Installation

Weitere Installationsbefehle

macOS

Homebrewverifiziert · 100%

brew install tabixpp

local Homebrew formula metadata

Linux

Debian aptverifiziert · 92%

sudo apt install tabix

Debian stable package indexes · tabix · Quelle: deb.debian.org

openSUSE zypperverifiziert · 92%

sudo zypper install tabix

openSUSE Tumbleweed package metadata · tabix · Quelle: download.opensuse.org

Überblick

Paketzusammenfassung

C++ wrapper to tabix indexer

Projektlinks

Befehle und Aliase

tabix++

Verlauf

Projektgeschichte und Nutzung

tabixpp is a small C++ wrapper around tabix for opening and jumping through tabix-indexed genomics files.

Projektgeschichte

The README identifies tabixpp as a wrapper around the tabix project and names Erik Garrison as author. GitHub repository metadata records the public repository creation in May 2011.

Adoptionsgeschichte

The project is modest but durable: GitHub releases include an initial tagged release in 2015, a Debian-packaging point release in 2019, and later maintenance releases through 2023. The Homebrew input records packaging in Homebrew and maps related distro packages to tabix on Debian, Ubuntu, and openSUSE.

Wie es verwendet wird

The README emphasizes building with the htslib submodule and testing with make. Its value is in C++ code that wants a smaller abstraction over tabix-indexed files rather than invoking tabix directly.

Warum Paket-Nerds sich dafür interessieren

Package maintainers care because tabixpp is a thin compatibility layer in bioinformatics dependency graphs: it pulls in htslib-style native dependencies such as libcurl, zlib, and liblzma, and it is often packaged to satisfy genomics tools that expect the wrapper.

Zeitleiste

2011: The public GitHub repository was created.
2015: GitHub releases show v1.0.0 as the initial tagged release.
2019: GitHub releases show v1.1.0 as a point release for Debian packaging.
2023: GitHub releases show v1.1.2 published as minor updates.

Related projects

The README links tabix, htslib, libcurl, zlib, and liblzma as related projects or dependencies.

Quellen

https://api.github.com/repos/vcflib/tabixpp
https://api.github.com/repos/vcflib/tabixpp/releases
https://github.com/vcflib/tabixpp#readme
input.source_facts.package-manager

Sicherheitslage

Risikostufe: grün

narrow executable package without higher-risk signals.

Risikoklassifikator

grün Risiko · niedrig Konfidenz · appliance

Warum

narrow executable package without higher-risk signals

Signale

metadata:no-higher-risk-signals

Installationsverhalten

In den Formelmetadaten ist kein Homebrew-Post-install-Hook erfasst.
Homebrew-Bottle-Metadaten sind für 6 Plattformziele verfügbar.
Installiert mit 2 Laufzeitabhängigkeiten.

Empfohlene Prüfung

Prüfe vor unbeaufsichtigter Agent-Nutzung, ob das Tool Klartext-Credentials liest, Remote-Zustand schreibt, Artefakte veröffentlicht oder Plugins ausführt.

Executables

Installierte Executables

Befehl	Art	Sichtbarkeit	Hinweis
`tabix++`	cli	globales Executable

Aktualität

Version und Aktualität

Diese Signale trennen das Alter der Seitengenerierung, Aktivität des Paketmanagers und Upstream-Release-Vergleich. Versionsrückstand wird nur gemeldet, wenn eine Evidenz-URL und vergleichbare Versionen vorhanden sind.

Seite generiert2026-07-10

Manager-Version1.1.2

Manager aktualisiert2026-06-25

lokale DatenOK

Upstreamaktuell

neueste erkannte Versionv1.1.2

https://github.com/vcflib/tabixpp

OKEs wurden keine Aktualitätswarnungen generiert.

Installationsmetadaten

Paketmetadaten

Paketschlüssel	brew:tabixpp
Version	1.1.2
Paketmanager	Homebrew
Paketmanager-Seite	https://formulae.brew.sh/formula/tabixpp
Homepage	https://github.com/vcflib/tabixpp
Repository	https://github.com/vcflib/tabixpp
Upstream-Dokumentation	https://github.com/vcflib/tabixpp#readme
Lizenz	MIT
Quellarchiv	https://github.com/vcflib/tabixpp/archive/refs/tags/v1.1.2.tar.gz
Zuletzt aktualisiert	2026-06-25T13:38:09+02:00
Pulse	updated
Abhängigkeiten	htslib, xz
Bottle	verfügbar (auf arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
Homebrew post-install	nicht definiert
Dienst	keiner deklariert

Registry-Fakten

Details aus der Quelldatenbank

Source Database	Homebrew formula API
Tap	homebrew/core
Full Name	tabixpp
Version Scheme	0
Revision	1
Bottle Stable Root URL	https://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecated	no
Disabled	no
Keg Only	no
URL Keys	stable

Source-Datenbank-Treffer

Andere Paketmanager-Einträge

Treffer stammen aus externen Paketmanager-Indizes und bleiben von lokalen Automic-Vault-Paketlinks getrennt.

Debian apt92%

tabix 1.21+ds-1

generic indexer for TAB-delimited genome position files

https://github.com/samtools/htslib

sudo apt install tabix

Section: science
Architecture: amd64
Source Package: htslib
6 Abhängigkeiten
installed executable or alias match
Abgeglichen nach: Tabix

Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: tabix from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz

Ubuntu apt92%

tabix 1.19+ds-1.1build3

generic indexer for TAB-delimited genome position files

https://github.com/samtools/htslib

sudo apt install tabix

Section: universe/science
Architecture: amd64
Source Package: htslib
6 Abhängigkeiten
installed executable or alias match
Abgeglichen nach: Tabix

Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: tabix from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz

zypper92%

tabix 1.21-1.3

Generic indexer for TAB-delimited genome position files from the HTSlib project

https://github.com/samtools/htslib/

sudo zypper install tabix

License: MIT
Category: Productivity/Scientific/Other
Architecture: x86_64
Source Package: libhts
10 Abhängigkeiten
1 stellt bereit
installed executable or alias match
Abgeglichen nach: Tabix

openSUSE Tumbleweed package metadata · download.opensuse.org · openSUSE Tumbleweed package metadata: tabix from https://download.opensuse.org/tumbleweed/repo/oss/repodata/be8d3611d25469107f32075a1697e69ec57a2b850b42348a658cc671ad5ec2b50760d02c3e59524d50da9a11d5be799bdaffba2e166e8ca8858512e3c0bd665d-primary.xml.zst

Paketgraph

Links stammen aus dem lokalen Paketbeziehungsgraph, Ergänzungen, Abhängigkeitskanten, Ecosystem-Matches und Paket-Hub-Mitgliedschaft.

Quellspur

Aus Repository-Daten generiert

Diese Seite wird von av-web aus dem privaten Paket-SQLite-Artefakt bereitgestellt, das scripts/generate-pkg-sqlite.py erstellt.

Combined YAML source

View the package source record on GitHub.

combined/tabixpp.yml

Verwendete Quellen

Geiger risk classifier
Nucleus package database
av.db category and tag curation
cross-ecosystem install command graph
curated package history
external package-manager database matches
package relationship graph
package version freshness
package-page enrichment

tabixpp mit Homebrew, apt, zypper installieren