Installation

Weitere Installationsbefehle

macOS

Homebrewverifiziert · 100%

brew install mrbayes

local Homebrew formula metadata

Linux

Debian aptverifiziert · 92%

sudo apt install mrbayes

Debian stable package indexes · mrbayes · Quelle: deb.debian.org

Nixverifiziert · 92%

nix profile install nixpkgs#mrbayes

nixpkgs package indexes · pkgs/by-name/mr/mrbayes/package.nix · Quelle: api.github.com

Windows

Windows Package Managerverifiziert · 92%

winget install --id NBIS.MrBayes -e

Windows Package Manager source index · NBIS.MrBayes · Quelle: cdn.winget.microsoft.com

Überblick

Paketzusammenfassung

Bayesian inference of phylogenies and evolutionary models

Projektlinks

Befehle und Aliase

mb

Verlauf

Projektgeschichte und Nutzung

MrBayes is a phylogenetics program for Bayesian inference and model choice across evolutionary models. John P. Huelsenbeck and Fredrik Ronquist introduced MRBAYES in Bioinformatics in 2001 as software for Bayesian inference of phylogeny using a variant of Markov chain Monte Carlo. The project later became associated with MrBayes 3, cited for Bayesian phylogenetic inference under mixed models, and MrBayes 3.2, cited for efficient inference and model selection across a large model space.

Projektgeschichte

The program's technical role is to make Bayesian phylogenetic analysis accessible through a command-line tool named mb. The official site lists support for nucleotide, amino-acid, restriction-site, and morphological data; mixed data types in one analysis; partitioned models with linked or unlinked parameters; many nucleotide and amino-acid rate matrices; clock trees; topology constraints; convergence diagnostics; stepping-stone model-likelihood estimation; MPI parallel jobs; BEAGLE acceleration; and checkpointing.

Wie es verwendet wird

MrBayes is a research package more than a general developer tool. Its manual says new users are served by a manual with tutorials, model discussions, FAQ material, and differences between versions 2 and 3, while published analyses are expected to cite the relevant MrBayes papers and optional parallel or BEAGLE-method papers. The GitHub repository notes that after release 3.2.6 in November 2015 the project entered maintenance mode under the National Bioinformatics Infrastructure Sweden, with the original development team still involved and future work oriented mainly toward bug fixes. Package managers expose it as a command-line scientific application for reproducible phylogenetic workflows.

Quellen

Sicherheitslage

Risikostufe: grün

narrow executable package without higher-risk signals.

Risikoklassifikator

grün Risiko · niedrig Konfidenz · appliance

Warum

narrow executable package without higher-risk signals

Signale

metadata:no-higher-risk-signals

Installationsverhalten

In den Formelmetadaten ist kein Homebrew-Post-install-Hook erfasst.
Homebrew-Bottle-Metadaten sind für 6 Plattformziele verfügbar.
Installiert mit 2 Laufzeitabhängigkeiten.
Build-Metadaten listen 1 Build-Abhängigkeiten.

Empfohlene Prüfung

Prüfe vor unbeaufsichtigter Agent-Nutzung, ob das Tool Klartext-Credentials liest, Remote-Zustand schreibt, Artefakte veröffentlicht oder Plugins ausführt.

Executables

Installierte Executables

Befehl	Art	Sichtbarkeit	Hinweis
`mb`	cli	globales Executable

Aktualität

Version und Aktualität

Diese Signale trennen das Alter der Seitengenerierung, Aktivität des Paketmanagers und Upstream-Release-Vergleich. Versionsrückstand wird nur gemeldet, wenn eine Evidenz-URL und vergleichbare Versionen vorhanden sind.

Seite generiert2026-07-08

Manager-Version3.2.7a

Manager aktualisiert

lokale DatenOK

Upstreamnot checked

neueste erkannte Versionnicht erkannt

https://github.com/NBISweden/MrBayes

InfoNo package-manager update timestamp was available.niedrig Konfidenz
InfoNo cached GitHub release or tag data was available.https://github.com/NBISweden/MrBayesnone Konfidenz

Installationsmetadaten

Paketmetadaten

Paketschlüssel	brew:mrbayes
Version	3.2.7a
Paketmanager	Homebrew
Paketmanager-Seite	https://formulae.brew.sh/formula/mrbayes
Homepage	https://nbisweden.github.io/MrBayes/
Repository	https://github.com/NBISweden/MrBayes
Upstream-Dokumentation	https://nbisweden.github.io/MrBayes/manual.html
Lizenz	GPL-3.0-or-later
Quellarchiv	https://github.com/NBISweden/MrBayes/archive/refs/tags/v3.2.7a.tar.gz
Abhängigkeiten	beagle, open-mpi
Build-Abhängigkeiten	pkgconf
Bottle	verfügbar (auf arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
Homebrew post-install	nicht definiert
Dienst	keiner deklariert

Registry-Fakten

Details aus der Quelldatenbank

Source Database	Homebrew formula API
Tap	homebrew/core
Full Name	mrbayes
Version Scheme	0
Revision	0
Head Version	HEAD
Bottle Stable Root URL	https://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecated	no
Disabled	no
Keg Only	no
URL Keys	head stable

Source-Datenbank-Treffer

Andere Paketmanager-Einträge

Treffer stammen aus externen Paketmanager-Indizes und bleiben von lokalen Automic-Vault-Paketlinks getrennt.

Debian apt95%

mrbayes 3.2.7a-7+b1

Bayesian Inference of Phylogeny

http://mrbayes.csit.fsu.edu/

sudo apt install mrbayes

Section: science
Architecture: amd64
Source Package: mrbayes
3 Abhängigkeiten
1 optionale Abhängigkeiten
normalized package name match
Abgeglichen nach: Mrbayes

Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: mrbayes from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz

Debian apt95%

mrbayes-doc 3.2.7a-7

Bayesian Inference of Phylogeny - manual

http://mrbayes.csit.fsu.edu/

sudo apt install mrbayes-doc

Section: doc
Architecture: all
Source Package: mrbayes
normalized package name match
Abgeglichen nach: Mrbayes

Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: mrbayes-doc from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz

Debian apt95%

mrbayes-mpi 3.2.7a-7+b1

Bayesian Inference of Phylogeny - mpi version

http://mrbayes.csit.fsu.edu/

sudo apt install mrbayes-mpi

Section: science
Architecture: amd64
Source Package: mrbayes
5 Abhängigkeiten
2 optionale Abhängigkeiten
normalized package name match
Abgeglichen nach: Mrbayes

Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: mrbayes-mpi from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz

Nix95%

mrbayes

nix profile install nixpkgs#mrbayes

normalized package name match
Abgeglichen nach: Mrbayes

nixpkgs package indexes · api.github.com · nixpkgs package indexes: pkgs/by-name/mr/mrbayes/package.nix from https://api.github.com/repos/NixOS/nixpkgs/git/trees/master?recursive=1

Ubuntu apt95%

mrbayes 3.2.7a-7build2

Bayesian Inference of Phylogeny

http://mrbayes.csit.fsu.edu/

sudo apt install mrbayes

Section: universe/math
Architecture: amd64
3 Abhängigkeiten
1 optionale Abhängigkeiten
normalized package name match
Abgeglichen nach: Mrbayes

Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: mrbayes from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz

Ubuntu apt95%

mrbayes-doc 3.2.7a-7build2

Bayesian Inference of Phylogeny - manual

http://mrbayes.csit.fsu.edu/

sudo apt install mrbayes-doc

Section: universe/doc
Architecture: all
Source Package: mrbayes
normalized package name match
Abgeglichen nach: Mrbayes

Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: mrbayes-doc from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz

Ubuntu apt95%

mrbayes-mpi 3.2.7a-7build2

Bayesian Inference of Phylogeny - mpi version

http://mrbayes.csit.fsu.edu/

sudo apt install mrbayes-mpi

Section: universe/science
Architecture: amd64
Source Package: mrbayes
5 Abhängigkeiten
2 optionale Abhängigkeiten
normalized package name match
Abgeglichen nach: Mrbayes

Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: mrbayes-mpi from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz

winget95%

NBIS.MrBayes

winget install --id NBIS.MrBayes -e

normalized package name match
Abgeglichen nach: Mrbayes

Windows Package Manager source index · cdn.winget.microsoft.com · Windows Package Manager source index: NBIS.MrBayes from https://cdn.winget.microsoft.com/cache/source.msix

Paketgraph

Links stammen aus dem lokalen Paketbeziehungsgraph, Ergänzungen, Abhängigkeitskanten, Ecosystem-Matches und Paket-Hub-Mitgliedschaft.

Quellspur

Aus Repository-Daten generiert

Diese Seite wird von av-web aus dem privaten Paket-SQLite-Artefakt bereitgestellt, das scripts/generate-pkg-sqlite.py erstellt.

Combined YAML source

View the package source record on GitHub.

combined/mrbayes.yml

Verwendete Quellen

Geiger risk classifier
Nucleus package database
av.db category and tag curation
cross-ecosystem install command graph
curated package history
external package-manager database matches
package relationship graph
package version freshness
package-page enrichment

mrbayes mit Homebrew, apt, Nix, winget installieren

Weitere Installationsbefehle

macOS

Linux

Windows

Paketzusammenfassung

Projektlinks

Befehle und Aliase

Projektgeschichte und Nutzung

Projektgeschichte

Wie es verwendet wird

Quellen

Risikostufe: grün

Risikoklassifikator

Warum

Signale

Installationsverhalten

Empfohlene Prüfung

Installierte Executables

Version und Aktualität

Paketmetadaten

Details aus der Quelldatenbank

Andere Paketmanager-Einträge

Interne Paketlinks

Themen-Hubs

Verwandte Tools

Gleicher Workflow

Agent-Sicherheitsleitfäden

Aus Repository-Daten generiert

Combined YAML source

Verwendete Quellen