Automic Vault
brew-Paketinformationen
Prüfe Installationswege, Executables, Metadaten und Sicherheitshinweise für samtools in AI-Agent-Workflows.
Installation
sudo av install brew:samtoolsbrew install samtools
local Homebrew formula metadata
sudo port install samtools
MacPorts ports tree · science/samtools/Portfile · Quelle: api.github.com
sudo apt install samtools
Debian stable package indexes · samtools · Quelle: deb.debian.org
sudo dnf install samtools
Fedora Rawhide package metadata · samtools · Quelle: dl.fedoraproject.org
nix profile install nixpkgs#samtools
nixpkgs package indexes · pkgs/by-name/sa/samtools/package.nix · Quelle: api.github.com
sudo zypper install samtools
openSUSE Tumbleweed package metadata · samtools · Quelle: download.opensuse.org
Überblick
Automic Vault veröffentlicht paketspezifische Installationswege, Executable-Fakten und Sicherheitsmetadaten für samtools aus lokalen Paketdaten.
Tools for manipulating next-generation sequencing data
Sicherheitslage
narrow executable package without higher-risk signals.
green Risiko · low Konfidenz · appliance
Prüfe vor unbeaufsichtigter Agent-Nutzung, ob das Tool Klartext-Credentials liest, Remote-Zustand schreibt, Artefakte veröffentlicht oder Plugins ausführt.
Executables
| Befehl | Art | Sichtbarkeit | Hinweis |
|---|---|---|---|
ace2sam | cli | global executable | |
blast2sam.pl | cli | global executable | |
bowtie2sam.pl | cli | global executable | |
export2sam.pl | cli | global executable | |
fasta-sanitize.pl | cli | global executable | |
interpolate_sam.pl | cli | global executable | |
maq2sam-long | cli | global executable | |
maq2sam-short | cli | global executable | |
md5fa | cli | global executable | |
md5sum-lite | cli | global executable | |
novo2sam.pl | cli | global executable | |
plot-ampliconstats | cli | global executable | |
plot-bamstats | cli | global executable | |
psl2sam.pl | cli | global executable | |
sam2vcf.pl | cli | global executable | |
samtools | cli | global executable | |
samtools.pl | cli | global executable | |
seq_cache_populate.pl | cli | global executable | |
soap2sam.pl | cli | global executable | |
wgsim | cli | global executable | |
wgsim_eval.pl | cli | global executable | |
zoom2sam.pl | cli | global executable |
Aktualität
Diese Signale trennen das Alter der Seitengenerierung, Aktivität des Paketmanagers und Upstream-Release-Vergleich. Versionsrückstand wird nur gemeldet, wenn eine Evidenz-URL und vergleichbare Versionen vorhanden sind.
https://github.com/samtools/samtools
Installationsmetadaten
| Paketschlüssel | brew:samtools |
|---|---|
| Version | 1.23.1 |
| Paketmanager | Homebrew |
| Paketmanager-Seite | https://formulae.brew.sh/formula/samtools |
| Homepage | https://www.htslib.org/ |
| Repository | https://github.com/samtools/samtools |
| Upstream-Dokumentation | https://www.htslib.org/ |
| Lizenz | MIT |
| Quellarchiv | https://github.com/samtools/samtools/releases/download/1.23.1/samtools-1.23.1.tar.bz2 |
| Aktualisiert | 2026-03-18T18:10:04Z |
| Pulse | updated |
| Abhängigkeiten | htslib |
| Von macOS bereitgestellte Bibliotheken | ncurses |
| Bottle | verfügbar (arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux) |
| Homebrew post-install | nicht definiert |
| Dienst | keiner deklariert |
Quellspur
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