macOS
Homebrew
已验证 · 100%
brew install bioperl
local Homebrew formula metadata
安装
使用 Automic Vault 安装
Automic Vault
sudo av install brew:bioperlLinux
Debian apt
已验证 · 92%
sudo apt install bioperl
Debian stable package indexes · bioperl · 来源: deb.debian.org
软件包管理器来源
平台说明
- 没有特定于此软件包的平台说明。
概览
软件包摘要
Automic Vault 根据本地软件包数据发布 bioperl 的安装路径、可执行文件事实和安全元数据。
主页
命令和别名
- bp_aacomp
- bp_bioflat_index
- bp_biogetseq
- bp_dbsplit
- bp_extract_feature_seq
- bp_fastam9_to_table
- bp_fetch
- bp_filter_search
- bp_find-blast-matches
- bp_gccalc
- bp_genbank2gff3
- bp_index
- bp_local_taxonomydb_query
- bp_make_mrna_protein
- bp_mask_by_search
- bp_mrtrans
- bp_mutate
- bp_nexus2nh
- bp_nrdb
- bp_oligo_count
- bp_process_gadfly
- bp_process_sgd
- bp_revtrans-motif
- bp_search2alnblocks
- bp_search2gff
- bp_search2table
- bp_search2tribe
- bp_seq_length
- bp_seqconvert
- bp_seqcut
- bp_seqpart
- bp_seqret
来源摘要
Perl tools for bioinformatics, genomics and life science
安全态势
风险级别：green
narrow executable package without higher-risk signals.
风险分类器
green 风险 · low 置信度 · appliance
原因
- narrow executable package without higher-risk signals
信号
- metadata:no-higher-risk-signals
安装行为
- No Homebrew post-install hook is recorded in formula metadata.
- Homebrew bottle metadata is available for 6 platform targets.
- 构建元数据列出 1 个构建依赖。
建议审查
在无人值守的代理使用前，请检查该工具是否读取明文凭据、写入远程状态、发布制品或调用插件。
可执行文件
已安装的可执行文件
| 命令 | 类型 | 暴露范围 | 备注 |
|---|---|---|---|
bp_aacomp | cli | global executable | |
bp_bioflat_index | cli | global executable | |
bp_biogetseq | cli | global executable | |
bp_dbsplit | cli | global executable | |
bp_extract_feature_seq | cli | global executable | |
bp_fastam9_to_table | cli | global executable | |
bp_fetch | cli | global executable | |
bp_filter_search | cli | global executable | |
bp_find-blast-matches | cli | global executable | |
bp_gccalc | cli | global executable | |
bp_genbank2gff3 | cli | global executable | |
bp_index | cli | global executable | |
bp_local_taxonomydb_query | cli | global executable | |
bp_make_mrna_protein | cli | global executable | |
bp_mask_by_search | cli | global executable | |
bp_mrtrans | cli | global executable | |
bp_mutate | cli | global executable | |
bp_nexus2nh | cli | global executable | |
bp_nrdb | cli | global executable | |
bp_oligo_count | cli | global executable | |
bp_process_gadfly | cli | global executable | |
bp_process_sgd | cli | global executable | |
bp_revtrans-motif | cli | global executable | |
bp_search2alnblocks | cli | global executable | |
bp_search2gff | cli | global executable | |
bp_search2table | cli | global executable | |
bp_search2tribe | cli | global executable | |
bp_seq_length | cli | global executable | |
bp_seqconvert | cli | global executable | |
bp_seqcut | cli | global executable | |
bp_seqpart | cli | global executable | |
bp_seqret | cli | global executable | |
bp_seqretsplit | cli | global executable | |
bp_split_seq | cli | global executable | |
bp_sreformat | cli | global executable | |
bp_taxid4species | cli | global executable | |
bp_taxonomy2tree | cli | global executable | |
bp_translate_seq | cli | global executable | |
bp_tree2pag | cli | global executable | |
bp_unflatten_seq | cli | global executable |
新鲜度
版本和新鲜度
这些信号区分页生成时间、软件包管理器活动和上游发布比较。只有存在证据 URL 和可比较版本时，才会提示版本落后。
页面生成时间2026-05-27
管理器版本1.7.8
管理器更新时间2026-04-20
本地数据ok
上游not checked
检测到的最新版本未检测到
- info Release/tag comparison is only available for GitHub repositories. https://bioperl.org none 置信度
安装元数据
软件包元数据
| 软件包键 | brew:bioperl |
|---|---|
| 版本 | 1.7.8 |
| 软件包管理器 | Homebrew |
| 软件包管理器页面 | https://formulae.brew.sh/formula/bioperl |
| 主页 | https://bioperl.org |
| 上游文档 | https://bioperl.org |
| 许可证 | Artistic-1.0-Perl OR GPL-1.0-or-later |
| 源码归档 | https://cpan.metacpan.org/authors/id/C/CJ/CJFIELDS/BioPerl-1.7.8.tar.gz |
| 更新 | 2026-04-20T03:46:02Z |
| Pulse | updated |
| 构建依赖 | pkgconf |
| macOS 提供的库 | expat, libxml2, perl |
| Bottle | 可用 (arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux) |
| Homebrew post-install | 未定义 |
| 服务 | 未声明 |
来源线索
由仓库数据生成
此页面由 scripts/generate-pkg-pages.py 写入。如果 www/pkg/ 相对于本地软件包数据已过期，部署会拒绝发布。
使用的来源
- Geiger risk classifier
- Nucleus package database
- cross-ecosystem install command graph
- package relationship graph
- package version freshness
- package-page enrichment