repodata/be8d3611d25469107f32075a1697e69ec57a2b850b42348a658cc671ad5ec2b50760d02c3e59524d50da9a11d5be799bdaffba2e166e8ca8858512e3c0bd665d-primary.xml.zst

piste source

Généré depuis les données du dépôt

Cette page est servie par av-web depuis l'artéfact SQLite privé des paquets généré par scripts/generate-pkg-sqlite.py.

Sources utilisées

  • Geiger risk classifier
  • Nucleus package database
  • av.db category and tag curation
  • cross-ecosystem install command graph
  • curated package history
  • external package-manager database matches
  • package relationship graph
  • package version freshness
  • package-page enrichment