installation

Commandes d'installation supplémentaires

macOS

Homebrewvérifié · 100%

brew install mrbayes

local Homebrew formula metadata

Linux

Debian aptvérifié · 92%

sudo apt install mrbayes

Debian stable package indexes · mrbayes · Source: deb.debian.org

Nixvérifié · 92%

nix profile install nixpkgs#mrbayes

nixpkgs package indexes · pkgs/by-name/mr/mrbayes/package.nix · Source: api.github.com

Windows

Windows Package Managervérifié · 92%

winget install --id NBIS.MrBayes -e

Windows Package Manager source index · NBIS.MrBayes · Source: cdn.winget.microsoft.com

aperçu

Résumé du paquet

Bayesian inference of phylogenies and evolutionary models

Liens du projet

Commandes et alias

mb

historique

Historique du projet et usages

MrBayes is a phylogenetics program for Bayesian inference and model choice across evolutionary models. John P. Huelsenbeck and Fredrik Ronquist introduced MRBAYES in Bioinformatics in 2001 as software for Bayesian inference of phylogeny using a variant of Markov chain Monte Carlo. The project later became associated with MrBayes 3, cited for Bayesian phylogenetic inference under mixed models, and MrBayes 3.2, cited for efficient inference and model selection across a large model space.

Historique du projet

The program's technical role is to make Bayesian phylogenetic analysis accessible through a command-line tool named mb. The official site lists support for nucleotide, amino-acid, restriction-site, and morphological data; mixed data types in one analysis; partitioned models with linked or unlinked parameters; many nucleotide and amino-acid rate matrices; clock trees; topology constraints; convergence diagnostics; stepping-stone model-likelihood estimation; MPI parallel jobs; BEAGLE acceleration; and checkpointing.

Modes d'utilisation

MrBayes is a research package more than a general developer tool. Its manual says new users are served by a manual with tutorials, model discussions, FAQ material, and differences between versions 2 and 3, while published analyses are expected to cite the relevant MrBayes papers and optional parallel or BEAGLE-method papers. The GitHub repository notes that after release 3.2.6 in November 2015 the project entered maintenance mode under the National Bioinformatics Infrastructure Sweden, with the original development team still involved and future work oriented mainly toward bug fixes. Package managers expose it as a command-line scientific application for reproducible phylogenetic workflows.

Sources

posture de sécurité

Niveau de risque : vert

narrow executable package without higher-risk signals.

Classificateur de risque

risque vert · confiance faible · appliance

Pourquoi

narrow executable package without higher-risk signals

Signaux

metadata:no-higher-risk-signals

Comportement d'installation

Aucun hook post-install Homebrew n’est enregistré dans les métadonnées de formule.
Les métadonnées de bottle Homebrew sont disponibles pour 6 plateformes.
S’installe avec 2 dépendances d’exécution.
Les métadonnées de compilation listent 1 dépendances de compilation.

Revue recommandée

Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.

exécutables

Exécutables installés

Commande	Type	Exposition	Note
`mb`	cli	exécutable global

fraîcheur

Version et fraîcheur

Ces signaux séparent l'âge de génération de la page, l'activité du gestionnaire de paquets et la comparaison avec les versions amont. Un retard de version n'est signalé que lorsqu'une URL de preuve et des versions comparables sont présentes.

page générée2026-07-08

version du gestionnaire3.2.7a

gestionnaire mis à jour

données localesOK

amontnot checked

dernière version détectéenon détecté

https://github.com/NBISweden/MrBayes

infoNo package-manager update timestamp was available.confiance faible
infoNo cached GitHub release or tag data was available.https://github.com/NBISweden/MrBayesconfiance none

métadonnées d'installation

Métadonnées du paquet

Clé du paquet	brew:mrbayes
Version	3.2.7a
Gestionnaire de paquets	Homebrew
Page du gestionnaire de paquets	https://formulae.brew.sh/formula/mrbayes
Page d'accueil	https://nbisweden.github.io/MrBayes/
Dépôt	https://github.com/NBISweden/MrBayes
Docs amont	https://nbisweden.github.io/MrBayes/manual.html
Licence	GPL-3.0-or-later
Archive source	https://github.com/NBISweden/MrBayes/archive/refs/tags/v3.2.7a.tar.gz
Dépendances	beagle, open-mpi
Dépendances de compilation	pkgconf
Bouteille	disponible (sur arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
post-install Homebrew	non défini
Service	aucun déclaré

faits du registre

Détails de la base source

Source Database	Homebrew formula API
Tap	homebrew/core
Full Name	mrbayes
Version Scheme	0
Revision	0
Head Version	HEAD
Bottle Stable Root URL	https://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecated	no
Disabled	no
Keg Only	no
URL Keys	head stable

correspondances dans les bases sources

Autres enregistrements de gestionnaires de paquets

Les correspondances proviennent d’index externes de gestionnaires de paquets et restent séparées des liens de paquets Automic Vault locaux.

Debian apt95%

mrbayes 3.2.7a-7+b1

Bayesian Inference of Phylogeny

http://mrbayes.csit.fsu.edu/

sudo apt install mrbayes

Section: science
Architecture: amd64
Source Package: mrbayes
3 Dépendances
1 dépendances optionnelles
normalized package name match
Correspondance par : Mrbayes

Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: mrbayes from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz

Debian apt95%

mrbayes-doc 3.2.7a-7

Bayesian Inference of Phylogeny - manual

http://mrbayes.csit.fsu.edu/

sudo apt install mrbayes-doc

Section: doc
Architecture: all
Source Package: mrbayes
normalized package name match
Correspondance par : Mrbayes

Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: mrbayes-doc from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz

Debian apt95%

mrbayes-mpi 3.2.7a-7+b1

Bayesian Inference of Phylogeny - mpi version

http://mrbayes.csit.fsu.edu/

sudo apt install mrbayes-mpi

Section: science
Architecture: amd64
Source Package: mrbayes
5 Dépendances
2 dépendances optionnelles
normalized package name match
Correspondance par : Mrbayes

Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: mrbayes-mpi from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz

Nix95%

mrbayes

nix profile install nixpkgs#mrbayes

normalized package name match
Correspondance par : Mrbayes

nixpkgs package indexes · api.github.com · nixpkgs package indexes: pkgs/by-name/mr/mrbayes/package.nix from https://api.github.com/repos/NixOS/nixpkgs/git/trees/master?recursive=1

Ubuntu apt95%

mrbayes 3.2.7a-7build2

Bayesian Inference of Phylogeny

http://mrbayes.csit.fsu.edu/

sudo apt install mrbayes

Section: universe/math
Architecture: amd64
3 Dépendances
1 dépendances optionnelles
normalized package name match
Correspondance par : Mrbayes

Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: mrbayes from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz

Ubuntu apt95%

mrbayes-doc 3.2.7a-7build2

Bayesian Inference of Phylogeny - manual

http://mrbayes.csit.fsu.edu/

sudo apt install mrbayes-doc

Section: universe/doc
Architecture: all
Source Package: mrbayes
normalized package name match
Correspondance par : Mrbayes

Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: mrbayes-doc from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz

Ubuntu apt95%

mrbayes-mpi 3.2.7a-7build2

Bayesian Inference of Phylogeny - mpi version

http://mrbayes.csit.fsu.edu/

sudo apt install mrbayes-mpi

Section: universe/science
Architecture: amd64
Source Package: mrbayes
5 Dépendances
2 dépendances optionnelles
normalized package name match
Correspondance par : Mrbayes

Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: mrbayes-mpi from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz

winget95%

NBIS.MrBayes

winget install --id NBIS.MrBayes -e

normalized package name match
Correspondance par : Mrbayes

Windows Package Manager source index · cdn.winget.microsoft.com · Windows Package Manager source index: NBIS.MrBayes from https://cdn.winget.microsoft.com/cache/source.msix

graphe de paquets

Les liens viennent du graphe local de relations entre paquets, des suppléments, des dépendances, des correspondances d'écosystèmes et de l'appartenance aux hubs.

piste source

Généré depuis les données du dépôt

Cette page est servie par av-web depuis l'artéfact SQLite privé des paquets généré par scripts/generate-pkg-sqlite.py.

Combined YAML source

View the package source record on GitHub.

combined/mrbayes.yml

Sources utilisées

Geiger risk classifier
Nucleus package database
av.db category and tag curation
cross-ecosystem install command graph
curated package history
external package-manager database matches
package relationship graph
package version freshness
package-page enrichment

Installer mrbayes avec Homebrew, apt, Nix, winget

Commandes d'installation supplémentaires

macOS

Linux

Windows

Résumé du paquet

Liens du projet

Commandes et alias

Historique du projet et usages

Historique du projet

Modes d'utilisation

Sources

Niveau de risque : vert

Classificateur de risque

Pourquoi

Signaux

Comportement d'installation

Revue recommandée

Exécutables installés

Version et fraîcheur

Métadonnées du paquet

Détails de la base source

Autres enregistrements de gestionnaires de paquets

Liens internes de paquets

Hubs thématiques

Outils liés

Même workflow

Guides de sécurité des agents

Généré depuis les données du dépôt

Combined YAML source

Sources utilisées