# Installer bioperl

Consultez les chemins d'installation, exécutables, métadonnées et notes de sécurité de bioperl pour les workflows d'agents IA.

## installation

```sh
sudo av install brew:bioperl
```

Commandes d'installation supplémentaires:

### macOS

- Homebrew (100%):

```sh
brew install bioperl
```

  Preuve: local Homebrew formula metadata

### Linux

- Debian apt (92%):

```sh
sudo apt install bioperl
```

  Preuve: Debian stable package indexes: bioperl from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz

## Faits du paquet

- **Clé du paquet:** brew:bioperl
- **Gestionnaire de paquets:** Homebrew
- **Page du gestionnaire de paquets:** <https://formulae.brew.sh/formula/bioperl>
- **Version:** 1.7.8
- **Résumé source:** Perl tools for bioinformatics, genomics and life science
- **Page d'accueil:** <https://bioperl.org>
- **Docs amont:** <https://bioperl.org>
- **Licence:** Artistic-1.0-Perl OR GPL-1.0-or-later
- **Archive source:** <https://cpan.metacpan.org/authors/id/C/CJ/CJFIELDS/BioPerl-1.7.8.tar.gz>
- **Mis à jour:** 2026-04-20T03:46:02Z
- **Source générée:** 2026-05-26T22:45:13+00:00

## exécutables

- bp_aacomp (cli)
- bp_bioflat_index (cli)
- bp_biogetseq (cli)
- bp_dbsplit (cli)
- bp_extract_feature_seq (cli)
- bp_fastam9_to_table (cli)
- bp_fetch (cli)
- bp_filter_search (cli)
- bp_find-blast-matches (cli)
- bp_gccalc (cli)
- bp_genbank2gff3 (cli)
- bp_index (cli)
- bp_local_taxonomydb_query (cli)
- bp_make_mrna_protein (cli)
- bp_mask_by_search (cli)
- bp_mrtrans (cli)
- bp_mutate (cli)
- bp_nexus2nh (cli)
- bp_nrdb (cli)
- bp_oligo_count (cli)
- bp_process_gadfly (cli)
- bp_process_sgd (cli)
- bp_revtrans-motif (cli)
- bp_search2alnblocks (cli)
- bp_search2gff (cli)
- bp_search2table (cli)
- bp_search2tribe (cli)
- bp_seq_length (cli)
- bp_seqconvert (cli)
- bp_seqcut (cli)
- bp_seqpart (cli)
- bp_seqret (cli)
- bp_seqretsplit (cli)
- bp_split_seq (cli)
- bp_sreformat (cli)
- bp_taxid4species (cli)
- bp_taxonomy2tree (cli)
- bp_translate_seq (cli)
- bp_tree2pag (cli)
- bp_unflatten_seq (cli)
- bp_aacomp (alias)
- bp_bioflat_index (alias)
- bp_biogetseq (alias)
- bp_dbsplit (alias)
- bp_extract_feature_seq (alias)
- bp_fastam9_to_table (alias)
- bp_fetch (alias)
- bp_filter_search (alias)
- bp_find-blast-matches (alias)
- bp_gccalc (alias)
- bp_genbank2gff3 (alias)
- bp_index (alias)
- bp_local_taxonomydb_query (alias)
- bp_make_mrna_protein (alias)
- bp_mask_by_search (alias)
- bp_mrtrans (alias)
- bp_mutate (alias)
- bp_nexus2nh (alias)
- bp_nrdb (alias)
- bp_oligo_count (alias)
- bp_process_gadfly (alias)
- bp_process_sgd (alias)
- bp_revtrans-motif (alias)
- bp_search2alnblocks (alias)
- bp_search2gff (alias)
- bp_search2table (alias)
- bp_search2tribe (alias)
- bp_seq_length (alias)
- bp_seqconvert (alias)
- bp_seqcut (alias)
- bp_seqpart (alias)
- bp_seqret (alias)
- bp_seqretsplit (alias)
- bp_split_seq (alias)
- bp_sreformat (alias)
- bp_taxid4species (alias)
- bp_taxonomy2tree (alias)
- bp_translate_seq (alias)
- bp_tree2pag (alias)
- bp_unflatten_seq (alias)

## Dépendances de compilation

- pkgconf

## Bibliothèques fournies par macOS

- expat
- libxml2
- perl

## Comportement d'installation

- hook post-installation: non défini
- Bouteille: disponible sur arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux

## fraîcheur

- page générée: 2026-05-26
- version du gestionnaire: 1.7.8
- gestionnaire mis à jour: 2026-04-20
- données locales: ok
- dépôt amont: https://bioperl.org
- info: Release/tag comparison is only available for GitHub repositories.

## Notes de sécurité

narrow executable package without higher-risk signals.

- **Risque Geiger:** green / low
- narrow executable package without higher-risk signals

## Liens liés

- [pkgconf](https://www.automicvault.com/pkg/brew/pkgconf/) - Build dependency declared by Homebrew.
- [abricate](https://www.automicvault.com/pkg/brew/abricate/) - Popular package that depends on this formula.

## Sources

- Nucleus package database
- Geiger risk classifier
- package-page enrichment
- package version freshness
- package relationship graph
- cross-ecosystem install command graph