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brew

Installer seqtk avec Homebrew, apt, Nix

Consultez les chemins d'installation, exécutables, métadonnées et notes de sécurité de seqtk pour les workflows d'agents IA.

Commande d'installationNotes de sécurité

installation

Commandes d'installation supplémentaires

macOS

Homebrewvérifié · 100%
brew install seqtk

local Homebrew formula metadata

Linux

Debian aptvérifié · 92%
sudo apt install seqtk

Debian stable package indexes · seqtk · Source: deb.debian.org

Nixvérifié · 92%
nix profile install nixpkgs#seqtk

nixpkgs package indexes · pkgs/by-name/se/seqtk/package.nix · Source: api.github.com

aperçu

Résumé du paquet

Toolkit for processing sequences in FASTA/Q formats

Commandes et alias

  • seqtk

posture de sécurité

Niveau de risque : vert

narrow executable package without higher-risk signals.

Classificateur de risque

risque vert · confiance faible · appliance

Pourquoi

  • narrow executable package without higher-risk signals

Signaux

  • metadata:no-higher-risk-signals

Comportement d'installation

  • Aucun hook post-install Homebrew n’est enregistré dans les métadonnées de formule.
  • Les métadonnées de bottle Homebrew sont disponibles pour 6 plateformes.

Revue recommandée

Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.

exécutables

Exécutables installés

CommandeTypeExpositionNote
seqtkcliexécutable global

fraîcheur

Version et fraîcheur

Ces signaux séparent l'âge de génération de la page, l'activité du gestionnaire de paquets et la comparaison avec les versions amont. Un retard de version n'est signalé que lorsqu'une URL de preuve et des versions comparables sont présentes.

page générée2026-07-08
version du gestionnaire1.5
gestionnaire mis à jour2026-06-14
données localesOK
amontà jour
dernière version détectéev1.5

https://github.com/lh3/seqtk

  • OKAucun avertissement de fraîcheur n'a été généré.

métadonnées d'installation

Métadonnées du paquet

Clé du paquetbrew:seqtk
Version1.5
Gestionnaire de paquetsHomebrew
Page du gestionnaire de paquetshttps://formulae.brew.sh/formula/seqtk
Page d'accueilhttps://github.com/lh3/seqtk
Dépôthttps://github.com/lh3/seqtk
Docs amonthttps://github.com/lh3/seqtk#readme
LicenceMIT
Archive sourcehttps://github.com/lh3/seqtk/archive/refs/tags/v1.5.tar.gz
Dernière mise à jour2026-06-14T15:13:49+02:00
Pulseupdated
Bouteilledisponible (sur arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
post-install Homebrewnon défini
Serviceaucun déclaré

faits du registre

Détails de la base source

Source DatabaseHomebrew formula API
Taphomebrew/core
Full Nameseqtk
Version Scheme0
Revision0
Bottle Stable Root URLhttps://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecatedno
Disabledno
Keg Onlyno
URL Keys
  • stable

correspondances dans les bases sources

Autres enregistrements de gestionnaires de paquets

Les correspondances proviennent d’index externes de gestionnaires de paquets et restent séparées des liens de paquets Automic Vault locaux.

Debian apt95%

seqtk 1.4-2

Fast and lightweight tool for processing sequences in the FASTA or FASTQ format

https://github.com/lh3/seqtk

sudo apt install seqtk
  • Section: science
  • Architecture: amd64
  • 2 Dépendances
  • normalized package name match
  • Correspondance par : Seqtk
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: seqtk from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz
Nix95%

seqtk

nix profile install nixpkgs#seqtk
  • normalized package name match
  • Correspondance par : Seqtk
nixpkgs package indexes · api.github.com · nixpkgs package indexes: pkgs/by-name/se/seqtk/package.nix from https://api.github.com/repos/NixOS/nixpkgs/git/trees/master?recursive=1
Ubuntu apt95%

seqtk 1.4-2

Fast and lightweight tool for processing sequences in the FASTA or FASTQ format

https://github.com/lh3/seqtk

sudo apt install seqtk
  • Section: universe/science
  • Architecture: amd64
  • 2 Dépendances
  • normalized package name match
  • Correspondance par : Seqtk
Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: seqtk from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz

graphe de paquets

Les liens viennent du graphe local de relations entre paquets, des suppléments, des dépendances, des correspondances d'écosystèmes et de l'appartenance aux hubs.

Même workflow

  • seqkitShares av.db curated category or tags: bioinformatics, cli, fasta, fastq, science.
  • hmmerShares av.db curated category or tags: bioinformatics, cli, science, sequence-analysis.
  • mmseqs2Shares av.db curated category or tags: bioinformatics, cli, science, sequence-analysis.
  • any2fastaShares av.db curated category or tags: bioinformatics, cli, fasta, science.
  • fastpShares av.db curated category or tags: bioinformatics, cli, fastq, science.
  • fastq-toolsShares av.db curated category or tags: bioinformatics, cli, fastq, science.

piste source

Généré depuis les données du dépôt

Cette page est servie par av-web depuis l'artéfact SQLite privé des paquets généré par scripts/generate-pkg-sqlite.py.

Sources utilisées

  • Geiger risk classifier
  • Nucleus package database
  • av.db category and tag curation
  • cross-ecosystem install command graph
  • external package-manager database matches
  • package relationship graph
  • package version freshness
  • package-page enrichment