Automic Vault
安装
sudo av install brew:samtoolsbrew install samtools
local Homebrew formula metadata
sudo port install samtools
MacPorts ports tree · science/samtools/Portfile · 来源: api.github.com
sudo apt install samtools
Debian stable package indexes · samtools · 来源: deb.debian.org
sudo dnf install samtools
Fedora Rawhide package metadata · samtools · 来源: dl.fedoraproject.org
nix profile install nixpkgs#samtools
nixpkgs package indexes · pkgs/by-name/sa/samtools/package.nix · 来源: api.github.com
sudo zypper install samtools
openSUSE Tumbleweed package metadata · samtools · 来源: download.opensuse.org
概览
Automic Vault 根据本地软件包数据发布 samtools 的安装路径、可执行文件事实和安全元数据。
Tools for manipulating next-generation sequencing data
安全态势
narrow executable package without higher-risk signals.
green 风险 · low 置信度 · appliance
在无人值守的代理使用前，请检查该工具是否读取明文凭据、写入远程状态、发布制品或调用插件。
可执行文件
| 命令 | 类型 | 暴露范围 | 备注 |
|---|---|---|---|
ace2sam | cli | global executable | |
blast2sam.pl | cli | global executable | |
bowtie2sam.pl | cli | global executable | |
export2sam.pl | cli | global executable | |
fasta-sanitize.pl | cli | global executable | |
interpolate_sam.pl | cli | global executable | |
maq2sam-long | cli | global executable | |
maq2sam-short | cli | global executable | |
md5fa | cli | global executable | |
md5sum-lite | cli | global executable | |
novo2sam.pl | cli | global executable | |
plot-ampliconstats | cli | global executable | |
plot-bamstats | cli | global executable | |
psl2sam.pl | cli | global executable | |
sam2vcf.pl | cli | global executable | |
samtools | cli | global executable | |
samtools.pl | cli | global executable | |
seq_cache_populate.pl | cli | global executable | |
soap2sam.pl | cli | global executable | |
wgsim | cli | global executable | |
wgsim_eval.pl | cli | global executable | |
zoom2sam.pl | cli | global executable |
新鲜度
这些信号区分页生成时间、软件包管理器活动和上游发布比较。只有存在证据 URL 和可比较版本时，才会提示版本落后。
https://github.com/samtools/samtools
安装元数据
| 软件包键 | brew:samtools |
|---|---|
| 版本 | 1.23.1 |
| 软件包管理器 | Homebrew |
| 软件包管理器页面 | https://formulae.brew.sh/formula/samtools |
| 主页 | https://www.htslib.org/ |
| 仓库 | https://github.com/samtools/samtools |
| 上游文档 | https://www.htslib.org/ |
| 许可证 | MIT |
| 源码归档 | https://github.com/samtools/samtools/releases/download/1.23.1/samtools-1.23.1.tar.bz2 |
| 更新 | 2026-03-18T18:10:04Z |
| Pulse | updated |
| 依赖 | htslib |
| macOS 提供的库 | ncurses |
| Bottle | 可用 (arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux) |
| Homebrew post-install | 未定义 |
| 服务 | 未声明 |
来源线索
此页面由 scripts/generate-pkg-pages.py 写入。如果 www/pkg/ 相对于本地软件包数据已过期，部署会拒绝发布。