Automic Vault

brew-Paketinformationen

bioperl installieren

Prüfe Installationswege, Executables, Metadaten und Sicherheitshinweise für bioperl in AI-Agent-Workflows.

Installationsbefehl Sicherheitshinweise

Installation

Mit Automic Vault installieren

Automic Vault
AV herunterladen 
sudo av install brew:bioperl

macOS

Homebrew verifiziert · 100%
brew install bioperl

local Homebrew formula metadata

Linux

Debian apt verifiziert · 92%
sudo apt install bioperl

Debian stable package indexes · bioperl · Quelle: deb.debian.org

Plattformhinweise

  • Es waren keine paketspezifischen Plattformhinweise vorhanden.

Überblick

Paketzusammenfassung

Automic Vault veröffentlicht paketspezifische Installationswege, Executable-Fakten und Sicherheitsmetadaten für bioperl aus lokalen Paketdaten.

Befehle und Aliase

  • bp_aacomp
  • bp_bioflat_index
  • bp_biogetseq
  • bp_dbsplit
  • bp_extract_feature_seq
  • bp_fastam9_to_table
  • bp_fetch
  • bp_filter_search
  • bp_find-blast-matches
  • bp_gccalc
  • bp_genbank2gff3
  • bp_index
  • bp_local_taxonomydb_query
  • bp_make_mrna_protein
  • bp_mask_by_search
  • bp_mrtrans
  • bp_mutate
  • bp_nexus2nh
  • bp_nrdb
  • bp_oligo_count
  • bp_process_gadfly
  • bp_process_sgd
  • bp_revtrans-motif
  • bp_search2alnblocks
  • bp_search2gff
  • bp_search2table
  • bp_search2tribe
  • bp_seq_length
  • bp_seqconvert
  • bp_seqcut
  • bp_seqpart
  • bp_seqret

Quellzusammenfassung

Perl tools for bioinformatics, genomics and life science

Sicherheitslage

Risikostufe: green

narrow executable package without higher-risk signals.

Risikoklassifikator

green Risiko · low Konfidenz · appliance

Warum

  • narrow executable package without higher-risk signals

Signale

  • metadata:no-higher-risk-signals

Installationsverhalten

  • No Homebrew post-install hook is recorded in formula metadata.
  • Homebrew bottle metadata is available for 6 platform targets.
  • Build-Metadaten listen 1 Build-Abhängigkeiten.

Empfohlene Prüfung

Prüfe vor unbeaufsichtigter Agent-Nutzung, ob das Tool Klartext-Credentials liest, Remote-Zustand schreibt, Artefakte veröffentlicht oder Plugins ausführt.

Executables

Installierte Executables

BefehlArtSichtbarkeitHinweis
bp_aacompcliglobal executable
bp_bioflat_indexcliglobal executable
bp_biogetseqcliglobal executable
bp_dbsplitcliglobal executable
bp_extract_feature_seqcliglobal executable
bp_fastam9_to_tablecliglobal executable
bp_fetchcliglobal executable
bp_filter_searchcliglobal executable
bp_find-blast-matchescliglobal executable
bp_gccalccliglobal executable
bp_genbank2gff3cliglobal executable
bp_indexcliglobal executable
bp_local_taxonomydb_querycliglobal executable
bp_make_mrna_proteincliglobal executable
bp_mask_by_searchcliglobal executable
bp_mrtranscliglobal executable
bp_mutatecliglobal executable
bp_nexus2nhcliglobal executable
bp_nrdbcliglobal executable
bp_oligo_countcliglobal executable
bp_process_gadflycliglobal executable
bp_process_sgdcliglobal executable
bp_revtrans-motifcliglobal executable
bp_search2alnblockscliglobal executable
bp_search2gffcliglobal executable
bp_search2tablecliglobal executable
bp_search2tribecliglobal executable
bp_seq_lengthcliglobal executable
bp_seqconvertcliglobal executable
bp_seqcutcliglobal executable
bp_seqpartcliglobal executable
bp_seqretcliglobal executable
bp_seqretsplitcliglobal executable
bp_split_seqcliglobal executable
bp_sreformatcliglobal executable
bp_taxid4speciescliglobal executable
bp_taxonomy2treecliglobal executable
bp_translate_seqcliglobal executable
bp_tree2pagcliglobal executable
bp_unflatten_seqcliglobal executable

Aktualität

Version und Aktualität

Diese Signale trennen das Alter der Seitengenerierung, Aktivität des Paketmanagers und Upstream-Release-Vergleich. Versionsrückstand wird nur gemeldet, wenn eine Evidenz-URL und vergleichbare Versionen vorhanden sind.

Seite generiert2026-05-26
Manager-Version1.7.8
Manager aktualisiert2026-04-20
lokale Datenok
Upstreamnot checked
neueste erkannte Versionnicht erkannt

https://bioperl.org

  • info Release/tag comparison is only available for GitHub repositories. https://bioperl.org none Konfidenz

Installationsmetadaten

Paketmetadaten

Paketschlüsselbrew:bioperl
Version1.7.8
PaketmanagerHomebrew
Paketmanager-Seitehttps://formulae.brew.sh/formula/bioperl
Homepagehttps://bioperl.org
Upstream-Dokumentationhttps://bioperl.org
LizenzArtistic-1.0-Perl OR GPL-1.0-or-later
Quellarchivhttps://cpan.metacpan.org/authors/id/C/CJ/CJFIELDS/BioPerl-1.7.8.tar.gz
Aktualisiert2026-04-20T03:46:02Z
Pulseupdated
Build-Abhängigkeitenpkgconf
Von macOS bereitgestellte Bibliothekenexpat, libxml2, perl
Bottleverfügbar (arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
Homebrew post-installnicht definiert
Dienstkeiner deklariert

Paketgraph

Links stammen aus dem lokalen Paketbeziehungsgraph, Ergänzungen, Abhängigkeitskanten, Ecosystem-Matches und Paket-Hub-Mitgliedschaft.

Verwandt

  • pkgconfBuild dependency declared by Homebrew.
  • abricatePopular package that depends on this formula.

Auch verfügbar über

  • Es wurde kein Cross-Ecosystem-Äquivalent erfasst.

Paket-Hubs

  • Es wurde keine Paket-Hub-Mitgliedschaft generiert.

Quellspur

Aus Repository-Daten generiert

Diese Seite wird von scripts/generate-pkg-pages.py geschrieben. Deployments verweigern die Veröffentlichung, wenn www/pkg/ gegenüber lokalen Paketdaten veraltet ist.

Verwendete Quellen

  • Geiger risk classifier
  • Nucleus package database
  • cross-ecosystem install command graph
  • package relationship graph
  • package version freshness
  • package-page enrichment