macOS
Homebrewverifiziert · 100%
brew install diamondlocal Homebrew formula metadata
brew
diamond mit Homebrew, Nix installieren
Prüfe Installationswege, Executables, Metadaten und Sicherheitshinweise für diamond in AI-Agent-Workflows.
Installation
Weitere Installationsbefehle
Linux
Nixverifiziert · 92%
nix profile install nixpkgs#diamondnixpkgs package indexes · pkgs/by-name/di/diamond/package.nix · Quelle: api.github.com
Überblick
Paketzusammenfassung
Accelerated BLAST compatible local sequence aligner
Projektlinks
Befehle und Aliase
- diamond
Verlauf
Projektgeschichte und Nutzung
DIAMOND is a high-performance sequence aligner for protein and translated DNA searches, positioned as a BLAST-compatible tool for large biological datasets.
Projektgeschichte
The README says the initial version was developed by Benjamin J. Buchfink at the Huson lab, University of Tuebingen, from 2013 to 2015. Later development continued independently, with support from an EXIST grant in 2018-2019 and the Max Planck Institute for Biology Tuebingen from 2019 to 2024.
Adoptionsgeschichte
DIAMOND's adoption is tied to its promise of much faster BLAST-like protein and translated DNA alignment. The README highlights 100x to 10,000x BLAST speed, low resource requirements, downloads from GitHub releases, Bioconda availability, Galaxy integration, and citation badges.
Wie es verwendet wird
Package users install DIAMOND when they need command-line database creation, protein search, translated DNA search, sequence clustering, taxonomic classification, or BLAST-style tabular, pairwise, and XML outputs.
Warum Paket-Nerds sich dafür interessieren
DIAMOND is significant because it is a research-grade bioinformatics workhorse that also behaves like a normal packaged CLI. That combination makes it common in reproducible pipelines, containers, Conda environments, Homebrew installs, and HPC workflows.
Zeitleiste
- 2013-2015: Initial version developed at the Huson lab, University of Tuebingen.
- 2015: Original DIAMOND publication cited in the README.
- 2021: Sensitive protein alignments at tree-of-life scale publication cited in the README.
- 2026: v2.2.2 release published on GitHub.
Related projects
- The README frames DIAMOND as BLAST-compatible and links it to Bioconda and the European Galaxy server for workflow use.
Quellen
Sicherheitslage
Noch keine Protected-Tool-Abdeckung gefunden
Für diamond wurde kein passendes lokales Secret-Handling-Manifest gefunden. Nucleus-Paketmetadaten bleiben hier veröffentlicht, damit künftige Abdeckung eine stabile Paket-URL hat.
Installationsverhalten
- In den Formelmetadaten ist kein Homebrew-Post-install-Hook erfasst.
- Homebrew-Bottle-Metadaten sind für 6 Plattformziele verfügbar.
- Build-Metadaten listen 1 Build-Abhängigkeiten.
Empfohlene Prüfung
Prüfe vor unbeaufsichtigter Agent-Nutzung, ob das Tool Klartext-Credentials liest, Remote-Zustand schreibt, Artefakte veröffentlicht oder Plugins ausführt.
Executables
Installierte Executables
| Befehl | Art | Sichtbarkeit | Hinweis |
|---|---|---|---|
diamond | cli | globales Executable |
Aktualität
Version und Aktualität
Diese Signale trennen das Alter der Seitengenerierung, Aktivität des Paketmanagers und Upstream-Release-Vergleich. Versionsrückstand wird nur gemeldet, wenn eine Evidenz-URL und vergleichbare Versionen vorhanden sind.
Seite generiert2026-07-08
Manager-Version2.2.3
Manager aktualisiert2026-07-07
lokale DatenOK
Upstreamaktuell
neueste erkannte Versionv2.2.3
https://github.com/bbuchfink/diamond
- OKEs wurden keine Aktualitätswarnungen generiert.
Installationsmetadaten
Paketmetadaten
| Paketschlüssel | brew:diamond |
|---|---|
| Version | 2.2.3 |
| Paketmanager | Homebrew |
| Paketmanager-Seite | https://formulae.brew.sh/formula/diamond |
| Homepage | https://github.com/bbuchfink/diamond |
| Repository | https://github.com/bbuchfink/diamond |
| Upstream-Dokumentation | https://bbuchfink.github.io/diamond |
| Lizenz | GPL-3.0-or-later |
| Quellarchiv | https://github.com/bbuchfink/diamond/archive/refs/tags/v2.2.3.tar.gz |
| Zuletzt aktualisiert | 2026-07-07T12:34:31Z |
| Pulse | updated |
| Build-Abhängigkeiten | cmake |
| Von macOS bereitgestellte Bibliotheken | sqlite |
| Bottle | verfügbar (auf arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux) |
| Homebrew post-install | nicht definiert |
| Dienst | keiner deklariert |
Registry-Fakten
Details aus der Quelldatenbank
| Source Database | Homebrew formula API |
|---|---|
| Tap | homebrew/core |
| Full Name | diamond |
| Version Scheme | 0 |
| Revision | 0 |
| Bottle Stable Root URL | https://ghcr.io/v2/homebrew/core |
| Deprecated | no |
| Disabled | no |
| Keg Only | no |
| URL Keys |
|
Source-Datenbank-Treffer
Andere Paketmanager-Einträge
Treffer stammen aus externen Paketmanager-Indizes und bleiben von lokalen Automic-Vault-Paketlinks getrennt.
Nix95%
diamond
nix profile install nixpkgs#diamond- normalized package name match
- Abgeglichen nach: Diamond
Quellspur
Aus Repository-Daten generiert
Diese Seite wird von av-web aus dem privaten Paket-SQLite-Artefakt bereitgestellt, das scripts/generate-pkg-sqlite.py erstellt.
Combined YAML source
View the package source record on GitHub.
Verwendete Quellen
- Geiger risk classifier
- Nucleus package database
- av.db category and tag curation
- cross-ecosystem install command graph
- curated package history
- external package-manager database matches
- package relationship graph
- package version freshness
- package-page enrichment