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brew

Installer dcm2niix avec Homebrew, apt, dnf, MacPorts, Nix

Consultez les chemins d'installation, exécutables, métadonnées et notes de sécurité de dcm2niix pour les workflows d'agents IA.

installation

Commandes d'installation supplémentaires

macOS

Homebrewvérifié · 100%
brew install dcm2niix

local Homebrew formula metadata

MacPortsvérifié · 94%
sudo port install dcm2niix

MacPorts ports tree · science/dcm2niix/Portfile · Source: api.github.com

Linux

Debian aptvérifié · 92%
sudo apt install dcm2niix

Debian stable package indexes · dcm2niix · Source: deb.debian.org

Fedora dnfvérifié · 92%
sudo dnf install dcm2niix

Fedora Rawhide package metadata · dcm2niix · Source: dl.fedoraproject.org

Nixvérifié · 92%
nix profile install nixpkgs#dcm2niix

nixpkgs package indexes · pkgs/by-name/dc/dcm2niix/package.nix · Source: api.github.com

aperçu

Résumé du paquet

DICOM to NIfTI converter

historique

Historique du projet et usages

dcm2niix is a command-line DICOM-to-NIfTI converter for neuroimaging data. The official README frames the problem plainly: medical imaging devices usually save DICOM, while many scientific tools expect the simpler NIfTI format.

Historique du projet

The GitHub repository was created in 2014 and hosts developmental source code, while stable compiled builds are distributed through GitHub releases and MRIcroGL. The project also documents a NITRC wiki/manual lineage under the dcm2nii name, with dcm2nii listed as the deprecated predecessor for older images and dcm2niix positioned as the modern converter.

Historique d'adoption

dcm2niix became central to neuroimaging data conversion because it handles DICOM vendor variation, writes NIfTI outputs, and can generate BIDS sidecar JSON. The official README explicitly calls it a core dependency of BIDS converters and lists many wrappers, research pipelines, GUI tools, and platforms that invoke it.

Modes d'utilisation

Typical package-manager usage is a simple conversion command against a DICOM folder, optionally selecting output directory, filename format, gzip compression, anonymized BIDS sidecars, and vendor-specific conversion behavior. The CLI also has a defaults file mode and can use pigz for faster compression when available.

Pourquoi les passionnés de paquets s'y intéressent

dcm2niix is significant because it is the boring executable underneath a large amount of modern neuroimaging workflow automation. Packagers care about it because one small binary unlocks reproducible import into NIfTI and BIDS-oriented pipelines across Linux, macOS, and Windows.

Chronologie

  • 2014: Official GitHub repository created.
  • 2016: README cites the DICOM-to-NIfTI conversion methods paper by Li, Morgan, Ashburner, Smith, and Rorden.
  • 2010s-2020s: README documents adoption by many BIDS converters and neuroimaging pipelines.
  • 2026: Official GitHub API metadata shows repository activity continuing into June 2026.

Related projects

  • The README names dcm2nii as the deprecated predecessor and MRIcroGL as a distribution path. It also links dcm2niix to BIDS converters and many neuroimaging tools that shell out to the converter.

posture de sécurité

Aucune couverture d'outil protégé trouvée pour le moment

Aucun manifest local de gestion des secrets correspondant n'a été trouvé pour dcm2niix. Les métadonnées de paquet Nucleus restent publiées ici afin que la couverture future dispose d'une URL stable.

Comportement d'installation

  • Aucun hook post-install Homebrew n’est enregistré dans les métadonnées de formule.
  • Les métadonnées de bottle Homebrew sont disponibles pour 6 plateformes.
  • Les métadonnées de compilation listent 1 dépendances de compilation.

Revue recommandée

Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.

exécutables

Exécutables installés

CommandeTypeExpositionNote
dcm2niixcliexécutable global

fraîcheur

Version et fraîcheur

Ces signaux séparent l'âge de génération de la page, l'activité du gestionnaire de paquets et la comparaison avec les versions amont. Un retard de version n'est signalé que lorsqu'une URL de preuve et des versions comparables sont présentes.

page générée2026-07-08
version du gestionnaire1.0.20260416
gestionnaire mis à jour2026-05-07
données localesOK
amontà jour
dernière version détectéev1.0.20260416

https://github.com/rordenlab/dcm2niix

  • OKAucun avertissement de fraîcheur n'a été généré.

métadonnées d'installation

Métadonnées du paquet

Clé du paquetbrew:dcm2niix
Version1.0.20260416
Gestionnaire de paquetsHomebrew
Page du gestionnaire de paquetshttps://formulae.brew.sh/formula/dcm2niix
Page d'accueilhttps://www.nitrc.org/plugins/mwiki/index.php/dcm2nii:MainPage
Dépôthttps://github.com/rordenlab/dcm2niix
Docs amonthttps://github.com/rordenlab/dcm2niix/blob/master/docs/source/dcm2niix.rst
LicenceBSD-3-Clause
Archive sourcehttps://github.com/rordenlab/dcm2niix/archive/refs/tags/v1.0.20260416.tar.gz
Dernière mise à jour2026-05-07T20:43:44Z
Pulseupdated
Dépendances de compilationcmake
Bouteilledisponible (sur arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
post-install Homebrewnon défini
Serviceaucun déclaré

faits du registre

Détails de la base source

Source DatabaseHomebrew formula API
Taphomebrew/core
Full Namedcm2niix
Version Scheme1
Revision0
Head VersionHEAD
Bottle Stable Root URLhttps://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecatedno
Disabledno
Keg Onlyno
URL Keys
  • head
  • stable

correspondances dans les bases sources

Autres enregistrements de gestionnaires de paquets

Les correspondances proviennent d’index externes de gestionnaires de paquets et restent séparées des liens de paquets Automic Vault locaux.

Debian apt95%

dcm2niix 1.0.20241211-1

next generation DICOM to NIfTI converter

https://github.com/rordenlab/dcm2niix

sudo apt install dcm2niix
  • Section: science
  • Architecture: amd64
  • 6 Dépendances
  • 1 dépendances optionnelles
  • normalized package name match
  • Correspondance par : Dcm2niix
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: dcm2niix from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz
Nix95%

dcm2niix

nix profile install nixpkgs#dcm2niix
  • normalized package name match
  • Correspondance par : Dcm2niix
nixpkgs package indexes · api.github.com · nixpkgs package indexes: pkgs/by-name/dc/dcm2niix/package.nix from https://api.github.com/repos/NixOS/nixpkgs/git/trees/master?recursive=1
Ubuntu apt95%

dcm2niix 1.0.20220720-1build1

next generation DICOM to NIfTI converter

https://github.com/rordenlab/dcm2niix

sudo apt install dcm2niix
  • Section: universe/science
  • Architecture: amd64
  • 6 Dépendances
  • 1 dépendances optionnelles
  • normalized package name match
  • Correspondance par : Dcm2niix
Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: dcm2niix from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz
dnf95%

dcm2niix 1.0.20260416-2.fc45

DICOM to NIfTI converter

https://www.nitrc.org/plugins/mwiki/index.php/dcm2nii:MainPage

sudo dnf install dcm2niix
  • License: BSD-2-Clause AND BSD-3-Clause AND FSFAP AND LicenseRef-Fedora-Public-Domain AND MIT
  • Category: Unspecified
  • Architecture: x86_64
  • Source Package: dcm2niix
  • 10 Dépendances
  • 2 fournit
  • normalized package name match
  • Correspondance par : Dcm2niix
Fedora Rawhide package metadata · dl.fedoraproject.org · Fedora Rawhide package metadata: dcm2niix from https://dl.fedoraproject.org/pub/fedora/linux/development/rawhide/Everything/x86_64/os/repodata/e5ca8ce900cd68f5419e1c39ae517343100b306336cbaeb70a3c153121d95094-primary.xml.zst
dnf95%

python3-dcm2niix 1.0.20260416-2.fc45

Thin wrapper around dcm2niix binary

https://www.nitrc.org/plugins/mwiki/index.php/dcm2nii:MainPage

sudo dnf install python3-dcm2niix
  • License: BSD-2-Clause
  • Category: Unspecified
  • Architecture: noarch
  • Source Package: dcm2niix
  • 2 Dépendances
  • 5 fournit
  • normalized package name match
  • Correspondance par : Dcm2niix
Fedora Rawhide package metadata · dl.fedoraproject.org · Fedora Rawhide package metadata: python3-dcm2niix from https://dl.fedoraproject.org/pub/fedora/linux/development/rawhide/Everything/x86_64/os/repodata/e5ca8ce900cd68f5419e1c39ae517343100b306336cbaeb70a3c153121d95094-primary.xml.zst
MacPorts95%

dcm2niix

sudo port install dcm2niix
  • normalized package name match
  • Correspondance par : Dcm2niix
MacPorts ports tree · api.github.com · MacPorts ports tree: science/dcm2niix/Portfile from https://api.github.com/repos/macports/macports-ports/git/trees/master?recursive=1

piste source

Généré depuis les données du dépôt

Cette page est servie par av-web depuis l'artéfact SQLite privé des paquets généré par scripts/generate-pkg-sqlite.py.

Sources utilisées

  • Geiger risk classifier
  • Nucleus package database
  • av.db category and tag curation
  • cross-ecosystem install command graph
  • curated package history
  • external package-manager database matches
  • package relationship graph
  • package version freshness
  • package-page enrichment