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brew

paml mit Homebrew, apt, Nix installieren

Prüfe Installationswege, Executables, Metadaten und Sicherheitshinweise für paml in AI-Agent-Workflows.

InstallationsbefehlSicherheitshinweise

Installation

Weitere Installationsbefehle

macOS

Homebrewverifiziert · 100%
brew install paml

local Homebrew formula metadata

Linux

Debian aptverifiziert · 92%
sudo apt install paml

Debian stable package indexes · paml · Quelle: deb.debian.org

Nixverifiziert · 92%
nix profile install nixpkgs#paml

nixpkgs package indexes · pkgs/by-name/pa/paml/package.nix · Quelle: api.github.com

Überblick

Paketzusammenfassung

Phylogenetic analyses of DNA or protein sequences using maximum likelihood

Befehle und Aliase

  • baseml
  • basemlg
  • chi2
  • codeml
  • evolver
  • infinitesites
  • mcmctree
  • pamp
  • yn00

Sicherheitslage

Risikostufe: grün

narrow executable package without higher-risk signals.

Risikoklassifikator

grün Risiko · niedrig Konfidenz · appliance

Warum

  • narrow executable package without higher-risk signals

Signale

  • metadata:no-higher-risk-signals

Installationsverhalten

  • In den Formelmetadaten ist kein Homebrew-Post-install-Hook erfasst.
  • Homebrew-Bottle-Metadaten sind für 6 Plattformziele verfügbar.

Empfohlene Prüfung

Prüfe vor unbeaufsichtigter Agent-Nutzung, ob das Tool Klartext-Credentials liest, Remote-Zustand schreibt, Artefakte veröffentlicht oder Plugins ausführt.

Executables

Installierte Executables

BefehlArtSichtbarkeitHinweis
basemlcliglobales Executable
basemlgcliglobales Executable
chi2cliglobales Executable
codemlcliglobales Executable
evolvercliglobales Executable
infinitesitescliglobales Executable
mcmctreecliglobales Executable
pampcliglobales Executable
yn00cliglobales Executable

Aktualität

Version und Aktualität

Diese Signale trennen das Alter der Seitengenerierung, Aktivität des Paketmanagers und Upstream-Release-Vergleich. Versionsrückstand wird nur gemeldet, wenn eine Evidenz-URL und vergleichbare Versionen vorhanden sind.

Seite generiert2026-07-08
Manager-Version4.10.10
Manager aktualisiert2026-05-03
lokale DatenOK
Upstreamaktuell
neueste erkannte Versionv4.10.10

https://github.com/abacus-gene/paml

  • OKEs wurden keine Aktualitätswarnungen generiert.

Installationsmetadaten

Paketmetadaten

Paketschlüsselbrew:paml
Version4.10.10
PaketmanagerHomebrew
Paketmanager-Seitehttps://formulae.brew.sh/formula/paml
Homepagehttps://github.com/abacus-gene/paml
Repositoryhttps://github.com/abacus-gene/paml
Upstream-Dokumentationhttps://github.com/abacus-gene/paml/wiki
LizenzGPL-3.0-only
Quellarchivhttps://github.com/abacus-gene/paml/archive/refs/tags/v4.10.10.tar.gz
Zuletzt aktualisiert2026-05-03T17:51:16+02:00
Pulseupdated
Bottleverfügbar (auf arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
Homebrew post-installnicht definiert
Dienstkeiner deklariert

Registry-Fakten

Details aus der Quelldatenbank

Source DatabaseHomebrew formula API
Taphomebrew/core
Full Namepaml
Version Scheme0
Revision0
Bottle Stable Root URLhttps://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecatedno
Disabledno
Keg Onlyno
URL Keys
  • stable

Source-Datenbank-Treffer

Andere Paketmanager-Einträge

Treffer stammen aus externen Paketmanager-Indizes und bleiben von lokalen Automic-Vault-Paketlinks getrennt.

Debian apt95%

paml 4.9j+dfsg-6

Phylogenetic Analysis by Maximum Likelihood (PAML)

http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/paml.html

sudo apt install paml
  • Section: science
  • Architecture: amd64
  • 1 Abhängigkeiten
  • normalized package name match
  • Abgeglichen nach: Paml
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: paml from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz
Debian apt95%

paml-doc 4.9j+dfsg-6

Documentation for PAML

http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/paml.html

sudo apt install paml-doc
  • Section: doc
  • Architecture: all
  • Source Package: paml
  • normalized package name match
  • Abgeglichen nach: Paml
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: paml-doc from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz
Nix95%

paml

nix profile install nixpkgs#paml
  • normalized package name match
  • Abgeglichen nach: Paml
nixpkgs package indexes · api.github.com · nixpkgs package indexes: pkgs/by-name/pa/paml/package.nix from https://api.github.com/repos/NixOS/nixpkgs/git/trees/master?recursive=1
Ubuntu apt95%

paml 4.9j+dfsg-4

Phylogenetic Analysis by Maximum Likelihood (PAML)

http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/paml.html

sudo apt install paml
  • Section: universe/science
  • Architecture: amd64
  • 1 Abhängigkeiten
  • normalized package name match
  • Abgeglichen nach: Paml
Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: paml from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz
Ubuntu apt95%

paml-doc 4.9j+dfsg-4

Documentation for PAML

http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/paml.html

sudo apt install paml-doc
  • Section: universe/doc
  • Architecture: all
  • Source Package: paml
  • normalized package name match
  • Abgeglichen nach: Paml
Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: paml-doc from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz
Debian apt92%

evolver 2.70+ds-8

Surface Evolver

https://facstaff.susqu.edu/brakke/evolver/evolver.html

sudo apt install evolver
  • Section: math
  • Architecture: all
  • 2 Abhängigkeiten
  • installed executable or alias match
  • Abgeglichen nach: Evolver
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: evolver from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz
Debian apt92%

evolver-doc 2.70+ds-8

Surface Evolver - doc

https://facstaff.susqu.edu/brakke/evolver/evolver.html

sudo apt install evolver-doc
  • Section: doc
  • Architecture: all
  • Source Package: evolver
  • 2 optionale Abhängigkeiten
  • installed executable or alias match
  • Abgeglichen nach: Evolver
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: evolver-doc from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz
Debian apt92%

evolver-nox 2.70+ds-8+b2

Surface Evolver - with no X support

https://facstaff.susqu.edu/brakke/evolver/evolver.html

sudo apt install evolver-nox
  • Section: math
  • Architecture: amd64
  • Source Package: evolver
  • 3 Abhängigkeiten
  • 1 stellt bereit
  • 2 optionale Abhängigkeiten
  • installed executable or alias match
  • Abgeglichen nach: Evolver
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: evolver-nox from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz
Debian apt92%

evolver-ogl 2.70+ds-8+b2

Surface Evolver - with OpenGL display

https://facstaff.susqu.edu/brakke/evolver/evolver.html

sudo apt install evolver-ogl
  • Section: math
  • Architecture: amd64
  • Source Package: evolver
  • 7 Abhängigkeiten
  • 1 stellt bereit
  • 2 optionale Abhängigkeiten
  • installed executable or alias match
  • Abgeglichen nach: Evolver
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: evolver-ogl from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz

Paketgraph

Links stammen aus dem lokalen Paketbeziehungsgraph, Ergänzungen, Abhängigkeitskanten, Ecosystem-Matches und Paket-Hub-Mitgliedschaft.

Gleicher Workflow

  • fastmeShares av.db curated category or tags: bioinformatics, cli, phylogenetics, science.
  • trimalShares av.db curated category or tags: bioinformatics, cli, phylogenetics, science.
  • veryfasttreeShares av.db curated category or tags: bioinformatics, cli, phylogenetics, science.
  • iqtree3Shares av.db curated category or tags: bioinformatics, cli, maximum-likelihood, phylogenetics, science.
  • raxml-ngShares av.db curated category or tags: bioinformatics, cli, maximum-likelihood, phylogenetics, science.
  • bbtoolsShares av.db curated category or tags: bioinformatics, cli, dna, science.

Quellspur

Aus Repository-Daten generiert

Diese Seite wird von av-web aus dem privaten Paket-SQLite-Artefakt bereitgestellt, das scripts/generate-pkg-sqlite.py erstellt.

Verwendete Quellen

  • Geiger risk classifier
  • Nucleus package database
  • av.db category and tag curation
  • cross-ecosystem install command graph
  • external package-manager database matches
  • package relationship graph
  • package version freshness
  • package-page enrichment